6-(2,5-Dioxopyrrolidin-1-yl)pyridine-3-sulfonyl chloride | 2173999-92-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡啶及其衍生物
• 英文名称: 6-(2,5-Dioxopyrrolidin-1-yl)pyridine-3-sulfonyl chloride
• CAS: 2173999-92-1
• 化学式: C₉H₇ClN₂O₄S
• 分子量: 274.685
• InChiKey: DXXRTCORBYSAML-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.22
• 拓扑面积：
  92.8
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-(2,5-Dioxopyrrolidin-1-yl)pyridine-3-sulfonyl chloride 在 1-羟基苯并三唑 、 三乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 N-[(2-amino-2-adamantyl)methyl]-4-[[6-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)pyridin-3-yl]sulfonyl]-2-methylmorpholine-2-carboxamide trifluoroacetate
  参考文献：
  名称：

  挖掘可处理案例的 PDB，其中 X 射线晶体学结合片段筛选可用于系统地设计蛋白质-蛋白质抑制剂：IL1β-IL1R 和 p38α-TAB1 复合物说明的两个测试案例。

  摘要：

  如今，可以以中等通量的方式将 X 射线晶体学和片段筛选相结合，以化学方式探测蛋白质使用的表面相互作用，并利用筛选结果系统地设计蛋白质 - 蛋白质抑制剂。为了证明这一点，我们首先对蛋白质数据库蛋白质复合物进行了生物信息学分析，该分析揭示了 400 多种情况，其中游离形式的靶标的晶格使得大部分相互作用表面没有晶格接触，因此在浸泡过程中可以接触到碎片。在确定的易处理复合物中，我们随后对两个特别有趣的案例进行了单碎片晶体筛选：Il1β-ILR 和 p38α-TAB1 复合物。筛选结果显示片段倾向于成簇结合，突出显示目标蛋白表面的小分子热点。在大多数情况下，热点与相互作用蛋白质的结合位点重叠。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.0c00403