3'-amino-N4-benzoyl-2',3'-dideoxycytidine-5'-monophosphate | 1093343-19-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 3'-amino-N4-benzoyl-2',3'-dideoxycytidine-5'-monophosphate
• 英文别名: 3'-amino-2',3'-dideoxy(N-benzoyl)cytidine-5'-monophosphate；[(2S,3S,5R)-3-amino-5-(4-benzamido-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate
• CAS: 1093343-19-1
• 化学式: C₁₆H₁₉N₄O₇P
• 分子量: 410.323
• InChiKey: WZRXJKQETWLFTM-OUCADQQQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.5
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  164
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (T-4)-[N-[6-[(2,5-二氧杂-1-吡咯烷基)氧基]-6-氧己基]-5-[[5-(4-甲氧基苯基)-2H-吡咯-2-]亚烷基-[κN]甲基]-2,4-二甲基-1H-吡咯-3-丙酰胺基-κN1]二氟硼 、 3'-amino-N4-benzoyl-2',3'-dideoxycytidine-5'-monophosphate 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 12.0h， 生成 [(2S,3S,5R)-5-(4-benzamido-2-oxopyrimidin-1-yl)-3-[6-[3-[2,2-difluoro-12-(4-methoxyphenyl)-4,6-dimethyl-1-aza-3-azonia-2-boranuidatricyclo[7.3.0.03,7]dodeca-3,5,7,9,11-pentaen-5-yl]propanoylamino]hexanoylamino]oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate
  参考文献：
  名称：

  3'-BODIPY 标记的核苷酸活性酯的合成和珠子上的化学引物延伸试验

  摘要：

  通过使用两种不同的 BODIPY 染料，针对胸腺嘧啶和胞嘧啶作为核碱基开发了 3'-荧光团标记的脱氧核苷 5'-单磷酸活性酯的液相合成。从各自的 2'-amino-2',3'-dideoxynucleoside-5'-monophosphate 开始，荧光 oxyazabenzotriazolides 可以在涉及标记和活化的一锅程序中制备。对一系列支持物的筛选导致对珠子进行化学引物延伸测定，通过光学读出原位检测目标 DNA 中的核碱基。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201000210