摘要:
最近,我们报道了糖辅助连接 (SAL) 的发展,这是一种用于合成糖肽的新型肽连接方法。在对糖蛋白数据库中的大量糖蛋白序列进行筛选后,很明显,很大比例(约 53%)的 O-糖基化位点包含不会发生 SAL 反应的氨基酸残基。为了克服这些固有的局限性并扩大我们在此报告的扩展 SAL 方法的开发范围。糖基化残基 N 端最多含有 6 个氨基酸延伸的糖肽显示出促进与肽硫酯的连接反应,并且这些产物以良好的产率分离。动力学分析表明,随着糖肽被更多氨基酸残基延伸,连接反应变得更慢。这一发现通过使用 AMBER9 的分子动力学模拟得到了合理化。这些研究表明了一个普遍趋势,即硫酯中间体(N 端胺和硫酯的羰基碳)的反应位点之间的近端距离随着糖肽的延长而增加,从而减慢了连接速度。每种扩展的 SAL 方法都对连接点处的许多不同氨基酸组合显示出广泛的耐受性。对糖蛋白数据库的重新评估表明,现在可以利用 95% 的 O-连接糖基化位点来促进