2-((6-(benzo[b]thiophen-2-yl)thieno[3,2-d]pyrimidin-4-yl)thio)acetic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 双噻吩和低聚噻吩
• 英文名称: 2-((6-(benzo[b]thiophen-2-yl)thieno[3,2-d]pyrimidin-4-yl)thio)acetic acid
• 英文别名: Sgc-stk17B-1；2-[6-(1-benzothiophen-2-yl)thieno[3,2-d]pyrimidin-4-yl]sulfanylacetic acid
• 化学式: C₁₆H₁₀N₂O₂S₃
• 分子量: 358.466
• InChiKey: BNYXRPMABDQJJR-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.5
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.06
• 拓扑面积：
  145
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  4-氯噻吩并[3,2-d]嘧啶 在 bis-triphenylphosphine-palladium(II) chloride 、 potassium carbonate 、 三乙胺 、 lithium hydroxide 、 lithium diisopropyl amide 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 乙醇 、 水 为溶剂， 反应 13.33h， 生成 2-((6-(benzo[b]thiophen-2-yl)thieno[3,2-d]pyrimidin-4-yl)thio)acetic acid
  参考文献：
  名称：

  暗激酶 STK17B 的化学探针通过独特的 P 环构象获得其效力和高选择性

  摘要：

  STK17B 是死亡相关蛋白激酶家族的成员，在遗传上与多种疾病的发展有关。然而，STK17B 在正常和疾病病理学中的作用尚不明确。在这里，我们展示了噻吩并 [3,2-d] 嘧啶SGC-STK17B-1 ( 11s ) 的发现，这是一种针对这种尚未研究的“暗”激酶的高质量化学探针。11s是一种 ATP 竞争性抑制剂，对包括密切相关的 STK17A 在内的其他激酶显示出显着的选择性。11s的X射线晶体学和相关的与 STK17B 结合的噻吩并 [3,2-d] 嘧啶揭示了一种独特的 P 环构象，其特征在于 R41 和抑制剂的羧酸之间的盐桥。STK17B 的分子动力学模拟揭示了 P 环的灵活性和可用于载脂蛋白的各种 R41 构象。异构噻吩并[2,3-d]嘧啶SGC-STK17B-1N ( 19g )被鉴定为阴性对照化合物。19g对 STK17B 的活性降低 100 倍以上归因于其嘧啶 N1 的碱性降低。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.0c01174

文献信息

• A Chemical Probe for Dark Kinase STK17B Derives Its Potency and High Selectivity through a Unique P-Loop Conformation
  作者：Alfredo Picado、Apirat Chaikuad、Carrow I. Wells、Safal Shrestha、William J. Zuercher、Julie E. Pickett、Frank E. Kwarcinski、Parvathi Sinha、Chandi S. de Silva、Reena Zutshi、Shubin Liu、Natarajan Kannan、Stefan Knapp、David H. Drewry、Timothy M. Willson

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.0c01174

  日期：2020.12.10

  remarkable selectivity over other kinases including the closely related STK17A. X-ray crystallography of 11s and related thieno[3,2-d]pyrimidines bound to STK17B revealed a unique P-loop conformation characterized by a salt bridge between R41 and the carboxylic acid of the inhibitor. Molecular dynamic simulations of STK17B revealed the flexibility of the P-loop and a wide range of R41 conformations available

  STK17B 是死亡相关蛋白激酶家族的成员，在遗传上与多种疾病的发展有关。然而，STK17B 在正常和疾病病理学中的作用尚不明确。在这里，我们展示了噻吩并 [3,2-d] 嘧啶SGC-STK17B-1 ( 11s ) 的发现，这是一种针对这种尚未研究的“暗”激酶的高质量化学探针。11s是一种 ATP 竞争性抑制剂，对包括密切相关的 STK17A 在内的其他激酶显示出显着的选择性。11s的X射线晶体学和相关的与 STK17B 结合的噻吩并 [3,2-d] 嘧啶揭示了一种独特的 P 环构象，其特征在于 R41 和抑制剂的羧酸之间的盐桥。STK17B 的分子动力学模拟揭示了 P 环的灵活性和可用于载脂蛋白的各种 R41 构象。异构噻吩并[2,3-d]嘧啶SGC-STK17B-1N ( 19g )被鉴定为阴性对照化合物。19g对 STK17B 的活性降低 100 倍以上归因于其嘧啶 N1 的碱性降低。