[(2R,3S,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] 5-[6'-[5-[[(2R,3S,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxypentoxy]-3-oxospiro[2-benzofuran-1,9'-xanthene]-3'-yl]oxypentyl hydrogen phosphate | 1620166-48-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物
• 英文名称: [(2R,3S,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] 5-[6'-[5-[[(2R,3S,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxypentoxy]-3-oxospiro[2-benzofuran-1,9'-xanthene]-3'-yl]oxypentyl hydrogen phosphate
• CAS: 1620166-48-4
• 化学式: C₄₈H₅₆N₆O₁₉P₂
• 分子量: 1082.95
• InChiKey: ZWKQOVIPSDETGE-QDMGSNPFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.2
• 重原子数：
  75
• 可旋转键数：
  24
• 环数：
  9.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  342
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  19

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  在 三氟乙酸 作用下， 以 氯仿 为溶剂， 生成 [(2R,3S,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] 5-[6'-[5-[[(2R,3S,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxypentoxy]-3-oxospiro[2-benzofuran-1,9'-xanthene]-3'-yl]oxypentyl hydrogen phosphate
  参考文献：
  名称：

  Accumulation of supramolecular nanoparticles self-assembled from a bola-shaped cytidylic acid-appended fluorescein dye in cell nuclei

  摘要：

  观察到一种附有胞苷酸的染料自组装成的超分子纳米颗粒在细胞核内积累，而无需核定位标签。

  DOI：

  10.1039/c4cc03733b