diisopropyl (3R,4R)-2-(4-(adenin-9-yl)-3-hydroxypyrrolidin-1-yl)ethylphosphonate | 1159014-46-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 英文名称: diisopropyl (3R,4R)-2-(4-(adenin-9-yl)-3-hydroxypyrrolidin-1-yl)ethylphosphonate
• 英文别名: diisopropyl 2-[(3R,4R)-3-(adenin-9-yl)-4-hydroxypyrrolidin-1-yl]ethylphosphonate；(3R,4R)-4-(6-aminopurin-9-yl)-1-[2-[oxido-di(propan-2-yloxy)phosphaniumyl]ethyl]pyrrolidin-3-ol
• CAS: 1159014-46-6
• 化学式: C₁₇H₂₉N₆O₄P
• 分子量: 412.429
• InChiKey: JRSULKYDWGRFKD-ZIAGYGMSSA-N

物化性质

• 沸点：
  633.4±65.0 °C(predicted)
• 密度：
  1.48±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.3
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.71
• 拓扑面积：
  135
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  diisopropyl (3R,4R)-2-(4-(adenin-9-yl)-3-hydroxypyrrolidin-1-yl)ethylphosphonate 在 三甲基溴硅烷 、 水 、 tetraethylammonium borohydride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以52%的产率得到(3R,4R)-2-(4-(adenin-9-yl)-3-hydroxypyrrolidin-1-yl)ethylphosphonic acid
  参考文献：
  名称：

  吡咯烷N-烷基膦酸酯及相关核苷酸类似物：合成与立体化学

  摘要：

  合成了N-膦酰基烷基-反式-3,4-二羟基吡咯烷衍生物，并将其用作合成子来制备羟基吡咯烷核苷膦酸，即3'-脱氧核苷5'-磷酸类似物。同时，研究了另一种途径，即利用曼尼希和迈克尔型反应对预先形成的吡咯烷核苷进行N-磷酸烷基化，以获得所需的核苷酸类似物。与后一种方法相反，前一种方法很可能由于亲核置换过程中存在两个可能的S N 2过渡态而形成了两个非对映异构体。通过NMR光谱研究了所制备的核苷酸类似物的立体化学。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2009.02.071
• 作为产物：
  描述：

  (3R,4R)-4-(adenin-9-yl)-3-hydroxypyrrolidine 、 diisopropyl vinylphosphonate 以 甲醇 为溶剂， 反应 120.0h， 以69%的产率得到diisopropyl (3R,4R)-2-(4-(adenin-9-yl)-3-hydroxypyrrolidin-1-yl)ethylphosphonate
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and hybridization of oligonucleotides modified at AMP sites with adenine pyrrolidine phosphonate nucleotides

  摘要：

  三种结构多样的保护吡咯烷基核苷酸膦酸酯被制备为单体，用于在固相上引入吡咯烷核苷酸单元到修饰寡核苷酸中。采用两种不同的化学方法来合成修饰和天然单元：前者采用磷酸三酯法，即含有连接到吡咯烷环氮原子的N-膦酸烷基和N-膦酸酰基的单体，后者采用磷酸酰胺化学方法。由于合成的吡咯烷基核苷酸膦酸是3'-去氧核苷酸5'-膦酸的近似物，因此将一个修饰单元引入到寡核苷酸中会产生一个2',5'间核苷酸连接。一系列包含两个或三个修饰单元的九聚体以及完全修饰的腺嘌呤15聚体是以相反的顺序合成的，即从链的5'端到3'端。测量修饰九聚体与互补链形成的复合物的热特性表明，引入修饰会导致复合物不稳定。在所有测试的修饰寡核苷酸中，修饰腺嘌呤同源寡核苷酸与寡胸苷酸形成的复合物具有最稳定的ΔTm值。

  DOI：

  10.1135/cccc2009022