我们设计和合成了一种基于刚性
萘基支架的新型分子钳,并评估了它们对HIV-1
蛋白酶(PR)的抗二聚体活性。我们将羰基酰
肼和寡酰
肼(
叠氮化物)片段插入它们的拟肽臂中,以减少疏
水性并增加代谢稳定性。这些片段旨在通过复制天然PR中两个单体的N和C端之间形成的反平行β折叠中的氢键模式来破坏蛋白质之间的相互作用。动力学分析和荧光探针结合研究表明,几种分子钳可以抑制PR二聚化。迄今为止,最佳非肽类分子钳具有抑制常数K id对于PR为50nM,对于多突变
蛋白酶AN
AM-11为80nM。PR抑制是选择性的,
天冬氨酸蛋白酶肾素和胃
蛋白酶不被抑制。