1-[(1R,4R,6R,7S)-4-[[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethoxy]methyl]-7-hydroxy-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptan-6-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione | 206055-71-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 1-[(1R,4R,6R,7S)-4-[[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethoxy]methyl]-7-hydroxy-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptan-6-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• 英文别名: Locked nucleic acid 1；1-[(1R,3R,4R,7S)-1-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-7-hydroxy-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptan-3-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 206055-71-2
• 化学式: C₃₂H₃₂N₂O₈
• 分子量: 572.615
• InChiKey: LRHODMQLNIWFSL-LBWLPYLASA-N

物化性质

• 密度：
  1.331±0.06 g/cm3(Temp: 25 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.8
• 重原子数：
  42
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  116
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

安全信息

• 危险性防范说明：
  P501,P270,P264,P280,P302+P352,P337+P313,P305+P351+P338,P362+P364,P332+P313,P301+P312+P330
• 危险性描述：
  H302,H315,H319

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-[(1R,4R,6R,7S)-4-[[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethoxy]methyl]-7-hydroxy-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptan-6-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione 在 吡啶 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 61.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  具有潜在反义应用的氨基甲酸酯锁核酸 (LNA) 寡核苷酸的合成和生物物理特性。

  摘要：

  反义寡核苷酸 (ASO) 正在成为治疗难治疾病的重要药物。对其 DNA 骨架的修饰对于抑制体内降解至关重要，但它们会降低与 RNA 靶标的结合亲和力。为了解决这个问题，我们将氨基甲酸酯 (CBM) DNA 骨架类似物的酶抗性与锁核酸糖 (LNA) 赋予的热力学稳定性相结合。使用二核苷酸亚磷酰胺策略和自动固相合成，我们合成了一组用多个 LNA-CBM 单元修饰的寡核苷酸。LNA 糖恢复与 RNA 目标的结合亲和力，在这方面，LNA 相对于 CBM 连接的位置很重要。含有氨基甲酸酯的寡核苷酸侧翼位于其 5' 和 3' LNA 的 -sides 与 RNA 形成稳定的双链体，与 DNA 形成不稳定的双链体，这对于反义应用来说是理想的。与单独的 LNA 或 CBM 骨架相比，氨基甲酸酯-LNA 修饰的寡核苷酸在蛇毒和胎牛血清的存在下也表现出更高的稳定性。

  DOI：

  10.1039/c9ob00691e
• 作为产物：
  描述：

  3'-O-benzyl-4'-(p-toluenesulfonyloxymethyl)uridine 在 palladium on activated charcoal 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 硫酸氢铵 、 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 sodium azide 、 氢气 、 sodium hexamethyldisilazane 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙二醇二甲醚 、 水 为溶剂， 反应 145.0h， 生成 1-[(1R,4R,6R,7S)-4-[[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethoxy]methyl]-7-hydroxy-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptan-6-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  2′-O,4′-C-methylene bridged nucleic acid (2′,4′-BNA)

  摘要：

  For development of ideal antisense and antigene molecules, various chemical modifications of oligonucleotides have been studied. However, despite their importance. there is only limited information available on the tripler-forming ability of the conformationally restricted or locked oligonucleotides. We report herein that 2'-O,4'-C-methylene bridged nucleic acid (2',4'-BNA) modification of tripler-forming oligonucleotide: (TFO) significantly enhances the binding affinity towards target dsDNA. On T, measurements. the triplex with the 2',4'-BNA oligonucleotides were found to be stabilized with DeltaT(m)/modification of +4.3 to + 5 degreesC at pH 6.6 compared to the triplexes with the unmodified oligonucleotide. By means of gel-retardation assay, the binding constant of the 2'.4'-BNA oligonucleotide at pH 7.0 was at least 300-fold higher than that of the natural oligonucleotide. In addition, the 2',4'-BNA oligonucleotide clearly showed the inhibition of the NF-K-B transcription factor (p50)-target dsDNA binding by forming a stable tripler at pH 7.0. (C) 2001 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/s0968-0896(00)00325-4

文献信息

• DINUCLEOTIDES
  申请人：OXFORD UNIVERSITY INNOVATION LIMITED

  公开号：US20190015439A1

  公开（公告）日：2019-01-17

  The present invention relates to novel dinucleotides that are useful for the preparation of oligonucleotides. The present invention also relates to novel dinucleotides that are useful therapeutically.

  本发明涉及用于制备寡核苷酸的新型二核苷酸。本发明还涉及在治疗上有用的新型二核苷酸。
• LNA (locked nucleic acids): synthesis and high-affinity nucleic acid recognition
  作者：Sanjay K. Singh、Alexei A. Koshkin、Jesper Wengel、Poul Nielsen

  DOI：10.1039/a708608c

  日期：——

  A novel class of nucleic acid analogues, termed LNA (locked nucleic acids), is introduced. Following the Watson–Crick base pairing rules, LNA forms duplexes with complementary DNA and RNA with remarkably increased thermal stabilities and generally improved selectivities.

  一类新型的核酸类似物，被称为LNA（锁定核酸），被引入了。根据Watson-Crick碱基配对规则，LNA与互补的DNA和RNA形成双链，具有显著增加的热稳定性和通常提高的选择性。
• [EN] NOVEL PHOSPHORAMIDITES<br/>[FR] NOUVELLES PHOSPHORAMIDITES
  申请人：ROCHE INNOVATION CT COPENHAGEN AS

  公开号：WO2020169696A1

  公开（公告）日：2020-08-27

  The invention relates to a compound of formula (II) wherein X, Y, R5, Rx, Ry and Nu are as defined in the description and in the claims. The compound of formula (II) can be used in the manufacture of medicaments.

  该发明涉及具有公式（II）的化合物，其中X、Y、R5、Rx、Ry和Nu如描述和索赔中所定义。公式（II）的化合物可用于制造药物。
• 5′- vs. 3′-end sugar conformational control in shaping up dinucleotides
  作者：J. Jakhlal、S. Coantic-Castex、C. Denhez、C. Petermann、A. Martinez、D. Harakat、D. Guillaume、P. Clivio

  DOI：10.1039/c5cc04212g

  日期：——

  The 3′-end sugar puckering of a dinucleotide can potentiate or cancel the stacking effect of the 5′-end N-sugar conformation.

  二核苷酸的3'-末端糖环构象可以增强或抵消5'-末端N-糖构象的堆叠效应。
• [EN] NOVEL PROCESS FOR PREPARING NUCLEOTIDE P(V) MONOMERS<br/>[FR] NOUVEAU PROCÉDÉ DE PRÉPARATION DE MONOMÈRES P(V) NUCLÉOTIDIQUES
  申请人：ROCHE INNOVATION CT COPENHAGEN AS

  公开号：WO2020212301A1

  公开（公告）日：2020-10-22

  The present invention relates to an optimized method for preparing a P(V) monomer of formula (IIIa) or (IIIb) from a nucleoside using DBU as a base at about 0.8 equivalent to nucleoside.

  本发明涉及一种优化的方法，用DBU作为碱在约0.8当量的情况下，从核苷酸制备公式(IIIa)或(IIIb)的P(V)单体。