作者:Michiko Tawada、Shinkichi Suzuki、Yasuhiro Imaeda、Hideyuki Oki、Gyorgy Snell、Craig A. Behnke、Mitsuyo Kondo、Naoki Tarui、Toshimasa Tanaka、Takanobu Kuroita、Masaki Tomimoto
DOI:10.1016/j.bmc.2016.09.065
日期:2016.11
characteristic interaction pattern provided new structural insights into renin’s active site and the potential to create a new generation of renin inhibitors. In addition, we demonstrated our FBDD strategy integrating highly sensitive biochemical assay, X-ray crystallography, and high-throughput synthesis and in silico library design aimed at fragment morphing at the initial stage was effective to elucidate
进行了一种基于片段的先导发现的新方法,并将其应用于肾素抑制剂。对肾素的片段文库的生化筛选提供了命中片段,该片段显示出与靶蛋白的特征性相互作用模式。命中片段仅与S1,S3和S3 SP(S3子口袋)位点结合,而与催化的天冬氨酸残基(Asp32和Asp215(胃蛋白酶编号))没有任何相互作用。在对击中片段进行化学修饰之前,我们首先通过利用击中片段的亚结构来鉴定其基本结合位点。其次,我们创建了一个新的较小的脚手架,更好地占据了已确定的基本S3和S3 SP通过利用高通量化学方法进行文库合成来确定位点。然后,我们重新访问了S1站点,并通过库合成有效地探索了附着在支架上的良好构建基块。在文库合成中,通过X射线晶体学确定并确定了每种关键化合物的结合模式,并通过基于结构的计算方法对文库进行了策略性设计,不仅获得了更具活性的化合物,而且获得了有益的结构活性关系( SAR)。结果,我们获得了一种铅化合物,该化合