达托霉素杂质 | 1429504-48-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 中文名称: 达托霉素杂质
• 英文名称: (2S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-4-[2-[formyl-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonyl]amino]phenyl]-4-oxobutanoic acid
• CAS: 1429504-48-2
• 化学式: C₃₁H₃₀N₂O₈
• 分子量: 558.588
• InChiKey: DYKDQJGTAYUDIW-VWLOTQADSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.5
• 重原子数：
  41
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.26
• 拓扑面积：
  139
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  达托霉素杂质 在 氯化亚砜 、 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 反应 4.5h， 生成 Fmoc-Kyn(Boc,CHO)-OH
  参考文献：
  名称：

  使用Fmoc SPPS稳定的犬尿氨酸合成子高产率固相合成达托霉素

  摘要：

  描述了达托霉素的高产全合成，达托霉素是一种重要的临床抗生素。键这一合成的发展是发生在固相一坎普斯环化反应的阐明时常规使用的犬尿氨酸（的Kyn）合成子，如将Fmoc-大号-Kyn（BOC，CHO）-OH和的Fmoc-大号- Kyn（CHO，CHO）-OH暴露于20％2-甲基哌啶（2MP）/ DMF中。在达托霉素的合成过程中，这种副反应伴随着棘手的肽分解，这导致Dap和含4-喹诺酮的肽产率低。当Boc- L -Kyn（Boc，CHO）-O t -Bu和Boc- L出现在溶液中时，发生了Camps环化反应使-Kyn（CHO，CHO）-OMe暴露于20％2MP / DMF，得到相应的4-喹诺酮氨基酸。相反，Boc- L- Kyn（CHO）-OMe在这些条件下是稳定的，表明从上述结构单元中除去一个吸电子基团可防止2MP / DMF中的烯化。因此，使用Fmoc- L -Kyn（Boc）-OH开发了达托霉素的新合成方法，该方法从Fmoc-

  DOI：

  10.1039/d0ob02504f
• 作为产物：
  描述：

  Fmoc-L-色氨酸(Boc)-OH 在 臭氧 、 二甲基硫 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.08h， 生成 达托霉素杂质
  参考文献：
  名称：

  Effective synthesis of kynurenine-containing peptides via on-resin ozonolysis of tryptophan residues: synthesis of cyclomontanin B

  摘要：

  由于犬尿氨酸在偶联反应中的反应性较低，制备含有犬尿氨酸的肽是困难的。在本报告中，通过对应含有色氨酸的肽的树脂上臭氧分解，有效地获得了含有犬尿氨酸的肽。此外，结合丝氨酸/苏氨酸连接（STL）介导的环化，通过这一策略还合成了含有犬尿氨酸的环状肽，环蒙坦宁B。

  DOI：

  10.1039/c3ob41631c

文献信息

• Solid-Phase Total Synthesis of Daptomycin and Analogs
  作者：Chuda Raj Lohani、Robert Taylor、Michael Palmer、Scott D. Taylor

  DOI：10.1021/acs.orglett.5b00043

  日期：2015.2.6

  An entirely solid-phase synthesis of daptomycin, a cyclic lipodepsipeptide antibiotic currently in clinical use, was achieved using a combination of α-azido and Fmoc amino acids. This methodology was applied to the synthesis of several daptomycin analogs, one of which did not contain kynurenine or the synthetically challenging amino acid (2S,3R)-methylglutamate yet exhibited an MIC approaching that of daptomycin.
• Total Synthesis of Daptomycin by Cyclization via a Chemoselective Serine Ligation
  作者：Hiu Yung Lam、Yinfeng Zhang、Han Liu、Jianchao Xu、Clarence T. T. Wong、Ci Xu、Xuechen Li

  DOI：10.1021/ja4012468

  日期：2013.4.24

  A total synthesis of daptomycin, the first natural product antibiotic launched in a generation, was achieved. This convergent synthesis relies on an efficient macrocyclization via a serine ligation to assemble the 31-membered cyclic depsipeptide. The difficult esterification by the nonproteinogenic amino acid kynurenine was accomplished via the esterification of a threonine residue by a suitably protected Trp ester, followed by ozonolysis. This synthesis provides a foundation and framework to prepare varied analogues of daptomycin to establish its structure-activity profile.