3-methoxy-N-(3-(4-methylpiperazin-1-yl)propyl)-4-nitrobenzamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 3-methoxy-N-(3-(4-methylpiperazin-1-yl)propyl)-4-nitrobenzamide
• 英文别名: 3-methoxy-N-[3-(4-methylpiperazin-1-yl)propyl]-4-nitrobenzamide
• 化学式: C₁₆H₂₄N₄O₄
• 分子量: 336.391
• InChiKey: HFAKAFQNYCEWLC-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.2
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  90.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-methoxy-N-(3-(4-methylpiperazin-1-yl)propyl)-4-nitrobenzamide 在 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 以86%的产率得到4-amino-3-methoxy-N-(3-(4-methylpiperazin-1-yl)propyl)benzamide
  参考文献：
  名称：

  通过基于结构的药物设计（SBDD）发现了一种有效且高度选择性的转化生长因子β受体相关激酶1（TAK1）抑制剂。

  摘要：

  使用SBDD方法发现了一种新型的噻吩并嘧啶酮类似物，作为一种有效且高度选择性的TAK1抑制剂。TAK1在炎性和免疫信号传导中起关键作用，因此TAK1被认为是治疗人类疾病（炎性疾病，癌症等）的有吸引力的分子靶标。获得命中化合物后，我们的修饰成功提高了TAK1的抑制活性和溶解度，但代谢稳定性仍然不理想。为了提高代谢稳定性，我们进行了代谢鉴定。尽管所获得的代谢物幸运地是一种强效的TAK1抑制剂，但其激酶选择性却很低。随后，为了实现高激酶选择性，我们使用SBDD遵循两种策略：一种针对TAK1中独特的氨基酸残基，特别是Ser111和Asn114的组合；另一种针对TAK1中的独特氨基酸残基。另一个减少了TAK1中铰链位置与Tyr106的相互作用。不出所料，我们设计的化合物在超过420种激酶的内部和市售面板分析中均显示了出色的激酶选择性，并保留了其强大的TAK1抑制活性（TAK1 IC50 = 11nM）。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2016.07.006
• 作为产物：
  描述：

  1-(3-氨丙基)-4-甲基哌嗪 、 3-甲氧基-4-硝基苯甲酸 在 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以100%的产率得到3-methoxy-N-(3-(4-methylpiperazin-1-yl)propyl)-4-nitrobenzamide
  参考文献：
  名称：

  通过基于结构的药物设计（SBDD）发现了一种有效且高度选择性的转化生长因子β受体相关激酶1（TAK1）抑制剂。

  摘要：

  使用SBDD方法发现了一种新型的噻吩并嘧啶酮类似物，作为一种有效且高度选择性的TAK1抑制剂。TAK1在炎性和免疫信号传导中起关键作用，因此TAK1被认为是治疗人类疾病（炎性疾病，癌症等）的有吸引力的分子靶标。获得命中化合物后，我们的修饰成功提高了TAK1的抑制活性和溶解度，但代谢稳定性仍然不理想。为了提高代谢稳定性，我们进行了代谢鉴定。尽管所获得的代谢物幸运地是一种强效的TAK1抑制剂，但其激酶选择性却很低。随后，为了实现高激酶选择性，我们使用SBDD遵循两种策略：一种针对TAK1中独特的氨基酸残基，特别是Ser111和Asn114的组合；另一种针对TAK1中的独特氨基酸残基。另一个减少了TAK1中铰链位置与Tyr106的相互作用。不出所料，我们设计的化合物在超过420种激酶的内部和市售面板分析中均显示了出色的激酶选择性，并保留了其强大的TAK1抑制活性（TAK1 IC50 = 11nM）。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2016.07.006

文献信息

• Discovery of a potent and highly selective transforming growth factor β receptor-associated kinase 1 (TAK1) inhibitor by structure based drug design (SBDD)
  作者：Terushige Muraoka、Mitsuaki Ide、Kenji Morikami、Machiko Irie、Mitsuaki Nakamura、Takaaki Miura、Takayuki Kamikawa、Masamichi Nishihara、Hirotaka Kashiwagi

  DOI：10.1016/j.bmc.2016.07.006

  日期：2016.9

  novel thienopyrimidinone analog was discovered as a potent and highly selective TAK1 inhibitor using the SBDD approach. TAK1 plays a key role in inflammatory and immune signaling, so TAK1 is considered to be an attractive molecular target for the treatment of human diseases (inflammatory disease, cancer, etc.). After the hit compound had been obtained, our modifications successfully increased TAK1 inhibitory

  使用SBDD方法发现了一种新型的噻吩并嘧啶酮类似物，作为一种有效且高度选择性的TAK1抑制剂。TAK1在炎性和免疫信号传导中起关键作用，因此TAK1被认为是治疗人类疾病（炎性疾病，癌症等）的有吸引力的分子靶标。获得命中化合物后，我们的修饰成功提高了TAK1的抑制活性和溶解度，但代谢稳定性仍然不理想。为了提高代谢稳定性，我们进行了代谢鉴定。尽管所获得的代谢物幸运地是一种强效的TAK1抑制剂，但其激酶选择性却很低。随后，为了实现高激酶选择性，我们使用SBDD遵循两种策略：一种针对TAK1中独特的氨基酸残基，特别是Ser111和Asn114的组合；另一种针对TAK1中的独特氨基酸残基。另一个减少了TAK1中铰链位置与Tyr106的相互作用。不出所料，我们设计的化合物在超过420种激酶的内部和市售面板分析中均显示了出色的激酶选择性，并保留了其强大的TAK1抑制活性（TAK1 IC50 = 11nM）。