4-(2,2,2-trifluoro-N-((2-isobutyramido-4-oxo-3,4-dihydropteridin-6-yl)methyl)acetamido) benzoic acid | 252847-30-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 4-(2,2,2-trifluoro-N-((2-isobutyramido-4-oxo-3,4-dihydropteridin-6-yl)methyl)acetamido) benzoic acid
• 英文别名: N2-isobutyryl-N10-trifluoroacetylpteroic acid；4-[[2-(2-methylpropanoylamino)-4-oxo-3H-pteridin-6-yl]methyl-(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]benzoic acid
• CAS: 252847-30-6
• 化学式: C₂₀H₁₇F₃N₆O₅
• 分子量: 478.387
• InChiKey: GESKMEBMIOKYID-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 密度：
  1.58±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.4
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.25
• 拓扑面积：
  154
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-(2,2,2-trifluoro-N-((2-isobutyramido-4-oxo-3,4-dihydropteridin-6-yl)methyl)acetamido) benzoic acid 在 二异丙基铵盐四氮唑 、 1-羟基苯并三唑 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 55.66h， 生成 (17S)-methyl 1-(((2-cyanoethoxy)(diisopropylamino)phosphino)oxy)-14-oxo-17-(4-(2,2,2-trifluoro-N-((2-isobutyramido-4-oxo-3,4-dihydropteridin-6-yl)methyl)acetamido)benzamido)-3,6,9-trioxa-13-azaoctadecan-18-oate
  参考文献：
  名称：

  PHOSPHORAMIDITE DERIVATIVES OF FOLIC ACID

  摘要：

  本发明提供了I式化合物：其中L和R1-R6的任何值均在说明书中定义。I式化合物可用作试剂，与感兴趣的羟基含有化合物如寡核苷酸和抗癌化合物形成叶酸共轭物。

  公开号：

  US20120035362A1
• 作为产物：
  描述：

  N10-三氟乙酰基蝶酸 、 异丁酸酐 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 叔丁基二苯基氯硅烷 作用下， 反应 30.0h， 以89%的产率得到4-(2,2,2-trifluoro-N-((2-isobutyramido-4-oxo-3,4-dihydropteridin-6-yl)methyl)acetamido) benzoic acid
  参考文献：
  名称：

  氨基氧点击化学作为双同型和双杂配体与核酸缀合的工具

  摘要：

  氨基氧点击化学 (AOCC) 策略用于合成核苷构建块，用于在寡核苷酸的固相支持合成过程中掺入，以实现各种生物学相关配体的双同型和双杂共轭。双高氨基氧基共轭导致二价配体呈递，而双杂共轭允许放置具有相同或不同化学键的不同配体。这种简便的合成方法允许同时引入具有不同生物学功能的两种不同配体。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.2c00988

文献信息

• CHEMICAL MODIFICATIONS OF MONOMERS AND OLIGONUCLEOTIDES WITH CYCLOADDITION
  申请人：Manoharan Muthiah

  公开号：US20120035115A1

  公开（公告）日：2012-02-09

  The invention features compounds of formula I or II: In one embodiment, the invention relates compounds and processes for conjugating ligand to oligonucleotide. The invention further relates to methods for treating various disorders and diseases such as viral infections, bacterial infections, parasitic infections, cancers, allergies, autoimmune diseases, immunodeficiencies and immunosuppression.

  该发明涉及公式I或II的化合物：在一种实施方式中，该发明涉及化合物和用于将配体与寡核苷酸结合的过程。该发明进一步涉及治疗各种疾病和疾病的方法，例如病毒感染、细菌感染、寄生虫感染、癌症、过敏、自身免疫疾病、免疫缺陷和免疫抑制。
• Novel Synthetic Strategies Enable the Efficient Development of Folate Conjugates for Cancer Radiotheranostics
  作者：Luisa M. Deberle、Martina Benešová、Anna E. Becker、Magdalena Ratz、Patrycja Guzik、Roger Schibli、Cristina Müller

  DOI：10.1021/acs.bioconjchem.1c00198

  日期：2021.8.18

  agent. The main difference between the two approaches was the sequence of conjugating the single structural units. The approach that introduced the folate entity as the last unit appeared particularly useful for the preparation of conjugates based on 6R- or 6S-5-methyltetrahydrofolic acid (5-MTHF; a reduced folate version) as targeting entity. Three types of folate conjugates were synthesized either

  由于叶酸受体 (FR) 在多种肿瘤类型中过度表达，因此叶酸受体 (FR) 是放射治疗学的一个有趣目标。然而，由于叶酸化学带来的合成挑战，开发新型叶酸放射性偶联物的进展缓慢。因此，本研究的目标是建立通用的固相合成策略，以方便地制备新型叶酸缀合物。基于正交芴基甲氧羰基 (Fmoc) 保护策略建立了两种方法，以使用叶酸（氧化叶酸形式）作为靶向剂来模块化构建白蛋白结合 DOTA 偶联物（称为 OxFol-1）。两种方法之间的主要区别在于结合单个结构单元的顺序。R - 或 6 S -5-甲基四氢叶酸（5-MTHF；减少叶酸形式）作为靶向实体。使用基于对碘苯基的白蛋白结合剂（OxFol-1、6 R -RedFol-1 和 6 S -RedFol-1）或不使用白蛋白结合实体（OxFol-14、6 R -RedFol-14 和 6 S-RedFol-14)。经过 9-13 个合成步骤和一次最终 HPLC 纯化后，所有六种偶联物均以高化学纯度
• Nucleosidic and non-nucleosidic folate conjugates
  申请人：ISIS Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：US20020049163A1

  公开（公告）日：2002-04-25

  Oligonucleotide-folate conjugates are described wherein folates are conjugated to one or more sites on an oligonucleotide including the 2′-, 3′-, 5′-, nucleobase and internucleotide linkage sites. The folate can be attached via the &agr;- or &ggr;-carboxylate, optionally through a linking group. Methods for the regiospecific synthesis of the conjugates are diclosed. Also disclosed are nucleosidic and non-nucleosidic linkers conjugated to folic acid and related folates.

  描述了寡核苷酸-叶酸共轭物，其中叶酸与寡核苷酸的2'-、3'-、5'-、核碱基和核苷酸间连接位点之一或多个位点结合。叶酸可以通过α-或γ-羧酸酯连接，可选地通过连接基团连接。公开了合成共轭物的区域特异性方法。还公开了与叶酸及相关叶酸共轭的核苷酸和非核苷酸连接剂。
• Targeting Lipids
  申请人：Manoharan Muthiah

  公开号：US20090247608A1

  公开（公告）日：2009-10-01

  The present invention provides targeting lipids of structure L 100— linker—L 101 (CI), where L 100 is a lipid, lipophile, alkyl, alkenyl or alkynyl, L 101 is a ligand or —CH 2 CH 2 (OCH 2 CH 2 ) p O(CH 2 ) q CH 2 -ligand, p is 1-1000, and q is 1-20. In addition, the invention provides compositions and methods for the delivery of therapeutic agents to cells. In particular, these include novel lipids and nucleic acid-lipid particles that provide efficient encapsulation of nucleic acids and efficient delivery of the encapsulated nucleic acid to cells in vivo.

  本发明提供了结构为L100-连接物-L101(CI)的靶向脂质，其中L100是一种脂质、亲脂剂、烷基、烯基或炔基，L101是一种配体或-CH2CH2(OCH2CH2)pO(CH2)qCH2-配体，p为1-1000，q为1-20。此外，本发明还提供了用于向细胞传递治疗剂的组合物和方法。特别地，这些包括新型脂质和核酸-脂质颗粒，它们提供了核酸的高效封装和在体内高效传递封装的核酸到细胞的方法。
• Folate Conjugates
  申请人：Manoharan Muthiah

  公开号：US20090247614A1

  公开（公告）日：2009-10-01

  The present invention provides iRNA agent including at least one monomer having the structure shown in formula (I′) wherein: A and B are each independently for each occurrence O, N(R N ) or S; X is H, a protecting group, a phosphate group, a phosphodiester group, an activated phosphate group, an activated phosphite group, a phosphoramidite, a solid support, —P(Z′)(Z″)O-nucleoside, —P(Z′)(Z″)O-oligonucleotide, a lipid, a PEG, a steroid, a polymer, —P(Z′)(Z″)O-L 6 -Q′-L 7 -OP(Z′″)(Z″″)O-oligonucleotide, a nucleotide, or an oligonucleotide; Y is H, a protecting group, a phosphate group, a phosphodiester group, an activated phosphate group, an activated phosphite group, a phosphoramidite, a solid support, —P(Z′)(Z″)O-nucleoside, —P(Z′)(Z″)O-oligonucleotide, a lipid, a PEG, a steroid, a lipophile, a polymer, —P(Z′)(Z″)O-L 6 -Q′-L 7 -OP(Z′″)(Z″″)O-oligonucleotide, a nucleotide, or an oligonucleotide; R is folate, a folate analog a folate mimic or a folate receptor binding ligand; L 6 and L 1 are each independently for each occurrence —(CH 2 ) n —, —C(R′)(R″)(CH 2 ) n —, —(CH 2 ) n C(R′)(R″)—, —(CH 2 CH 2 O) m CH 2 CH 2 —, or —(CH 2 CH 2 O) m CH 2 CH 2 NH—; Q′ is NH, O, S, CH 2 , C(O)O, C(O)NH, —NH—CH(R a )—C(O)—, —C(O)—CH(R a )—NH—, CO, where R a is H or amino acid side; chain. R′ and R″ are each independently H, CH 3 , OH, SH, NH 2 , NH(Alkyl=Me, Et, Pr, isoPr, Bu, Bn) or N(diAlkyl=Me 2 , Et 2 , Bn 2 ); Z′, Z″, Z′″ and Z″″ are independently O or S; n represent independently for each occurrence 1-20; and m represent independently for each occurrence 0-50.

  本发明提供了iRNA试剂，包括至少一个单体，其结构如式（I'）所示，其中：A和B分别独立于每个出现的O、N（RN）或S；X是H、保护基、磷酸基、磷酸二酯基、活性磷酸基、活性磷酸酯基、磷酰胺基、固体支持、-P（Z'）（Z"）O-核苷、-P（Z'）（Z"）O-寡核苷酸、脂质、PEG、类固醇、聚合物、-P（Z'）（Z"）O-L6-Q' -L7-OP（Z' "）（Z" "）O-寡核苷酸、核苷酸或寡核苷酸；Y是H、保护基、磷酸基、磷酸二酯基、活性磷酸基、活性磷酸酯基、磷酰胺基、固体支持、-P（Z'）（Z"）O-核苷、-P（Z'）（Z"）O-寡核苷酸、脂质、PEG、类固醇、亲脂性物质、聚合物、-P（Z'）（Z"）O-L6-Q' -L7-OP（Z' "）（Z" "）O-寡核苷酸、核苷酸或寡核苷酸；R是叶酸、叶酸类似物、叶酸模拟物或叶酸受体结合配体；L6和L1分别独立于每个出现的-（CH2）n-、-C（R'）（R"）（CH2）n-、-（CH2）nC（R'）（R"）-、-（CH2CH2O）mCH2CH2-或-（CH2CH2O）mCH2CH2NH-；Q'是NH、O、S、CH2、C（O）O、C（O）NH、-NH-CH（Ra）-C（O）-、-C（O）-CH（Ra）-NH-、CO，其中Ra是H或氨基酸侧链；R'和R"各自独立于H、CH3、OH、SH、NH2、NH（Alkyl=Me、Et、Pr、isoPr、Bu、Bn）或N（diAlkyl=Me2、Et2、Bn2）；Z'、Z"、Z' "和Z" "各自独立于O或S；n独立于每个出现的1-20；m独立于每个出现的0-50。