基于片段的药物发现已在当今的
铅鉴定过程中立足。我们介绍了基于计算机模拟片段筛选的应用,用于发现
金属内
蛋白酶热溶素的新型先导化合物。我们选择了
嗜热菌蛋白酶来验证我们的筛选方法,因为它是一种经过深入研究的酶,并且可以作为其他
蛋白酶的模型系统。设计了蛋白质靶向的虚拟文库,并使用程序AutoDock进行了筛选。可以确定两个片段命中。对于其中之一,提出了与
嗜热菌蛋白酶复合的晶体结构。选择该化合物是为了基于结构的结合亲和力的优化和
配体效率的提高,同时保留了初始片段的类似片段的特性。ķ我值低至128μ中号,因此它们提供一种用于在
定制的引线设计进一步命中演进一个很好的起点。