N,N'-bis-(4-hydroxybenzyl)-L-tartramide | 1610951-01-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 酚类
• 英文名称: N,N'-bis-(4-hydroxybenzyl)-L-tartramide
• 英文别名: N,N'-bis(4-hydroxybenzyl)-L-tartramide
• CAS: 1610951-01-3
• 化学式: C₁₈H₂₀N₂O₆
• 分子量: 360.367
• InChiKey: PKZFFRWYIORHOR-HZPDHXFCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.25
• 重原子数：
  26.0
• 可旋转键数：
  7.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.22
• 拓扑面积：
  139.12
• 氢给体数：
  6.0
• 氢受体数：
  6.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N,N'-bis-(4-hydroxybenzyl)-L-tartramide 在 sodium periodate 、 sodium trideuterioacetate 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 、 重水 为溶剂， 反应 2.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  醛封端蛋白和噬菌体文库的快速、水解稳定修饰

  摘要：

  我们描述了 2-氨基苯甲胺肟 (ABAO) 衍生物与水中醛的快速反应。ABAO 结合了苯胺部分，用于基于亚胺的醛活化，以及与胺邻位的亲核基团 (Nu:) 用于分子内闭环。ABAO 和醛之间的反应在动力学上类似于在化学计量苯胺催化下进行的肟形成。我们通过 NMR 和 UV 光谱对反应进行了表征，并确定该过程的速率决定步骤是形成席夫碱，然后是快速分子内闭环。表观速率常数和 pH 值之间的关系表明质子化苯甲胺肟在席夫碱形成中充当内部一般酸。芳环中的取代基会增加芳胺的碱性，从而加速反应。在 pH 4.5 下观察到的富电子醛和 5-甲氧基-ABAO (PMA) 之间高达 40 M(-1) s(-1) 的速率使该反应成为已知最快的生物正交反应之一. M13 噬菌体展示的以醛基部分终止的肽库与 1 mM 生物素-ABAO 衍生物之间的反应在 pH 4.5 下在 1 小时内完成。最后，反应产物二氢喹唑啉衍生物在

  DOI：

  10.1021/ja5023909
• 作为产物：
  描述：

  L-(+)-酒石酸二甲酯 、 4-羟基苄胺 在 potassium carbonate 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 以55%的产率得到N,N'-bis-(4-hydroxybenzyl)-L-tartramide
  参考文献：
  名称：

  醛封端蛋白和噬菌体文库的快速、水解稳定修饰

  摘要：

  我们描述了 2-氨基苯甲胺肟 (ABAO) 衍生物与水中醛的快速反应。ABAO 结合了苯胺部分，用于基于亚胺的醛活化，以及与胺邻位的亲核基团 (Nu:) 用于分子内闭环。ABAO 和醛之间的反应在动力学上类似于在化学计量苯胺催化下进行的肟形成。我们通过 NMR 和 UV 光谱对反应进行了表征，并确定该过程的速率决定步骤是形成席夫碱，然后是快速分子内闭环。表观速率常数和 pH 值之间的关系表明质子化苯甲胺肟在席夫碱形成中充当内部一般酸。芳环中的取代基会增加芳胺的碱性，从而加速反应。在 pH 4.5 下观察到的富电子醛和 5-甲氧基-ABAO (PMA) 之间高达 40 M(-1) s(-1) 的速率使该反应成为已知最快的生物正交反应之一. M13 噬菌体展示的以醛基部分终止的肽库与 1 mM 生物素-ABAO 衍生物之间的反应在 pH 4.5 下在 1 小时内完成。最后，反应产物二氢喹唑啉衍生物在

  DOI：

  10.1021/ja5023909

文献信息

• Discovery of Potent and Selective Inhibitors against Protein-Derived Electrophilic Cofactors
  作者：Xie Wang、Zongtao Lin、Katelyn A. Bustin、Nate R. McKnight、William H. Parsons、Megan L. Matthews

  DOI：10.1021/jacs.1c12748

  日期：2022.3.30

  they have remained blind spots in traditional activity-based protein profiling (ABPP) approaches that target nucleophiles. More recently, reverse-polarity (RP)-ABPP using hydrazine probes identified an electrophilic N-terminal glyoxylyl (Glox) group for the first time in secernin-3 (SCRN3). The biological function(s) of both the protein and Glox as a cofactor has not yet been pharmacologically validated

  亲电子辅助因子广泛分布于自然界，在许多生理和疾病过程中发挥着重要作用，但它们在传统的以亲核试剂为靶标的基于活性的蛋白质分析 (ABPP) 方法中仍然存在盲点。最近，使用肼探针的反极性 (RP)-ABPP 鉴定了亲电子Nsecernin-3 (SCRN3) 中首次出现的末端乙二醛 (Glox) 基团。蛋白质和 Glox 作为辅助因子的生物学功能尚未经过药理学验证，因为缺乏可能破坏并因此确定其活性的选择性抑制剂。在这里，我们提出了第一个平台，用于分析扩展的亲核探针库对主链羰基辅助因子（如 Glox 和丙酮酰基 (Pyvl) 基团）的反应性和选择性。我们首先在整个蛋白质组范围内应用文库来分析和确认与各种亲电蛋白靶点的结合，包括 secernin-2 (SCRN2)，此处显示也具有 Glox 基团。广泛反应的吲哚乙基肼探针用于体外竞争性RP-ABPP 测定从一组市售的亲核片段中筛选针对此类辅助因子的选择性抑制剂。使用含有