methyl 1-chloro-9-(4,5-dimethoxy-2-nitrophenyl)-12-methyl-2,7,13-trioxo-8-oxa-3,6,12-triazaoctadecan-18-oate | 1402555-55-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: methyl 1-chloro-9-(4,5-dimethoxy-2-nitrophenyl)-12-methyl-2,7,13-trioxo-8-oxa-3,6,12-triazaoctadecan-18-oate
• 英文别名: Methyl 6-[[3-[2-[(2-chloroacetyl)amino]ethylcarbamoyloxy]-3-(4,5-dimethoxy-2-nitrophenyl)propyl]-methylamino]-6-oxohexanoate；methyl 6-[[3-[2-[(2-chloroacetyl)amino]ethylcarbamoyloxy]-3-(4,5-dimethoxy-2-nitrophenyl)propyl]-methylamino]-6-oxohexanoate
• CAS: 1402555-55-8
• 化学式: C₂₄H₃₅ClN₄O₁₀
• 分子量: 575.016
• InChiKey: PUMIMCZYTDVXBG-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.5
• 重原子数：
  39
• 可旋转键数：
  18
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  178
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 1-chloro-9-(4,5-dimethoxy-2-nitrophenyl)-12-methyl-2,7,13-trioxo-8-oxa-3,6,12-triazaoctadecan-18-oate 在 水 、 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 2.0h， 以16.7 mg的产率得到1-chloro-9-(4,5-dimethoxy-2-nitrophenyl)-12-methyl-2,7,13-trioxo-8-oxa-3,6,12-triazaoctadecan-18-oic acid
  参考文献：
  名称：

  环笼 Morpholinos：胚胎基因功能的构象门控探针

  摘要：

  感觉有点笼统：基于吗啉代的反义试剂已通过寡核苷酸环化（见方案）被笼子笼罩，从而能够对斑马鱼胚胎和幼虫中的基因表达进行光控制。使用这些试剂，已经检查了发育中的胰腺中外分泌细胞命运承诺的时间。

  DOI：

  10.1002/anie.201201690
• 作为产物：
  描述：

  甲基脂肪酰氯 在 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 6.33h， 生成 methyl 1-chloro-9-(4,5-dimethoxy-2-nitrophenyl)-12-methyl-2,7,13-trioxo-8-oxa-3,6,12-triazaoctadecan-18-oate
  参考文献：
  名称：

  环笼 Morpholinos：胚胎基因功能的构象门控探针

  摘要：

  感觉有点笼统：基于吗啉代的反义试剂已通过寡核苷酸环化（见方案）被笼子笼罩，从而能够对斑马鱼胚胎和幼虫中的基因表达进行光控制。使用这些试剂，已经检查了发育中的胰腺中外分泌细胞命运承诺的时间。

  DOI：

  10.1002/anie.201201690

文献信息

• CYCLIZING LINKER AND CYCLIC CAGED MORPHOLINOS
  申请人：CHEN JAMES K.

  公开号：US20130066059A1

  公开（公告）日：2013-03-14

  A bifunctional and photocleavable linker for cyclizing a morpholino-based oligonucleotide, having the formula: with the Linker as a photoactive group derivatized spacer molecule that presents two functional groups for cyclizing a selected morpholino and with the R group as a photoactive group utilized in the process of photocleavage and the X and Z groups are functional groups utilized for attachment to a morpholino to generate a cyclic structure.

  一种用于环化基于吗啡诺的寡核苷酸的双功能光解链联剂，具有以下公式：其中链联剂作为一个光活性基团衍生的间隔分子，呈现两个功能基团以环化所选的吗啡诺，R基团作为在光解过程中使用的光活性基团，X和Z基团是用于连接到吗啡诺以生成环状结构的功能基团。
• Cyclic Caged Morpholinos: Conformationally Gated Probes of Embryonic Gene Function
  作者：Sayumi Yamazoe、Ilya A. Shestopalov、Elayne Provost、Steven D. Leach、James K. Chen

  DOI：10.1002/anie.201201690

  日期：2012.7.9

  Feeling a bit cagey: Morpholino‐based antisense reagents have been caged through oligonucleotide cyclization (see scheme), enabling photocontrol of gene expression in zebrafish embryos and larvae. Using these reagents, the timing of exocrine cell fate commitment in the developing pancreas has been examined.

  感觉有点笼统：基于吗啉代的反义试剂已通过寡核苷酸环化（见方案）被笼子笼罩，从而能够对斑马鱼胚胎和幼虫中的基因表达进行光控制。使用这些试剂，已经检查了发育中的胰腺中外分泌细胞命运承诺的时间。
• Optical Control of MicroRNA Function in Zebrafish Embryos
  作者：Wes Brown、Anirban Bardhan、Kristie Darrah、Michael Tsang、Alexander Deiters

  DOI：10.1021/jacs.2c04479

  日期：2022.9.21