COMBO | 1373213-88-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物
• 英文名称: COMBO
• 英文别名: 7,8-Didehydro-5,6,9,10-tetrahydrobenzo[8]annulene-3-carboxylic acid
• CAS: 1373213-88-7
• 化学式: C₁₃H₁₂O₂
• 分子量: 200.237
• InChiKey: IUOFSGUYBBDZQH-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  380.4±42.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.22±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.7
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  37.3
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  COMBO 、 5-(3-aminopropynyl)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyuridine 在 1-羟基苯并三唑 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.0h， 以65%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  2′-Deoxyuridine conjugated with a reactive monobenzocyclooctyne as a DNA building block for copper-free click-type postsynthetic modification of DNA

  摘要：

  DNA 中 2â²-脱氧尿苷的 5 位上连接有羧甲基单苯并环辛炔基团，通过使用远红外荧光叠氮化物探针，可以快速高效地进行无铜合成后修饰。标记后可观察到强烈的荧光强度增强。

  DOI：

  10.1039/c4cc02855d
• 作为产物：
  描述：

  2-methoxycarbonyl-5,6,9,10-tetrahydro-7,8-dehydro-benzocyclooctene 在 水 、 lithium hydroxide 作用下， 以 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 2.0h， 以92%的产率得到COMBO
  参考文献：
  名称：

  用于快速无铜点击反应的非氟化单苯并环辛炔

  摘要：

  我们通过四步反应路径设计并合成了羧甲基单苯并环辛炔（COMBO）。COMBO是一种新型，结构简单，无氟，可直接偶联的无铜咔嗒试剂，它具有出色的反应动力学，理论计算也证明了这一点。另外，羧酸附件允许进一步缀合至生物分子或荧光标记。当将含COMBO的荧光标记物用于HeLa细胞的聚糖成像（经代谢修饰以在其细胞表面聚糖上具有叠氮唾液酸残基）时，证明了COMBO在生物正交标记方案中的效用。

  DOI：

  10.1002/chem.201102329

文献信息

• [EN] METHODS OF TREATING OR AMELIORATING METABOLIC DISORDERS USING GROWTH DIFFERENTIATION FACTOR 15 (GDF-15)<br/>[FR] MÉTHODES DE TRAITEMENT OU D'AMÉLIORATION DE TROUBLES MÉTABOLIQUES À L'AIDE DU FACTEUR-15 DE CROISSANCE ET DE DIFFÉRENCIATION (GDF-15)
  申请人：NOVARTIS AG

  公开号：WO2017109706A1

  公开（公告）日：2017-06-29

  The disclosure relates to the treatment of non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD) and non-alcoholic steatohepatitis (NASH), as well as end-stage liver disease, hepatic steatosis (fatty liver), liver fibrosis, liver inflammation, liver cirrhosis, primary biliary cirrhosis (PBC), and hepatocellular carcinoma (HCC), by administering to a subject in need a GDF15 protein or a functional variant, mutation, fusion, or conjugate thereof, and to pharmaceutical compositions that contain the same.

  该披露涉及通过向需要的受试者施用GDF15蛋白或其功能变体、突变体、融合物或结合物，以及含有相同成分的药物组合物，治疗非酒精性脂肪肝病（NAFLD）和非酒精性脂肪性肝炎（NASH），以及晚期肝病、肝脂肪变性（脂肪肝）、肝纤维化、肝炎、肝硬化、原发性胆汁性肝硬化（PBC）和肝细胞癌（HCC）。
• A systematic study of protein labeling by fluorogenic probes using cysteine targeting vinyl sulfone-cyclooctyne tags
  作者：B. Söveges、T. Imre、T. Szende、Á. L. Póti、G. B. Cserép、T. Hegedűs、P. Kele、K. Németh

  DOI：10.1039/c6ob00810k

  日期：——

  targeting function and cyclooctyne motifs, suitable for subsequent conjugation with fluorogenic azides via copper free strain-promoted azide–alkyne click chemistry. Direct and sequential labeling reaction steps were analyzed by native PAGE, capillary zone electrophoresis and tandem mass spectrometry. The efficiency of tagging was correlated with solvent accessibility of the Cys residues. Our results indicated

  通过可及的半胱氨酸残基对蛋白质进行荧光标记至关重要。在这项研究中，通过直接荧光衍生化或以顺序方式将目标模型蛋白（促分裂原活化的蛋白激酶）以天然状态成功标记在其游离巯基上，其中位点特异性接头和荧光团的结合在两种条件下进行脚步。为此，我们设计并制备了两种新型的化学报告分子，它们带有乙烯基砜作为Cys的靶向功能和环辛炔基序，适合于随后与含氟叠氮化物通过无铜应变促进的叠氮化物-炔点击化学。通过天然PAGE，毛细管区带电泳和串联质谱分析直接和顺序标记反应步骤。标记效率与Cys残基的溶剂可及性相关。我们的结果表明，乙烯基砜连接基与天然蛋白的结合是快速且硫醇选择性的。随后与荧光染料的点击反应会产生强烈的荧光信号，并满足生物正交性的所有要求。
• PROCESS FOR THE CYCLOADDITION OF A HETERO(ARYL) 1,3-DIPOLE COMPOUND WITH A (HETERO)CYCLOALKYNE
  申请人：SYNAFFIX B.V.

  公开号：US20170002012A1

  公开（公告）日：2017-01-05

  A process is provided, comprising reacting a (hetero)aryl 1,3-dipole compound with a (hetero)cycloalkyne, wherein the (hetero)aryl 1,3-dipole compound comprises a 1,3-dipole functional group bonded to a (hetero)aryl group, and wherein the (hetero)aryl 1,3-dipole compound is a (hetero)aryl azide or a (hetero)aryl diazo compound; wherein: (i) the (hetero)aryl group of the (hetero)aryl 1,3-dipole compound comprises a substituent (ii) the (hetero)aryl group of the (hetero)aryl 1,3-dipole compound is an electron-poor (hetero)aryl group and wherein the (hetero)cycloalkyne is a (hetero)cyclooctyne or a (hetero)cyclononyne according to Formula (1). The invention also relates to the products obtainable by the process according to the invention.

  提供一种方法，包括将（杂）芳基1,3-二极化合物与（杂）环炔反应，其中（杂）芳基1,3-二极化合物包括与（杂）芳基结合的1,3-二级极功能基团，并且（杂）芳基1,3-二极化合物是（杂）芳基叠氮化物或（杂）芳基重氮化合物；其中：（i）（杂）芳基1,3-二极化合物的（杂）芳基包括一个取代基（ii）（杂）芳基1,3-二极化合物的（杂）芳基是一个电子贫富（杂）芳基，并且（杂）环炔是根据式（1）的（杂）环辛烯或（杂）环壬炔。该发明还涉及根据该发明的方法获得的产品。
• [EN] PROCESS FOR THE CYCLOADDITION OF A HETERO(ARYL) 1,3-DIPOLE COMPOUND WITH A (HETERO)CYCLOALKYNE<br/>[FR] PROCÉDÉ DE CYCLOADDITION D'UN COMPOSÉ HÉTÉRO(ARYL) 1,3-DIPOLE AVEC UN (HÉTÉRO)CYCLOALKYNE
  申请人：STICHTING KATHOLIEKE UNIV

  公开号：WO2015112014A1

  公开（公告）日：2015-07-30

  The present invention relates to a process comprising the step of reacting a (hetero)aryl 1,3-dipole compound with a (hetero)cycloalkyne, wherein: a (hetero)aryl 1,3-dipole compound is defined as a compound comprising a 1,3-dipole functional group, wherein the 1,3-dipole functional group is bonded to a (hetero)aryl group, and wherein the (hetero)aryl 1,3-dipole compound is a (hetero)aryl azide or a (hetero)aryl diazo compound; wherein: (i) the (hetero)aryl group of the (hetero)aryl 1,3-dipole compound comprises one or more substituents having a positive value for the para-Hammett substituent constant σp and/or the meta-Hammett substituent constant σm, and/or (ii) the (hetero)aryl group of the (hetero)aryl 1,3-dipole compound is an electron-poor (hetero)aryl group, wherein an electron-poor (hetero)aryl group is: (ii-a) a (hetero)aryl group wherein the (hetero)aromatic ring system is bearing a positive charge, and/or (ii-b) a (hetero)aryl group wherein the ratio number of π-electrons present in the (hetero)aromatic ring system} : number of protons present in the nuclei of the (hetero)aromatic ring system} is lower than 0.167 for a 6-membered ring, or lower than 0.200 for a 5-membered ring; and wherein the (hetero)cycloalkyne is a (hetero)cyclooctyne or a (hetero)cyclononyne according to Formula (1): The invention also relates to the products obtainable by the process according to the invention.

  本发明涉及一种包括以下步骤的过程：将（杂）芳基1,3-二极化合物与（杂）环戊炔发生反应，其中：（杂）芳基1,3-二极化合物被定义为包含1,3-二极功能基团的化合物，其中1,3-二极功能基团与（杂）芳基团结合，而（杂）芳基1,3-二极化合物是（杂）芳基叠氮化物或（杂）芳基重氮化合物；其中：（i）（杂）芳基1,3-二极化合物的（杂）芳基团包括一个或多个对位Hammett取代常数σp和/或间位Hammett取代常数σm的正值取代基，和/或（ii）（杂）芳基1,3-二极化合物的（杂）芳基团是一个电子贫穷的（杂）芳基团，其中电子贫穷的（杂）芳基团是：（ii-a）一个（杂）芳基团，其中（杂）芳香环系统带有正电荷，和/或（ii-b）一个（杂）芳基团，其中比例（杂）芳香环系统中存在的π电子数}：（杂）芳香环系统中核内质子数}对于6元环小于0.167，或对于5元环小于0.200；其中（杂）环戊炔是根据式（1）的（杂）环辛炔或（杂）环壬炔；该发明还涉及根据该发明的过程获得的产品。
• Polarity Sensitive Bioorthogonally Applicable Far-Red Emitting Labels for Postsynthetic Nucleic Acid Labeling by Copper-Catalyzed and Copper-Free Cycloaddition
  作者：Ádám Eördögh、Jeannine Steinmeyer、Krisana Peewasan、Ute Schepers、Hans-Achim Wagenknecht、Péter Kele

  DOI：10.1021/acs.bioconjchem.5b00557

  日期：2016.2.17

  benzothiazolium-based fluorescent labels with large Stokes’ shifts were synthesized that can be conjugated to alkyne-modified biomolecules through their azide moiety via azide–alkyne cycloaddition. We have used these azide bearing labels to make fluorescent DNA constructs using copper-catalyzed “click” reaction. All dyes showed good or remarkable fluorescence intensity enhancement upon conjugation to

  合成了两个新的，水溶性的，可透膜的，远红外/近红外发射的，具有较大斯托克斯位移的，基于苯并噻唑鎓的荧光标记物，可以通过叠氮化物-炔烃环加成反应，通过叠氮化物部分与炔烃修饰的生物分子偶联。我们已经使用这些带有叠氮化物的标记物通过铜催化的“喀哒”反应制备了荧光DNA结构。与染料结合后，所有染料均显示出良好或显着的荧光强度增强。我们还研究了通过刚性（乙炔基）或柔性（乙基）接头将苯并环辛炔基序并入DNA的可能性，从而实现了无铜标记方案。我们观察到，在所标记的寡核苷酸的光学性质方面，所应用的两个接头之间存在显着差异。我们还测试了这些新合成的染料在以前用环辛基化DNA转染的HeLa细胞上的体内标记潜力。共聚焦荧光图像显示，所有染料都能够穿过膜，并且适合于无背景荧光的核酸荧光标记。此外，我们已经观察到两种染料系列分别在内体颗粒或细胞核中的不同积累。