1-(β-D-2-deoxyribofuranosyl)-4-hydroxyaminopyrimidin-2(1H)-one 5'-monophosphate | 2277-58-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: 1-(β-D-2-deoxyribofuranosyl)-4-hydroxyaminopyrimidin-2(1H)-one 5'-monophosphate
• 英文别名: N⁴-OH-dCMP；N⁴-hydroxy-2'-deoxycytidine-5'-monophosphate；2'-Deoxy-n-hydroxycytidine 5'-(dihydrogen phosphate)；[(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-[4-(hydroxyamino)-2-oxopyrimidin-1-yl]oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate
• CAS: 2277-58-9
• 化学式: C₉H₁₄N₃O₈P
• 分子量: 323.199
• InChiKey: YKOWBJJOJNGCAD-SHYZEUOFSA-N

物化性质

• 密度：
  2.04±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.5
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  161
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  二乙酰基-2'脱氧尿苷 在 吡啶 、 三(4-硝基苯基)磷酸酯 、 wheat shoot nucleoside phosphotransferase 、 盐酸羟胺 、 氨 、 三氯氧磷 作用下， 以 甲醇 、 acetate buffer 、 乙腈 为溶剂， 反应 64.5h， 生成 1-(β-D-2-deoxyribofuranosyl)-4-hydroxyaminopyrimidin-2(1H)-one 5'-monophosphate
  参考文献：
  名称：

  5位取代的N（4）-羟基-2'-脱氧胞苷及其5'-单磷酸酯：合成，构象，与肿瘤胸苷酸合酶的相互作用以及体外抗肿瘤活性。

  摘要：

  描述了通过转化各自的5-取代的3'，5'-二-O-乙酰基-2'-来合成5-取代的N（4）-羟基-2'-脱氧胞苷5a，b，dh的简便方法。脱氧尿苷1a-c，eh。这些程序包括在位置C（4）上进行位点特异性三唑基化或N-甲基咪唑基化，然后进行羟胺化并用MeOH-NH（3）进行解封。借助于麦芽磷酸转移酶系统，将核苷5a，b，dh选择性地转化为相应的5′-单磷酸酯6a，b，dh。由（1）H NMR光谱推导并通过分子力学计算证实的D（2）O溶液中每个核苷的构象表明，戊糖环主要存在于构象S（C-2'-endo）和N（ 4）-OH基为顺式旋转异构体。研究了两种L5178Y鼠白血病细胞系对亲本和5-氟-2'-脱氧尿苷（FdUrd）的耐药性对细胞生长的抑制作用，后者对FdUrd的敏感性比前者低70倍。对于耐FdUrd的L5178Y细胞，5-氟-N（4）-羟基-2'-脱氧胞苷（5e）引起的生长抑制作用几乎是F

  DOI：

  10.1021/jm000975u

文献信息

• Thymidylate synthase-catalyzed, tetrahydrofolate-dependent self-inactivation by 5-FdUMP
  作者：Justyna Sobich、Małgorzata Prokopowicz、Piotr Maj、Piotr Wilk、Zbigniew Zieliński、Tomasz Frączyk、Wojciech Rode

  DOI：10.1016/j.abb.2019.108106

  日期：2019.10

  Furthermore, the tetrahydrofolate- and time-dependent, covalent binding by thymidylate synthase of each 5-fluoro-dUMP and N4-hydroxy-dCMP was shown to be accompanied by the enzyme inactivation, as well as spectrophotometrically confirmed dihydrofolate production, the latter demonstrated to depend on the reaction time, thymidylate synthase activity and temperature of the incubation mixture, further documenting

  鉴于先前的晶体学研究，N 4-羟基-dCMP（一种缓慢结合的胸苷酸合酶抑制剂）显然引起了两个胸苷酸合酶催化的反应的“解偶联”，包括N 5,10-亚甲基四氢叶酸一碳基团的转移和还原，表明该酶具有使用四氢叶酸作为辅因子的能力，可在不存在5-亚甲基的情况下还原嘧啶环C（5）。测试后一种解释，研究了使用某些嘧啶脱氧核苷酸，包括5-氟-dUMP和N 4进行TS催化的共价自修饰/自灭活的可能性。-羟基-dCMP，其将由四氢叶酸促进并伴随其平行氧化为二氢叶酸。电泳分析显示，小鼠重组TS蛋白在四氢叶酸存在下形成共价键合的，电泳可分离的5-氟-dUMP-胸苷酸合酶复合物，类似于在N 5,10-亚甲基四氢叶酸存在下产生的蛋白。小鼠酶与5-fluoro-dUMP / N 4结合的进一步研究TCA将复合物沉淀在滤纸上产生的-羟基-dCMP表明，它是由四氢叶酸促进的，并且取决于分钟范围内的时间和酶的分子活性，表明胸
• Interaction of N4-hydroxy-2'-deoxycytidylic acid with thymidylate synthetase
  作者：Sanford Goldstein、Alfonso L. Pogolotti、Edward P. Garvey、Daniel V. Santi

  DOI：10.1021/jm00376a004

  日期：1984.10

  The interaction of dTMP synthetase with N4-hydroxy-2'-deoxycytidylate (N4-HOdCMP) has been investigated. With use of standard assay conditions, N4-HOd-CMP is a competitive inhibitor with an apparent Ki of 8.0 microM. Incubation of N4-HOdCMP with dTMP synthetase in the presence of 5,10-methylenetetrahydrofolate (CH2-H4folate) resulted in a rapid time-dependent inactivation of the enzyme which was not

  已经研究了dTMP合成酶与N4-羟基-2'-脱氧胞苷（N4-HOdCMP）的相互作用。使用标准测定条件，N4-HOd-CMP是一种竞争性抑制剂，表观Ki为8.0 microM。在5,10-亚甲基四氢叶酸（CH2-H4叶酸）存在下，将N4-HOdCMP与dTMP合成酶一起温育会导致该酶快速的时间依赖性失活，这不是一阶的，并且形成了可以在硝酸纤维素滤膜上分离的复合物膜。通过使用放射性配体，可分离的天然复合物显示每摩尔二聚体酶具有2摩尔N4-HOdCMP和2摩尔 -H4叶酸。N4-HOdCMP的表观解离常数为1.0 microM。三元配合物的紫外差光谱显示出嘧啶发色团的损失，该发色团在用NaDodSO 4变性后不再出现。N4-HOdCMP与三元复合物的解离速率是双相的，其中一半的初始结合配体与t 1/2的解离度为2.3分钟，其余与t 1/2的解离度为13分钟。当N4-HOdCMP- -H