Resin and Magnetic Nanoparticle-Based Free Radical Probes for Glycan Capture, Isolation, and Structural Characterization
作者:Kimberly Fabijanczuk、Kaylee Gaspar、Nikunj Desai、Jungeun Lee、Daniel A. Thomas、J. L. Beauchamp、Jinshan Gao
DOI:10.1021/acs.analchem.9b01303
日期:2019.12.17
avoiding glycan rearrangement during collisional activation. The free radical precursor generates a nascent free radical upon collisional activation and thus simultaneously induces systematic and predictable fragmentation for glycan structure elucidation. A radical-driven glycan deconstruction diagram (R-DECON) is developed to visually summarize the MS2 results and thus allow for the assembly of the
通过结合固相支持物和自由基激活聚糖测序(FRAGS)试剂的优点,我们开发了一种多功能的固相支持的自由基探针(SS-FRAGS),可实现聚糖的富集和表征。SS-FRAGS包含固体载体,自由基前体,二硫键,吡啶基和肼基。选择硫醇活化的树脂和磁性纳米颗粒(MNP)作为固体载体,以通过肼部分选择性捕获游离聚糖,从而使其富集和分离。二硫键充当固体支持物和捕获的聚糖之间的临时共价键,从而允许二硫苏糖醇通过二硫键的裂解释放聚糖。吡啶基碱性官能团为固定电荷的形成提供了一个位置,可以通过质谱进行检测,并避免了碰撞激活过程中的聚糖重排。自由基前体在碰撞活化时产生新生的自由基,因此同时诱导了系统的和可预测的片段化,以阐明聚糖结构。开发了自由基驱动的聚糖解构图(R-DECON),以直观地总结MS2结果,从而允许组装聚糖骨架,从而使同量异位聚糖异构体的区分变得明确。对于实际样品,我们通过分析从RNase-B酶切得到