N-(benzo[d]thiazol-2-yl)-3-(chloromethyl)benzamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并噻唑类
• 英文名称: N-(benzo[d]thiazol-2-yl)-3-(chloromethyl)benzamide
• 英文别名: N-(1,3-benzothiazol-2-yl)-3-(chloromethyl)benzamide
• 化学式: C₁₅H₁₁ClN₂OS
• 分子量: 302.784
• InChiKey: SYNTXCQUQILDBR-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.9
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.07
• 拓扑面积：
  70.2
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(3-氰基苄基)哌嗪 、 N-(benzo[d]thiazol-2-yl)-3-(chloromethyl)benzamide 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以12.95 %的产率得到
  参考文献：
  名称：

  氨基甲酰胺苯并噻唑作为 LSD1 抑制剂的命中引导优化

  摘要：

  赖氨酸特异性脱甲基酶 (LSD1) 是癌症的潜在治疗靶点，它在细胞可塑性、细胞运动和代谢重编程等致癌过程中具有重要作用。LSD1 在许多癌症类型中过表达，例如非小细胞肺癌 (NSCLC)、雌激素受体 (ER) 阴性乳腺癌、前列腺癌、肝细胞癌、急性髓性白血病 (AML) 等。LSD1 的下调增加了癌细胞的凋亡活性，因此使用小分子对其进行抑制可导致癌细胞死亡和肿瘤消退。在之前的一项研究中，设计、合成了一系列具有氨基甲酰胺苯并噻唑支架的化合物，并针对 LSD1 酶进行了测试，从而鉴定出命中抑制剂1IC 50值为 18.4 µM。在本研究中，通过合成和体外评估 24 种类似物，实现了命中抑制剂1的命中到先导优化过程，旨在增强命中抑制剂1 的效力，并探索氨基甲酰胺的构效关系图苯并噻唑系列作为 LSD1 抑制剂。抑制剂26和30显示出最好的抑制活性，IC 为50值分别等于 4.64 和 4.35 µM

  DOI：

  10.1007/s00044-023-03046-6
• 作为产物：
  描述：

  2-氨基苯并噻唑 、 3-(氯甲基)苯甲酰氯 以 四氢呋喃 为溶剂， 以68.5%的产率得到N-(benzo[d]thiazol-2-yl)-3-(chloromethyl)benzamide
  参考文献：
  名称：

  氨基羧酰胺苯并噻唑类化合物可能是LSD1的潜在抑制剂。第一部分：基于计算片段的药物设计。

  摘要：

  赖氨酸特异性脱甲基酶LSD1通过特定赖氨酸氨基酸残基的去甲基化作用调节细胞中组蛋白的功能。LSD1在各种癌症中过表达，被认为是癌症治疗的有效靶标。在这项研究中，我们描述了使用基于计算片段的药物设计方法发现新型LSD1抑制剂的过程。Maybridge Ro3 2000多样性片段库的基于结构的筛选已鉴定出与LSD1活性位点内两个不同区域结合的两组片段。De Novo和多拷贝同时搜索（MCSS）对接，配体效率（LE）和结合能计算（BE）有助于选择最佳评分片段，这些片段生长成可产生铅样化合物。使用灵活的对接将最终生长的化合物对接至酶的活性位点，并计算其总结合能，以帮助选择可能合成和生物学评估的潜在LSD1抑制剂。合成了六种化合物并进行了生物学测试，其中两种已显示出对LSD1的有希望的活性。复合具有氨基羧酰胺苯并噻唑支架的图37显示出最佳的抑制活性，IC 50值为18.4μM。选择化合物37作为LSD1命中抑制剂，值得进一步优化。

  DOI：

  10.1016/j.jmgm.2019.107440

文献信息

• Amino-carboxamide benzothiazoles as potential LSD1 hit inhibitors. Part I: Computational fragment-based drug design
  作者：Soraya Alnabulsi、Enas A. Al-Hurani、Nizar A. Al-shar'i、Tamam El-Elimat

  DOI：10.1016/j.jmgm.2019.107440

  日期：2019.12

  produce lead-like compounds. The final grown compounds were docked into the active site of the enzyme using flexible docking and their total binding energies were calculated in order to aid the selection of potential LSD1 inhibitors that will be synthesized and biologically evaluated. Six compounds were synthesized and biologically tested, of which two had showed a promising activity against LSD1. Compound

  赖氨酸特异性脱甲基酶LSD1通过特定赖氨酸氨基酸残基的去甲基化作用调节细胞中组蛋白的功能。LSD1在各种癌症中过表达，被认为是癌症治疗的有效靶标。在这项研究中，我们描述了使用基于计算片段的药物设计方法发现新型LSD1抑制剂的过程。Maybridge Ro3 2000多样性片段库的基于结构的筛选已鉴定出与LSD1活性位点内两个不同区域结合的两组片段。De Novo和多拷贝同时搜索（MCSS）对接，配体效率（LE）和结合能计算（BE）有助于选择最佳评分片段，这些片段生长成可产生铅样化合物。使用灵活的对接将最终生长的化合物对接至酶的活性位点，并计算其总结合能，以帮助选择可能合成和生物学评估的潜在LSD1抑制剂。合成了六种化合物并进行了生物学测试，其中两种已显示出对LSD1的有希望的活性。复合具有氨基羧酰胺苯并噻唑支架的图37显示出最佳的抑制活性，IC 50值为18.4μM。选择化合物37作为LSD1命中抑制剂，值得进一步优化。
• Hit-to-lead optimization of amino-carboxamide benzothiazoles as LSD1 inhibitors
  作者：Du’a Al bustanji、Soraya Alnabulsi、Enas A. Al-Hurani

  DOI：10.1007/s00044-023-03046-6

  日期：——

  evaluation of twenty-four analogues aiming to enhance hit inhibitor 1 potency and to explore the structure-activity relationship map of amino-carboxamide benzothiazole series as LSD1 inhibitors. Inhibitors 26 and 30 showed the best inhibitory activity with IC50 values equal to 4.64 and 4.35 µM, respectively. The results from this study helped in understanding the structural requirements of amino-carboxamide

  赖氨酸特异性脱甲基酶 (LSD1) 是癌症的潜在治疗靶点，它在细胞可塑性、细胞运动和代谢重编程等致癌过程中具有重要作用。LSD1 在许多癌症类型中过表达，例如非小细胞肺癌 (NSCLC)、雌激素受体 (ER) 阴性乳腺癌、前列腺癌、肝细胞癌、急性髓性白血病 (AML) 等。LSD1 的下调增加了癌细胞的凋亡活性，因此使用小分子对其进行抑制可导致癌细胞死亡和肿瘤消退。在之前的一项研究中，设计、合成了一系列具有氨基甲酰胺苯并噻唑支架的化合物，并针对 LSD1 酶进行了测试，从而鉴定出命中抑制剂1IC 50值为 18.4 µM。在本研究中，通过合成和体外评估 24 种类似物，实现了命中抑制剂1的命中到先导优化过程，旨在增强命中抑制剂1 的效力，并探索氨基甲酰胺的构效关系图苯并噻唑系列作为 LSD1 抑制剂。抑制剂26和30显示出最好的抑制活性，IC 为50值分别等于 4.64 和 4.35 µM