3'-O-t-Butyldimethylsilyl-5-pentyl-2'-deoxyuridine | 202993-47-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 3'-O-t-Butyldimethylsilyl-5-pentyl-2'-deoxyuridine
• 英文别名: 1-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-pentylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 202993-47-3
• 化学式: C₂₀H₃₆N₂O₅Si
• 分子量: 412.602
• InChiKey: UQLYIVDSGHUWFY-GVDBMIGSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.94
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.8
• 拓扑面积：
  88.1
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  咪唑 、 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-pentyl-2'-deoxyuridine 、 叔丁基二甲基氯硅烷 以 二氯甲烷 、 水 、 溶剂黄146 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以78.3%的产率得到3'-O-t-Butyldimethylsilyl-5-pentyl-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  Oligonucleotide analogs capable of passive cell membrane permeation

  摘要：

  本文披露了能够通过细胞膜进行被动扩散的寡核苷酸。这些寡核苷酸含有至少两个核苷酸残基，其在辛醇：水中的对数分布系数为约0.0-2.5，在水中的溶解度至少为0.001 μg/mL。在优选实施例中，要么至少80％的核苷酸间连接是非离子的，要么至少80％的碱基含有亲脂性烃基取代，或者两者的组合总和达到80％。这些寡核苷酸可以与标记结合并用于可视化细胞。

  公开号：

  US05633360A1

文献信息

• Oligonucleotide analogs capable of passive cell membrane permeation
  申请人：Gilead Sciences, Inc.

  公开号：US05633360A1

  公开（公告）日：1997-05-27

  Oligonucleotides that are capable of passive diffusion across cell membranes are disclosed. These oligonucleotides contain at least two nucleotide residues and show a log distribution coefficient in octanol:water of about 0.0-2.5 and a solubility in water of at least 0.001 .mu.g/mL. In preferred embodiments, either at least 80% of the internucleotide linkages are non-ionic, or at least 80% of the bases contain lipophilic hydrocarbyl substitutions, or a combination of these sums to 80%. These oligonucleotides may be conjugated to label and used to visualize cells.

  本文披露了能够通过细胞膜进行被动扩散的寡核苷酸。这些寡核苷酸含有至少两个核苷酸残基，其在辛醇：水中的对数分布系数为约0.0-2.5，在水中的溶解度至少为0.001 μg/mL。在优选实施例中，要么至少80％的核苷酸间连接是非离子的，要么至少80％的碱基含有亲脂性烃基取代，或者两者的组合总和达到80％。这些寡核苷酸可以与标记结合并用于可视化细胞。