3′,5′-O-bis-(tert-butyldimethylsilyl)-5-(2-methylbenzyloxy)methyl-2′-deoxyuridine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 3′,5′-O-bis-(tert-butyldimethylsilyl)-5-(2-methylbenzyloxy)methyl-2′-deoxyuridine
• 英文别名: 1-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-5-[(2-methylphenyl)methoxymethyl]pyrimidine-2,4-dione
• 化学式: C₃₀H₅₀N₂O₆Si₂
• 分子量: 590.908
• InChiKey: BESLLFOSLUUFRD-JIMJEQGWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.26
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  86.3
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  邻甲基苄醇 、 N³-tert-butyloxycarbonyl-5-bromomethyl-3',5'-bis-O-tert-butyldimethylsilyl-2'-deoxyuridine 以 neat (no solvent) 为溶剂， 反应 0.75h， 以5%的产率得到3′,5′-O-bis-(tert-butyldimethylsilyl)-5-(2-methylbenzyloxy)methyl-2′-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  Nucleotides and nucleosides and methods for their use in DNA sequencing

  摘要：

  本发明一般涉及带标记和未标记的可切割终止基团以及用于DNA测序和其他类型的DNA分析的方法。更具体地，该发明部分涉及具有化学可切割、光解可切割、酶可切割或非光解可切割基团的核苷酸和核苷以及它们在DNA测序中的使用方法及其在生物医学研究中的应用。

  公开号：

  US09200319B2