methyl 1-[(dimethylamino)sulfonyl]-2-(methylamino)-6-nitro-1H-benzimidazole-5-carboxylate | 1001242-73-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: methyl 1-[(dimethylamino)sulfonyl]-2-(methylamino)-6-nitro-1H-benzimidazole-5-carboxylate
• 英文别名: Methyl 1-(dimethylsulfamoyl)-2-(methylamino)-6-nitrobenzimidazole-5-carboxylate
• CAS: 1001242-73-4
• 化学式: C₁₂H₁₅N₅O₆S
• 分子量: 357.347
• InChiKey: BCCDXCWWFMQZEN-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.6
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  148
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 1-[(dimethylamino)sulfonyl]-2-(methylamino)-6-nitro-1H-benzimidazole-5-carboxylate 在 溶剂黄146 、 锌 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 0.33h， 以100%的产率得到methyl 1-[(dimethylamino)sulfonyl]-2-(methylamino)-6-nitro-1H-benzimidazole-5-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  tRNA-鸟嘌呤转糖基酶的强效抑制剂，一种与志贺氏菌的致病性有关的酶：电荷辅助氢键。

  摘要：

  DOI：

  10.1002/anie.200702961
• 作为产物：
  描述：

  methyl 2-bromo-1-[(dimethylamino)sulfonyl]-6-nitro-1H-benzimidazole-5-carboxylate 、 甲胺 以 乙醇 为溶剂， 反应 0.17h， 以80%的产率得到methyl 1-[(dimethylamino)sulfonyl]-2-(methylamino)-6-nitro-1H-benzimidazole-5-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  tRNA-鸟嘌呤转糖基酶的强效抑制剂，一种与志贺氏菌的致病性有关的酶：电荷辅助氢键。

  摘要：

  DOI：

  10.1002/anie.200702961

文献信息

• From lin-Benzoguanines to lin-Benzohypoxanthines as Ligands for Zymomonas mobilis tRNA-Guanine Transglycosylase: Replacement of Protein-Ligand Hydrogen Bonding by Importing Water Clusters
  作者：Luzi Jakob Barandun、Florian Immekus、Philipp C. Kohler、Sandro Tonazzi、Björn Wagner、Severin Wendelspiess、Tina Ritschel、Andreas Heine、Manfred Kansy、Gerhard Klebe、François Diederich

  DOI：10.1002/chem.201200809

  日期：2012.7.23

  presence of an N‐alkyl group at C(6) in lin‐benzoguanine ligands, this water cluster is largely maintained but replacement of one of the water molecules in the cluster leads to a substantial loss in binding affinity. This study provides new insight into the role of water clusters at enzyme active sites and their challenging substitution by ligand parts, a topic of general interest in contemporary structure‐based

  食源性志贺菌病是由分泌高细胞毒性志贺毒素的志贺氏菌引起的，志贺菌毒素也由密切相关的肠出血性大肠杆菌（EHEC）形成。研究表明，tRNA-鸟嘌呤转糖基酶（TGT）对于弗氏志贺氏菌的致病性至关重要。这里，在一个鸟嘌呤结合口袋的分子识别性能运动发酵单胞TGT与一系列调查林-benzohypoxanthine-和林基于-benzoguanine-抑制剂带有取代基占据任一核糖-33或核糖-34的口袋。这三种抑制剂支架的不同之处在于C（6）处的取代基为H，NH2或NH烷基。这些差异导致抑制常数，p K a值和结合模式发生重大变化。相较于林-benzoguanines，用环外NH 2在C（6）中，林-benzohypoxanthines无环外NH 2基团具有亲和力较弱几个离子蛋白质-配体的氢键都将丢失。X射线共晶体结构分析表明，由于缺少NH 2基团和催化Asp102侧链的构象转移，新的水簇被引入到空缺