Design of a structure-activity relationship model of vitamin K epoxide reductase (VKORC1) inhibitors combining chemical synthesis of new compounds, enzymatic assays and molecular modelling
作者:Nolan Chatron、Manon Boulven、Adrien Montagut-Romans、Flavien Ponsot、Maïwenn Jacolot、Hervé Caruel、Etienne Benoît、Florence Popowycz、Virginie Lattard
DOI:10.1016/j.bmc.2023.117453
日期:2023.10
relationships. However, the recent publication of VKORC1 crystal structure provides new information for further studies. Based on these findings, we combined chemical synthesis, enzymatic assays and molecular modelling methods to design a structure–activity relationship (SAR) model. Our results proved that the lipophilicity, the membrane permeability of inhibitors and their affinity towards human VKORC1 enzyme
自 20 世纪 50 年代以来,维生素 K 拮抗剂 (VKA)抗凝剂一直被用作药物和杀鼠剂。这些分子主要是 4-羟基香豆素衍生物,通过抑制维生素 K 环氧化物还原酶 (VKORC1)(一种内质网膜驻留酶)发挥作用。然而,过去十年中报道了许多 VKORC1 突变,导致 VKA 耐药,从而导致治疗失败。尽管有研究报道了基于 VKORC1 结构同源模型的 VKA 的实验和计算研究,但由于缺乏结构数据和可靠的构效关系,新型有效抗凝剂的开发相当复杂。然而,最近发表的VKORC1晶体结构为进一步研究提供了新的信息。基于这些发现,我们结合化学合成、酶分析和分子建模方法设计了构效关系(SAR)模型。我们的结果证明,抑制剂的亲脂性、膜渗透性及其对人 VKORC1 酶的亲和力是有效抗凝剂的主要特征。我们的 SAR 模型设法根据化合物抑制人类 VKORC1 的能力对化合物进行排名。这样的工具可能构成在化学合成和