Structure-Based Design of Inhibitors Selective for Human Proteasome β2c or β2i Subunits
作者:Bo-Tao Xin、Eva M. Huber、Gerjan de Bruin、Wolfgang Heinemeyer、Elmer Maurits、Christofer Espinal、Yimeng Du、Marissa Janssens、Emily S. Weyburne、Alexei F. Kisselev、Bogdan I. Florea、Christoph Driessen、Gijsbert A. van der Marel、Michael Groll、Herman S. Overkleeft
DOI:10.1021/acs.jmedchem.8b01884
日期:2019.2.14
Subunit-selective proteasome inhibitors are valuable tools to assess the biological and medicinal relevance of individual proteasome active sites. Whereas the inhibitors for the β1c, β1i, β5c, and β5i subunits exploit the differences in the substrate-binding channels identified by X-ray crystallography, compounds selectively targeting β2c or β2i could not yet be rationally designed because of the high structural
亚单位选择性蛋白酶体抑制剂是评估单个蛋白酶体活性位点生物学和医学相关性的有价值的工具。尽管β1c,β1i,β5c和β5i亚基的抑制剂利用了X射线晶体学鉴定的底物结合通道的差异,但由于这些化合物的高度结构相似性,因此尚无法合理设计选择性靶向β2c或β2i的化合物两个亚单位。在这里,我们报告了一个化合物库的开发,化学合成和生物学筛选,该过程导致了对β2c和β2i选择性化合物LU-002c的鉴定(4; IC50β2c:8 nM,IC50β2i/β2c:40-倍数)和LU-002i(5; IC50β2i:220 nM,IC50β2c/β2i:45倍)。具有β2人源化酵母蛋白酶体的共晶体结构可可视化对于亚基特异性至关重要的蛋白质-配体相互作用。总而言之,有机合成,基于活性的蛋白质谱分析,酵母诱变和结构生物学使我们能够破译β2底物结合通道的显着差异,并完成了一组亚基选择性蛋白酶体抑制剂的研究。