N-(2-(2-(2-(2-aminoethoxy)ethoxy)ethoxy)ethyl)-2-((2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindolin-4-yl)oxy)acetamide trifluoroacetate | 1957236-21-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 异吲哚及其衍生物
• 英文名称: N-(2-(2-(2-(2-aminoethoxy)ethoxy)ethoxy)ethyl)-2-((2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindolin-4-yl)oxy)acetamide trifluoroacetate
• 英文别名: N-(2-(2-(2-(2-aminoethoxy)ethoxy)ethoxy)ethyl)-2-((2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindolin-4-yl)oxy)acetamide trifluoroacetic acid；E3 ligase Ligand-Linker Conjugates 14；N-[2-[2-[2-(2-aminoethoxy)ethoxy]ethoxy]ethyl]-2-[2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindol-4-yl]oxyacetamide;2,2,2-trifluoroacetic acid
• CAS: 1957236-21-3
• 化学式: C₂HF₃O₂*C₂₃H₃₀N₄O₉
• 分子量: 620.537
• InChiKey: BLYRZYHKZRITLJ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.78
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.52
• 拓扑面积：
  213
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  15

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(2-(2-(2-(2-aminoethoxy)ethoxy)ethoxy)ethyl)-2-((2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindolin-4-yl)oxy)acetamide trifluoroacetate 在 N,N-二异丙基乙胺 、 三氟乙酸 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 14.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  发现新型 20S 蛋白酶体亚基 β 5 PROTAC 降解剂作为咽癌和硼替佐米耐药多发性骨髓瘤的潜在治疗方法

  摘要：

  对硼替佐米等蛋白酶体抑制剂的耐药性是治疗多发性骨髓瘤 （MM） 的主要挑战。蛋白水解靶向嵌合体 （PROTAC） 是一种新兴的治疗方法，可诱导靶蛋白的选择性降解，为克服耐药性提供了一种有前途的解决方案。在这项研究中，我们设计并合成了诱导 20S 蛋白酶体亚基 β 5 降解的新型小分子 PROTACs，作为克服硼替佐米耐药性的策略。这些 20S 蛋白酶体亚基 β5 PROTACs 对 20S 蛋白酶体亚基 β5 和 cereblon （CRBN） 表现出相当大的结合亲和力，有效诱导 20S 蛋白酶体亚基 β5 降解，并对一组癌细胞系表现出强大的抗增殖活性。值得注意的是，PROTACs 12f 和 14 在体外和体内对咽癌细胞系 FaDu 和硼替佐米耐药 MM 细胞系 KM3/BTZ 均表现出强大的抗肿瘤作用，具有出色的安全性。综上所述，我们的研究结果强调了 PROTACs 12f 和 14 作为新型

  DOI：

  10.1016/j.bioorg.2024.107801
• 作为产物：
  描述：

  3-羟基苯二甲酸酐 在 sodium acetate 、 potassium carbonate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三氟乙酸 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 溶剂黄146 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 48.0h， 生成 N-(2-(2-(2-(2-aminoethoxy)ethoxy)ethoxy)ethyl)-2-((2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindolin-4-yl)oxy)acetamide trifluoroacetate
  参考文献：
  名称：

  发现纳帕布沙星PROTAC作为E3连接酶ZFP91的有效降解剂

  摘要：

  据报道，纳帕布沙星正在接受多项临床试验，可抑制信号转导子和转录因子3（STAT3）。为了更好地阐明其作用机理，我们设计了一种基于纳帕卡辛的针对嵌合体的蛋白水解酶（PROTAC）XD2-149，可抑制胰腺癌细胞系中STAT3信号转导，而不会引起蛋白酶体依赖性STAT3降解。XD2-149的蛋白质组学分析揭示了E3泛素蛋白连接酶ZFP91的下调。XD2-149以纳摩尔范围的DC 50值降解ZFP91 。XD2-149的细胞毒性ZFP91敲低可显着但不完全降低其水平，为其多靶点作用机制提供了证据。NQO1抑制剂双香豆酚可以挽救XD2-149的细胞毒性，但不能挽救ZFP91的降解，这表明NQO1诱导的细胞死亡与ZFP91无关。ZFP91在肿瘤发生中起作用，并参与多种致癌途径，包括NF-κB和HIF-1α。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.0c01897

文献信息

• [EN] BIFUNCTIONAL COMPOUNDS FOR HER3 DEGRADATION AND METHODS OF USE<br/>[FR] COMPOSÉS BIFONCTIONNELS DESTINÉS À LA DÉGRADATION D'HER3 ET PROCÉDÉS D'UTILISATION
  申请人：DANA FARBER CANCER INST INC

  公开号：WO2017117474A1

  公开（公告）日：2017-07-06

  The present invention provides bifunctional compounds which act as protein degradation inducing moieties for a HER family protein, such as Her3. The present invention also provides methods for the targeted degradation of a HER family protein through the use of the bifunctional compounds that link a ubiquitin ligase-binding moiety to a ligand that is capable of binding to the HER family protein which can be utilized in the treatment of disorders modulated by a HER family protein.

  本发明提供了作为蛋白质降解诱导基团的双功能化合物，用于HER家族蛋白质，如HER3。本发明还提供了一种通过使用将泛素连接酶结合基团与能够结合到HER家族蛋白质的配体相连的双功能化合物来靶向降解HER家族蛋白质的方法，该方法可用于治疗受HER家族蛋白质调节的疾病。
• [EN] TUNABLE ENDOGENOUS PROTEIN DEGRADATION WITH HETEROBIFUNCTIONAL COMPOUNDS<br/>[FR] DÉGRADATION MODULABLE DE PROTÉINE ENDOGÈNE AVEC DES COMPOSÉS HÉTÉROBIFONCTIONNELS
  申请人：DANA FARBER CANCER INST INC

  公开号：WO2018148443A1

  公开（公告）日：2018-08-16

  The present invention provides a means to modulate gene expression in vivo in a manner that avoids problems associated with CRISPR endogenous protein knock-out or knock-in strategies and strategies that provide for correction, or alteration, of single nucleotides. The invention includes inserting into the genome a nucleotide encoding a heterobifunctional compound targeting protein (dTAG) in-frame with the nucleotide sequence of a gene encoding an endogenously expressed protein of interest which, upon expression, produces an endogenous protein-dTAG hybrid protein. This allows for targeted protein degradation of the dTAG and the fused endogenous protein using a heterobifunctional compound.

  本发明提供了一种在体内调节基因表达的方法，避免了与CRISPR内源蛋白敲除或敲入策略以及提供单个核苷酸修正或改变的策略相关的问题。该发明包括将编码靶向蛋白（dTAG）的异双功能化合物的核苷酸插入基因组中，与编码感兴趣的内源表达蛋白的基因的核苷酸序列同框，表达后产生内源蛋白-dTAG杂交蛋白。这允许使用异双功能化合物对dTAG和融合的内源蛋白进行靶向蛋白降解。
• [EN] BIFUNCTIONAL MOLECULES FOR DEGRADATION OF EGFR AND METHODS OF USE<br/>[FR] MOLÉCULES BIFONCTIONNELLES POUR LA DÉGRADATION DU EGFR ET MÉTHODES D'UTILISATION
  申请人：DANA FARBER CANCER INST INC

  公开号：WO2017185036A1

  公开（公告）日：2017-10-26

  The present application provides bifunctional compounds of Formula (I): Targeting Ligand which act as protein degradation inducing moieties for EGFR and/or a mutant thereof. The present application also describes methods for the targeted degradation of EGFR and/or a mutant thereof through the use of the bifunctional compounds that link a ubiquitin ligase-binding moiety to a ligand that is capable of binding to EGFR and/or a mutant thereof which can be utilized in the treatment of disorders modulated by EGFR or a mutant thereof.

  本申请提供了式（I）的双功能化合物：靶向配体，其作为EGFR及/或其突变体的蛋白质降解诱导基团。本申请还描述了通过使用将泛素连接酶结合基团链接到能够结合到EGFR及/或其突变体的配体的双功能化合物来实现EGFR及/或其突变体的靶向降解的方法，该方法可用于治疗由EGFR或其突变体调节的疾病。
• [EN] METHOTREXATE ANALOGS AND METHODS OF USE<br/>[FR] ANALOGUES DE MÉTHOTREXATE ET PROCÉDÉS D'UTILISATION
  申请人：US HEALTH

  公开号：WO2021262693A1

  公开（公告）日：2021-12-30

  Compounds having general formula (I) or a pharmaceutically acceptable salt, N-oxide, or hydrate thereof are provided herein. Also provided are methods of making the compounds and methods of their use, including in treatment of cancer, autoimmune disorders, and viral infections.

  本文提供了具有通式（I）或其药用可接受的盐、N-氧化物或水合物的化合物。还提供了制备这些化合物的方法以及它们的使用方法，包括在癌症、自身免疫性疾病和病毒感染的治疗中的应用。
• Methods to induce targeted protein degradation through bifunctional molecules
  申请人：Dana-Farber Cancer Institute, Inc.

  公开号：US10125114B2

  公开（公告）日：2018-11-13

  The present application provides bifunctional compounds which act as protein degradation inducing moieties. The present application also relates to methods for the targeted degradation of endogenous proteins through the use of the bifunctional compounds that link a cereblon-binding moiety to a ligand that is capable of binding to the targeted protein which can be utilized in the treatment of proliferative disorders. The present application also provides methods for making compounds of the application and intermediates thereof.

  本申请提供了作为蛋白质降解诱导分子的双功能化合物。本申请还涉及通过使用双官能化合物靶向降解内源性蛋白质的方法，该双官能化合物将脑龙结合分子与能够与靶向蛋白质结合的配体连接起来，可用于治疗增殖性疾病。本申请还提供了制造本申请化合物及其中间体的方法。