[Cu(bis(2-pyridylcarbonyl)amidato)(H2O)2](NO3) * 2 H2O

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡啶及其衍生物
• 英文名称: [Cu(bis(2-pyridylcarbonyl)amidato)(H2O)2](NO3) * 2 H2O
• 英文别名: [Cu(bis(2-pyridyl)carbonylamidate)(H2O)2]NO3 * 2 H2O；[Cu(bis(2-pyridylcarbonyl)amidate)(H2O)2]NO3*2H2O；copper;(2E)-N-(pyridine-2-carbonyl)pyridine-2-carboximidate;nitrate;hydrate
• 化学式: C₁₂H₈N₃O₂*Cu*4H₂O*NO₃
• 分子量: 423.826
• InChiKey: KHPDDHMLZLNUCZ-UHFFFAOYSA-M

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.64
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.0
• 拓扑面积：
  142
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  potassium 1,3-dithiosquarate dihydrate 、 [Cu(bis(2-pyridylcarbonyl)amidato)(H2O)2](NO3) * 2 H2O 以 水 为溶剂， 以99%的产率得到[Cu2(bis(2-pyridyl)carbonylamidate)2(1,3-dithiosquarate)]* 2 H2O
  参考文献：
  名称：

  Castro, Isabel; Catalayud, Maria Luisa; Sletten, Jorunn, Inorganic Chemistry, 1999, vol. 38, p. 4680 - 4687

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  水 、 2,4,6-三(2-吡啶基)三嗪 、 copper(II) nitrate trihydrate 在 potassium hydroxide 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 以57%的产率得到[Cu(bis(2-pyridylcarbonyl)amidato)(H2O)2](NO3) * 2 H2O
  参考文献：
  名称：

  [Cu(吡啶二甲酰胺)(NO3)(H2O)]作为抗COVID-19和抗菌候选药物：设计、合成、晶体结构、DFT和分子对接

  摘要：

  2,4,6-ris(2-吡啶基)-,3,5-三嗪与CuNO 3 ·3H 2 O水溶液反应，首次获得了新的N-吡啶甲酰吡啶甲酰胺作为原位配体，并形成了相应的配合物[Cu(吡啶二甲酰胺)(NO 3 )(H 2 O)]。通过X射线结构测定所得络合物的晶体结构。该配合物在空间群 P2 1 /n 中结晶， a = 10.2782(9) Å, b = 7.5173(6) Å, c = 17.738(2) Å, α = 90.00°, β = 91.368(1)°, γ = 90.00°， V = 1370.1(2) Å3， Z = 4。铜中心具有扭曲的八面体几何形状。 DFT 计算显示理论数据和 X 射线数据之间具有良好的一致性。进行分子对接研究是为了考虑合成的化合物与革兰氏菌（大肠杆菌，PDB ID：6lu7）受体的 COVID-19 主要蛋白酶病毒蛋白受体（PDB ID：6lu7）的结合性质和结合亲和力。

  DOI：

  10.1016/j.molstruc.2021.131348

文献信息

• Formation in solution, synthesis and crystal structure of μ-oxalatobis[bis(2-pyridylcarbonyl)amido] dicopper(II)
  作者：Isabel Castro、Juan Faus、Miguel Julve、Miquel Mollar、Angeles Monge、Enrique Gutierrez-Puebla

  DOI：10.1016/s0020-1693(00)90121-x

  日期：1989.7

  of oxalate occupying the apical position. The stability constants of the oxalato complexes of bis(2-pyridylcarbonyl)amidocopper( II ) have been determined in dimethyl sulphoxide solution: log β 111 =12.22 ± 0.05, log β 110 =7.0 ± 0.1 and logβ 210 =10.25 ± 0.1 at 25 °C and 0.1 mol dm −3 tetra-n-butylammonium perchlorate. Coordination modes of oxalate for this system are compared in DMSO and water in

  摘要合成了化合物μ-草酸双[双（2-吡啶基羰基）酰胺基]双铜（II），[Cu 2 （NCsH 5 CO）2 N} 2-（C 2 O 4）]，并通过光谱，EPR和质谱对其进行了表征。衍射法。它在三斜晶空间群P 1中以晶胞常数结晶：a = 7.6793（6），b = 9.238（2），c = 10.007（2）A，α= 83.80（1），β= 68.37（1）和γ = 69.44（1）°；V = 617.7（3）A 3，D（计算，Z = 2）= 1.80 g cm -3，M r = 667.6，F（000）= 336，λ，（MoKα）= 0.71069 A，μ（Mo Kα）＝ 17.895cm -1，T ＝ 295K。在1≤θ≤30°的范围内，总共收集到3587个数据。其中，2391（独立且具有I⩾2σ（I））用于结构分析。最终的R和R w残差分别为0.049和0.053。该结构由中性中心对称双核实体组成，其中C
• Syntheses, crystal structures and magnetic properties of mono- and polynuclear [bis(2-arylcarbonyl)amidate]copper(II) complexes
  作者：Danielle Cangussu de Castro Gomes、Luminita Marilena Toma、Humberto O. Stumpf、Harry Adams、Jim A. Thomas、Francesc Lloret、Miguel Julve

  DOI：10.1016/j.poly.2007.10.017

  日期：2008.2

  neutral di-μ-1,1-azidobis[(aqua)(bpcam)copper(II)] dinuclear and aqua(azido)(bpcam)copper(II) mononuclear units. The copper–copper separation in the dinuclear entity is 3.730(5) Å. The structure of 4 consists of neutral di-μ-1,3-dcabis[(aqua)(bpcam)copper(II)] units, the intramolecular copper–copper distance being 5.701(3) Å. Compound 5 is a uniform copper(II) chain where the [Cu(bpca)]+ units are connected

  五个具有式[Cu（bpcam）（CN）（H 2 O）]（1），[Cu（bpcam）（N 3）（H 2 O）] 2（2），[Cu（bpcam ）（NCS）（H 2 O）]（3），[Cu（bpcam）（dca）（H 2 O）] 2（4）和[Cu（bpca）（tcm）] n（5）[bpcam = bis制备了（2-嘧啶基羰基）酰胺酸酯，bpca ＝双（2-吡啶基羰基）酰胺酸酯，dca ＝双氰胺，tcm ＝三氰胺]，并通过单晶X射线衍射确定了它们的结构。化合物1和3是单核物种，其中每个铜原子与一个三齿bpcam和一个末端结合的氰化物（1）/硫氰酸盐（3）配体配位，形成一个基面，在扭曲的方金字塔的轴向上有一个水分子。化合物2由中性的双-μ-1,1-叠氮双[（水）（bpcam）铜（II）]双核和水（叠氮）（bpcam）铜（II）单核单元组成。双核实体中的铜-铜间距为3.730（5）Å。4的结构由中性di-μ-1
• Carbon dioxide uptake by [Cu(bpca)]⁺: synthesis, crystal structure, and magnetic properties of {[Na(H₂O)₂][Cu₂(bpca)₂(CO₃)(HCO₃)]}_<i>n</i> [Hbpca = bis(2-pyridylcarbonyl)amide]
  作者：Rafaela M. R. da Silva、Iara M. L. Rosa、Willian X. C. Oliveira、Odivaldo C. Alves、Evelyn C. S. Santos、Flávio Garcia、Henrique C. Silva Junior、Glaucio B. Ferreira、Guilherme P. Guedes、Walace D. do Pim、Miguel Julve、Maria Vanda Marinho

  DOI：10.1039/d2nj05268g

  日期：——

  report on the preparation, spectroscopic and thermal characterization, structural study, and magnetic investigation of a new heterobimetallic coordination polymer (CP) of formula [Na(H2O)2][Cu2(bpca)2(CO3)(HCO3)]}n (1) [Hbpca = bis(2-pyridylcarbonyl)amide], which was isolated through the fixation of aerial carbon dioxide by the preformed [Cu(bpca)]+ complex in basic water/DMSO solvent mixtures. Compound

  在此，我们报告了一种新型异双金属配位聚合物 (CP) 的制备、光谱和热表征、结构研究和磁性研究，其分子式为 [Na(H 2 O) 2 ][Cu 2 (bpca) 2 (CO 3 ) (HCO 3 )]} n ( 1 ) [Hbpca = bis(2-pyridylcarbonyl)amide]，通过预先形成的 [Cu(bpca)] +复合物在碱性水/DMSO 溶剂混合物中固定空气中的二氧化碳来分离. 化合物1由平行于晶体c生长的中性异双金属锯齿形链组成碳酸盐、碳酸氢盐和 bpca 阴离子充当桥的轴，一对 [Cu(bpca)] +单元和一个 [Na(H 2 O) 2 ] +片段有规律地交替。两个晶体学上独立的铜 ( II ) 离子（Cu1 和 Cu2）在稍微扭曲的方形金字塔环境中是五配位的，具有来自 bpca 配体的三个氮原子和一个碳酸氢根 - 氧（Cu1）或碳酸盐 - 氧（Cu2）基面和顶端位置的共享碳酸盐-氧原子（Cu1
• Synthesis, crystal structure and magnetic properties of the first structurally characterized 1,2-dithiocroconato-containing Cu(II) complex, [Cu(bpca)(H2O)]2[Cu(1,2-dtcr)2]·2H2O
  作者：Jorunn Sletten、Miguel Julve、Francesc Lloret、Isabel Castro、Gunther Seitz、Klaus Mann

  DOI：10.1016/s0020-1693(96)05232-2

  日期：1996.9

  Abstract The first crystal and molecular structure of a transition metal complex containing 1,2-dithiocroconate (1,2-dtcr, dianion of 1,2-dimercaptocylopent-1-ene-3,4,5-trione), [Cu(bpca)(H2O)]2[Cu(1,2-dtcr)2]·2H2O (where bpca is the bis(2-pyrdidylcarbonyl)amide anion), has been determined by single crystal X-ray diffraction methods. The compound crystallizesin the monoclinic syste, space group P21/c

  摘要含1,2-二硫代丙酮酸（1,2-dtcr，1,2-二巯基环戊基-1-烯-3,4,5-三酮的二价阴离子）[[Cu（bpca （H 2 O）] 2 [Cu（1,2-dtcr）2]·2H 2 O（其中bpca是双（2-吡啶基羰基）酰胺阴离子），已经通过单晶X射线衍射法测定。该化合物在单斜晶系空间群P21 / c中结晶，a = 11.661（3），b = 20.255（6），c = 8.265（3）A，s = 107.26（2）°，Z =2。结构由[Cu（1,2-dtcr）2] 2-和[Cu（bpca）（H2O）] +离子和水合水正式建成。阴离子的铜原子位于晶体转化中心，以平面，近似正方形的方式与四个硫原子键合。在阳离子中，铜的赤道面由bpca配体的三个氮原子和一个水氧原子形成。另外，与阴离子中的1,2-dtcr配体的硫原子之一之间的轴向键非常弱。通过这些后面的弱键，每个阴离子都连接到两个阳离
• [Cu(dipicolinoylamide)(NO3)(H2O)] as anti-COVID-19 and antibacterial drug candidate: Design, synthesis, crystal structure, DFT and molecular docking
  作者：Laila H. Abdel-Rahman、Maram T. Basha、Badriah Saad Al-Farhan、Mohamed R. Shehata、Shaaban K. Mohamed、Youssef Ramli

  DOI：10.1016/j.molstruc.2021.131348

  日期：2022.1

  solution of CuNO3·3H2O and formed the corresponding complex [Cu(dipicolinoylamide)(NO3)(H2O)]. The crystal structure of the obtained complex was determined by x-ray structure. The complex crystallizes in space group P21/n, a = 10.2782(9) Å, b = 7.5173(6) Å, c = 17.738(2) Å, α = 90.00°, β = 91.368(1)°, γ = 90.00°, V = 1370.1(2) Å3, Z = 4. The copper center has a distorted octahedral geometry. DFT calculations

  2,4,6-ris(2-吡啶基)-,3,5-三嗪与CuNO 3 ·3H 2 O水溶液反应，首次获得了新的N-吡啶甲酰吡啶甲酰胺作为原位配体，并形成了相应的配合物[Cu(吡啶二甲酰胺)(NO 3 )(H 2 O)]。通过X射线结构测定所得络合物的晶体结构。该配合物在空间群 P2 1 /n 中结晶， a = 10.2782(9) Å, b = 7.5173(6) Å, c = 17.738(2) Å, α = 90.00°, β = 91.368(1)°, γ = 90.00°， V = 1370.1(2) Å3， Z = 4。铜中心具有扭曲的八面体几何形状。 DFT 计算显示理论数据和 X 射线数据之间具有良好的一致性。进行分子对接研究是为了考虑合成的化合物与革兰氏菌（大肠杆菌，PDB ID：6lu7）受体的 COVID-19 主要蛋白酶病毒蛋白受体（PDB ID：6lu7）的结合性质和结合亲和力。