[(S)-fluoro{hydroxy[(1S)-2-(morpholin-4-yl)-2-oxo-1-phenylethoxy]phosphoryl}methyl]phosphonic acid | 1375082-89-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: [(S)-fluoro{hydroxy[(1S)-2-(morpholin-4-yl)-2-oxo-1-phenylethoxy]phosphoryl}methyl]phosphonic acid
• CAS: 1375082-89-5
• 化学式: C₁₃H₁₈FNO₈P₂
• 分子量: 397.234
• InChiKey: RATJFJDBPRNGJS-AAEUAGOBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.22
• 重原子数：
  25.0
• 可旋转键数：
  6.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.46
• 拓扑面积：
  133.6
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  5.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [(S)-fluoro{hydroxy[(1S)-2-(morpholin-4-yl)-2-oxo-1-phenylethoxy]phosphoryl}methyl]phosphonic acid 、 adenosine 5'-monophosphate morpholidate 在 三正丁胺 作用下， 以 乙醇 、 水 、 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 72.5h， 以26%的产率得到9-{5-O-[{[((R)-fluoro{hydroxy[(S)-morpholin-4-yl(phenyl)methoxy]phosphoryl}-methyl)(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]pentofuranosyl}-9H-purin-6-amine
  参考文献：
  名称：

  5'-β，γ-CHF-ATP非对映异构体：c-Src蛋白激酶的合成及氟介导的选择性结合

  摘要：

  报道了单个β，γ-CHF-ATP立体异构体12a和12b的首次制备。构型上由C-F氟，的取向完全不同12A和12B具有离散31 P（202兆赫，pH值10.9，Δδ Pα 6赫兹，Δδ Pβ 4赫兹）和19 F NMR（470兆赫，pH值9.8，Δδ ˚F 25 Hz）的光谱特征，并显示c-Src激酶的IC 50值有6倍的差异，这归因于结合位点12b的（S）氟与活性位点R388的独特相互作用。

  DOI：

  10.1021/ol503765n
• 作为产物：
  描述：

  [fluoro-[hydroxy-[(1S)-2-morpholin-4-yl-2-oxo-1-phenylethoxy]phosphoryl]methyl]-morpholin-4-ylphosphinic acid 在 Phe-nomenex Luna C₁₈ 、 Dowex 50WX₈ (100-400 mesh, H⁺ form) 作用下， 以 水 、 乙腈 为溶剂， 生成 [(S)-fluoro{hydroxy[(1S)-2-(morpholin-4-yl)-2-oxo-1-phenylethoxy]phosphoryl}methyl]phosphonic acid
  参考文献：
  名称：

  5'-β，γ-CHF-ATP非对映异构体：c-Src蛋白激酶的合成及氟介导的选择性结合

  摘要：

  报道了单个β，γ-CHF-ATP立体异构体12a和12b的首次制备。构型上由C-F氟，的取向完全不同12A和12B具有离散31 P（202兆赫，pH值10.9，Δδ Pα 6赫兹，Δδ Pβ 4赫兹）和19 F NMR（470兆赫，pH值9.8，Δδ ˚F 25 Hz）的光谱特征，并显示c-Src激酶的IC 50值有6倍的差异，这归因于结合位点12b的（S）氟与活性位点R388的独特相互作用。

  DOI：

  10.1021/ol503765n

文献信息

• β,γ-CHF- and β,γ-CHCl-dGTP Diastereomers: Synthesis, Discrete ³¹P NMR Signatures, and Absolute Configurations of New Stereochemical Probes for DNA Polymerases
  作者：Yue Wu、Valeria M. Zakharova、Boris A. Kashemirov、Myron F. Goodman、Vinod K. Batra、Samuel H. Wilson、Charles E. McKenna

  DOI：10.1021/ja300218x

  日期：2012.5.30

  characterized by (31)P, (1)H, and (19)F NMR spectroscopy and by mass spectrometry. After treatment with Chelex-100 to remove traces of paramagnetic ions, at pH ~10 the diastereomer pairs 12a,b exhibit discrete P(α) and P(β)(31)P resonances. The more upfield P(α) and more downfield P(β) resonances (and also the more upfield (19)F NMR resonance in 12b) are assigned to the R configuration at the P(β)-CHX-P(γ)

  脱氧核苷 5'-三磷酸类似物（其中 β,γ-桥氧已被 CXY 基团取代）是研究 DNA 聚合酶催化和碱基选择机制的有用化学探针。此类探针的局限性在于，当桥接碳取代不等价（X≠Y）时，常规合成方法会产生非对映异构体的混合物。我们在这里报告了这个长期存在的问题的通用解决方案，其中包括四个 β,γ-CXY dNTP 非对映体示例：(S)- 和 (R)-β,γ-CHCl-dGTP (12a-1/12a-2) 和(S)-和(R)-β,γ-CHF-dGTP (12b-1/12b-2)。其制备的核心是将前手性母体双膦酸转化为其 (R)-扁桃酸单酯的 P,C-二吗啉酰胺衍生物 7，从而获得各个非对映异构体 7a-1、7a-2、7b-1、和7b-2通过制备型HPLC。然后选择性酸性水解 PN 键，得到“门户”非对映异构体，该非对映异构体很容易与吗啉激活的 dGMP 偶联。通过 H(2) (Pd/C) 去除手性辅助物，得到四种单独的非对映核苷酸