Structure-activity relationship for the folding intermediate-selective inhibition of DYRK1A
作者:Yuka Miyazaki、Masaki Kikuchi、Koji Umezawa、Aurelie Descamps、Daichi Nakamura、Gaku Furuie、Tomoe Sumida、Kanako Saito、Ninako Kimura、Takashi Niwa、Yuto Sumida、Takashi Umehara、Takamitsu Hosoya、Isao Kii
DOI:10.1016/j.ejmech.2021.113948
日期:2022.1
elusive. In this study, structural derivatives of FINDY (1) were designed and synthesized according to its predicted binding mode in the ATP pocket of DYRK1A. Quantitative structure-activity relationship (QSAR) of the derivatives revealed that the selectivity against the folding intermediate is determined by steric hindrance between the bulky hydrophobic moiety of the derivatives and the entrance to
DYRK1A 以分子间方式磷酸化参与神经系统疾病的蛋白质。同时,在 DYRK1A 的蛋白质折叠过程中,过渡折叠中间体催化“一次性”初始激活和稳定所需的分子内自磷酸化。在我们之前的研究中,鉴定了一种名为FINDY ( 1 ) 的小分子,它抑制 DYRK1A 折叠中间体催化的分子内自磷酸化,但不抑制折叠状态催化的分子间磷酸化。然而,负责这种中间选择性抑制的FINDY ( 1 ) 的结构特征仍然难以捉摸。本研究根据预测的 DYRK1A ATP 口袋中的结合模式,设计并合成了FINDY ( 1 ) 的结构衍生物。衍生物的定量构效关系(QSAR)表明,对折叠中间体的选择性是由衍生物的大疏水部分和口袋入口之间的空间位阻决定的。此外,还鉴定了一种有效的衍生物3 ,它对折叠中间体的抑制作用比FINDY更强 ( 1 );它被指定为dp -FINDY 。尽管dp -FINDY ( 3 ) 并不像FINDY (