Development of Noncovalent Small-Molecule Keap1-Nrf2 Inhibitors by Fragment-Based Drug Discovery
作者:Dilip Narayanan、Kim T. Tran、Jakob S. Pallesen、Sara M. Ø. Solbak、Yuting Qin、Elina Mukminova、Martina Luchini、Kristina O. Vasilyeva、Dorleta González Chichón、Georgia Goutsiou、Cecilie Poulsen、Nanna Haapanen、Grzegorz M. Popowicz、Michael Sattler、David Olagnier、Michael Gajhede、Anders Bach
DOI:10.1021/acs.jmedchem.2c00830
日期:2022.11.10
constitutes a promising strategy for treating diseases involving oxidative stress and inflammation. Here, a fragment-based drug discovery (FBDD) campaign resulted in novel, high-affinity (Ki = 280 nM), and cell-active noncovalent small-molecule Keap1-Nrf2 PPI inhibitors. We screened 2500 fragments using orthogonal assays─fluorescence polarization (FP), thermal shift assay (TSA), and surface plasmon
针对转录因子核因子红细胞 2 相关因子 2 (Nrf2) 及其阻遏物 Kelch 样 ECH 相关蛋白 1 (Keap1) 之间的蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI),构成了治疗涉及氧化应激的疾病的有前途的策略和炎症。在这里,基于片段的药物发现 (FBDD) 活动产生了新颖的、高亲和力的 ( K i= 280 nM)和细胞活性非共价小分子 Keap1-Nrf2 PPI 抑制剂。我们使用正交分析——荧光偏振 (FP)、热位移分析 (TSA) 和表面等离子共振 (SPR)——筛选了 2500 个片段,并通过饱和转移差分 (STD) NMR 验证了命中,从而产生了 28 个高优先级命中。13 个共结构显示片段主要结合在 Keap1 的 Kelch 结构域的 P4 和 P5 子袋中,并且通过基于结构的药物发现优化了具有新结合模式的三个基于芴酮的片段。因此,我们公开了几个片段命中,包括它们的结合模式,并展示了如何执行