methyl 3-[(6-bromoindol-1-yl)methyl]benzoate | 1613153-37-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: methyl 3-[(6-bromoindol-1-yl)methyl]benzoate
• 英文别名: 3-[(6-bromo-1H-indol-1-yl)-methyl]-benzoic acid methyl ester
• CAS: 1613153-37-9
• 化学式: C₁₇H₁₄BrNO₂
• 分子量: 344.208
• InChiKey: KGDYREMXSUIXTK-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.1
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.12
• 拓扑面积：
  31.2
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 3-[(6-bromoindol-1-yl)methyl]benzoate 在 氨 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 以40 %的产率得到3-[(6-Bromoindol-1-yl)methyl]benzamide
  参考文献：
  名称：

  (杂芳基甲基)苯甲酸作为一类新型细菌胱硫醚 γ-裂解酶抑制剂：合成、生物学评价和分子模型

  摘要：

  抗生素耐药性是全球最严重的健康威胁之一。因此，需要开发具有新作用机制的抗菌剂。靶向细菌胱硫醚γ-裂解酶（bCSE）是一种细菌生存所必需的酶，是克服抗生素耐药性的一种有前途的方法。在这里，我们描述了一系列（杂芳基甲基）苯甲酸衍生物，并使用已知的 bCSE 抑制剂 NL2 作为先导化合物评估了它们抑制 bCSE 或其人类直系同源物 hCSE 的能力。带有 6-溴吲哚基团的衍生物被证明是最活跃的，IC 50值在中微摩尔范围内，并且对 bCSE 的选择性高于 hCSE。此外，这些化合物均未对 HEK293T 细胞表现出明显的毒性。通过基于配体和基于结构的分子建模分析使获得的数据合理化。还发现最活跃的化合物是几种广泛使用的抗菌剂的有效辅助剂，可对抗临床相关的抗生素耐药菌株，例如金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌和铜绿假单胞菌。最有效的化合物3h和3i也显示出良好的体外吸收、分布、代谢和排泄 (ADME)

  DOI：

  10.1021/acsinfecdis.4c00136
• 作为产物：
  描述：

  6-溴吲哚 、 3-(溴甲基)苯甲酸甲酯 在 sodium hydride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 mineral oil 为溶剂， 以60 %的产率得到methyl 3-[(6-bromoindol-1-yl)methyl]benzoate
  参考文献：
  名称：

  (杂芳基甲基)苯甲酸作为一类新型细菌胱硫醚 γ-裂解酶抑制剂：合成、生物学评价和分子模型

  摘要：

  抗生素耐药性是全球最严重的健康威胁之一。因此，需要开发具有新作用机制的抗菌剂。靶向细菌胱硫醚γ-裂解酶（bCSE）是一种细菌生存所必需的酶，是克服抗生素耐药性的一种有前途的方法。在这里，我们描述了一系列（杂芳基甲基）苯甲酸衍生物，并使用已知的 bCSE 抑制剂 NL2 作为先导化合物评估了它们抑制 bCSE 或其人类直系同源物 hCSE 的能力。带有 6-溴吲哚基团的衍生物被证明是最活跃的，IC 50值在中微摩尔范围内，并且对 bCSE 的选择性高于 hCSE。此外，这些化合物均未对 HEK293T 细胞表现出明显的毒性。通过基于配体和基于结构的分子建模分析使获得的数据合理化。还发现最活跃的化合物是几种广泛使用的抗菌剂的有效辅助剂，可对抗临床相关的抗生素耐药菌株，例如金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌和铜绿假单胞菌。最有效的化合物3h和3i也显示出良好的体外吸收、分布、代谢和排泄 (ADME)

  DOI：

  10.1021/acsinfecdis.4c00136

文献信息

• Investigation of the molecular characteristics of bisindole inhibitors as HIV-1 glycoprotein-41 fusion inhibitors
  作者：Guangyan Zhou、Shidong Chu、Ariana Nemati、Chunsheng Huang、Beth A. Snyder、Roger G. Ptak、Miriam Gochin

  DOI：10.1016/j.ejmech.2018.10.048

  日期：2019.1

  each of the ring systems and various substituents to compound potency. Hydrophobicity, polarity and charge were varied to produce 35 new compounds that were evaluated in binding, cell-cell fusion and viral infectivity assays. We found that (a) activity based solely on increasing hydrophobic content plateaued at ∼ 200 nM; (b) the bisindole scaffold surpassed other heterocyclic ring systems in efficacy;

  在以前的工作中，我们描述了靶向6到6-6'-双吲哚化合物作为HIV-1融合有效抑制剂的病毒糖蛋白41 N七重复序列区域上的疏水口袋。具有亚微摩尔IC50的两种有前途的化合物包含一个苯甲酸基团和一个连接在两个吲哚氮原子上的苯甲酸酯基。在这里，我们进行了详尽的结构-活性关系（SAR）研究，评估了每个环系统和各种取代基对化合物效能的贡献。改变疏水性，极性和电荷以产生35种新化合物，这些化合物在结合，细胞-细胞融合和病毒感染性测定中进行了评估。我们发现（a）活性仅基于增加的疏水性含量稳定在约200 nM；（b）双吲哚支架的功效超过其他杂环系统；（c）可能在口袋中涉及Gln575的极性相互作用可以取代特异性较低的疏水相互作用；（d）苯甲酸酯部分似乎没有与袋形成特定的接触。该疏水基团对化合物效价的重要性表明了一种机制，在融合过程中它可能与第三组分（例如膜）相互作用。与较早的化合物相比，发现了一种有前途
• Structure–Activity Relationship Studies of Indole-Based Compounds as Small Molecule HIV-1 Fusion Inhibitors Targeting Glycoprotein 41
  作者：Guangyan Zhou、Vladimir Sofiyev、Hardeep Kaur、Beth A. Snyder、Marie K. Mankowski、Priscilla A. Hogan、Roger G. Ptak、Miriam Gochin

  DOI：10.1021/jm500344y

  日期：2014.6.26

  described indole-containing compounds with the potential to inhibit HIV-1 fusion by targeting the hydrophobic pocket of transmembrane glycoprotein gp41. Here we report optimization and structure–activity relationship studies on the basic scaffold, defining the role of shape, contact surface area, and molecular properties. Thirty new compounds were evaluated in binding, cell–cell fusion, and viral replication

  我们之前描述了通过靶向跨膜糖蛋白 gp41 的疏水口袋来抑制 HIV-1 融合的含吲哚化合物。在这里，我们报告了基本支架的优化和构效关系研究，定义了形状、接触表面积和分子特性的作用。在结合、细胞-细胞融合和病毒复制试验中评估了 30 种新化合物。低于 1 μM 阈值，结合和生物活性之间的相关性减弱，表明细胞活性需要两亲性。最活跃的抑制剂6j表现出 0.6 μM 的结合亲和力和 0.2 μM EC 50抗细胞 - 细胞融合和活病毒复制，并且对 T20 抗性菌株有活性。具有相同连接性的 22 种化合物在对接计算中显示出一致的姿势，其排列顺序与生物活性相匹配。这项工作提供了对 HIV-1 融合的小分子抑制要求的深入了解，并证明了一种有效的低分子量融合抑制剂。
• 一种抗艾滋病吲哚类化合物及其制备方法和其应用
  申请人：东莞理工学院

  公开号：CN108976158A

  公开（公告）日：2018-12-11

  本发明提供了一种抗艾滋病吲哚类化合物及其制备方法和其应用。本发明具体合成的两个新型吲哚化合物式g(R1＝R2＝H，R3＝OMe和R1＝R2＝H,R3＝COOH)具有较高的抗病毒活力且细胞毒性较小，细胞内抗HIV‑1病毒活性EC50分别为0.81μM和0.78μM，细胞毒性CC50分别为16μM，16μM，是一种新型进入宿主细胞抑制剂化合物。本发明还提供了一种反应条件温和、原料易得、操作简便、路线简单、合成步骤少的合成路线，成功制备出本了发明提供的具有高抗HIV‑1活性的吲哚类化合物。
• Multi-hydroxyl POSS supported iridium complexes as a recyclable catalyst for selective synthesis of N-/C-substituted indoles and the total synthesis of HIV-1 fusion inhibitor
  作者：Jiahao Li、Li Chen、Likui Wang、Gang Shi、Dawei Wang

  DOI：10.1016/j.jcat.2023.115205

  日期：2024.1

  pyridyl-thiadiazole ligand has been designed, synthesized, and employed in the preparation of a heterogeneous iridium catalyst supported on multi-hydroxyl polyhedral oligomeric silsesquioxane. The as-prepared catalyst exhibits excellent catalytic activity in the one-pot cascade selective synthesis of N-/C-substituted indole derivatives from amino alcohols and alcohols borrowing hydrogen strategy. Meanwhile

  设计、合成了一种新型吡啶基噻二唑配体，并将其用于制备负载在多羟基多面体低聚倍半硅氧烷上的非均相铱催化剂。所制备的催化剂在利用氢策略从氨基醇和醇一锅级联选择性合成N-/C-取代吲哚衍生物中表现出优异的催化活性。同时，观察到该方法具有良好的官能团耐受性和广泛的底物范围。值得注意的是，通过采用该催化系统，只需四步“借氢”策略，就可以方便地从 2-氨基苯乙醇衍生物和苯甲醇合成出针对 gp41 介导的 HIV-1 融合核心结构的抑制剂，总产率为 41%。机理探索表明，这种转化经历了级联过程，包括通过借氢策略进行 N/C 烷基化和氧化环化。回收实验表明，该催化剂可以很容易地回收并重复使用至少七次，并且具有良好的TON。