2'-O-(2-methoxyethyl)-N⁴-benzoyl-5-methylcytidine | 340162-93-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 2'-O-(2-methoxyethyl)-N⁴-benzoyl-5-methylcytidine
• 英文别名: N⁴-benzoyl-2’-O-methoxyethyl-5-methylcytidine；N⁴-benzoyl -2'-O-methoxyethyl-5-methyl cytidine；2'-methoxyethyl-5-methyl-N-benzoylcytidine；N-Benzoyl-2'-O-(2-methoxyethyl)-5-methylcytidine；N-[1-[(2R,3R,4R,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-3-(2-methoxyethoxy)oxolan-2-yl]-5-methyl-2-oxopyrimidin-4-yl]benzamide
• CAS: 340162-93-8
• 化学式: C₂₀H₂₅N₃O₇
• 分子量: 419.434
• InChiKey: LGGHYGUGIGYDFX-YKTARERQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.1
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  130
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2'-O-(2-methoxyethyl)-N⁴-benzoyl-5-methylcytidine 在 4-二甲氨基吡啶 、 phosphate buffer 、 Pseudomonas cepacia lipase 、 三乙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 26.0h， 生成 N-benzoyl-5'-O-levulinyl-2'-O-(2-methoxyethyl)-5-methylcytidine
  参考文献：
  名称：

  寡核苷酸溶液相合成的基本组成部分：使用酶促方法对3'，5'-Di-O-乙酰丙氨酰核苷进行区域选择性水解。

  摘要：

  通过区域选择性酶水解反应，由相应的3'，5'-二-O-乙酰丙酰衍生物开发了一种简便的3'-和5'-O-乙酰丙酰-2'-脱氧核苷合成方法，避免了一些繁琐的化学保护/脱保护步骤。因此，发现南极假丝酵母脂肪酶B（CAL-B）选择性地水解5'-乙酰丙酸酯，以> 80％的分离产率提供3'-O-乙酰丙酰-2'-脱氧核苷3。另一方面，固定化的假单胞菌洋葱脂肪酶（PSL-C）和南极假丝酵母脂肪酶A（CAL-A）在3'-位置对水解表现出相反的选择性，从而在> 70的情况下提供5'-O-乙酰丙酰衍生物4 ％产率。相似的水解过程已成功扩展到3'-和5'-O-乙酰丙氨酰保护的2'的合成 -O-烷基核糖核苷7和8。这项工作首次证明了商业CAL-B和PSL-C在乙酰丙酸酯的区域选择性水解方面具有优异的选择性和产率。值得注意的是，受保护的胞苷和腺苷碱衍生物不足以用作用CAL-B进行酶促水解的底物，而PSL-C能够在选择

  DOI：

  10.1021/jo020080k
• 作为产物：
  描述：

  N-苯甲酰基-2'-O-甲氧基乙基-5-O-二甲氧基三苯甲基-5-甲基胞苷 在 Amberlyst-15 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 0.5h， 以75%的产率得到2'-O-(2-methoxyethyl)-N⁴-benzoyl-5-methylcytidine
  参考文献：
  名称：

  可再生的amberlyst-15催化糖基二醇的高度区域选择性三苯甲基化和脱保护

  摘要：

  摘要在4,4'-二甲氧基三苯甲基醇（DMTrOH）的温和条件下，Amberlyst-15催化了糖基二醇的高区域选择性三苯甲基化反应。通过向质子溶剂的变化也建立了相应的DMTr基团的脱保护。同时，均相催化剂Amberlyst-15循环使用了3次，保持了令人满意的催化活性，证明了其在工业中的潜在应用。

  DOI：

  10.1080/07328303.2018.1487974

文献信息

• [EN] SUBSTITUTED PIXYL PROTECTING GROUPS FOR OLIGONUCLEOTIDE SYNTHESIS<br/>[FR] GROUPES SUBSTITUES DE PROTECTION DE PIXYLE DESTINES A UNE SYNTHESE D'OLIGONUCLEOTIDES
  申请人：ISIS PHARMACEUTICALS INC

  公开号：WO2005077966A1

  公开（公告）日：2005-08-25

  The present invention describes an improved hydroxyl protecting group of formula (1), wherein R2 and R7 are specified substituents and Q is O, S, NR10 or N(C=O)R10.

  本发明描述了一种改进的羟基保护基团，其化学式为（1），其中R2和R7是指定的取代基，Q为O、S、NR10或N(C=O)R10。
• DDQ mediated regiospecific protection of primary alcohol and deprotection under neutral conditions: Application of new p -methoxy benzyl-pixyl ether as reagent of choice for nucleoside protection
  作者：Penjarla Srishylam、A. Raji Reddy、Shyamapada Banerjee、Santhosh Penta、Yogesh S. Sanghvi

  DOI：10.1016/j.tetlet.2017.05.066

  日期：2017.6

  A simple and efficient protocol is described for regiosepecific protection of primary hydroxyl group both in nucleosides and other molecules with p-methoxy-benzyl 2,7-dimethyl pixylether (MBDPE) in presence of 2,3-dichloro-5,6-dicyano-1,4-benzoquinone (DDQ). Furthermore, swift deprotection of 2, 7-dimethylpixyl (DMPx) is accomplished with DDQ in MeOH. Both procedures are successfully implemented on

  一个简单的，高效的协议被用于在两个核苷和其它分子与伯羟基的保护regiosepecific描述p -米乙氧基b enzyl 2,7- d imethyl p ixyl ë疗法（MBDPE）中的存在2,3-二氯5,6-二氰基-1,4-苯醌（DDQ）。此外，用DDQ在MeOH中快速脱保护2，7-二甲基pixyl（DMPx）。两种方法均在革兰氏级合成修饰核苷上成功实现。该方案为DMPx基团的选择性保护和脱保护提供了温和和中性的条件，同时可与其他常规保护基团（例如苯甲酰基，苄基，THP，TBDPS和丙酮化物）相容。
• Copper(II)nitrate catalyzed regioselective protection of primary alcohols with 4,4′-dimethoxytrityl and 2,7-dimethyl-9-phenyl xanthen-9-yl groups in nucleosides and carbohydrates
  作者：Srishylam Penjarla、S. Rajendra Prasad、Dhande Sudhakar Reddy、Shyamapada Banerjee、Santhosh Penta、Yogesh S. Sanghvi

  DOI：10.1080/15257770.2018.1460480

  日期：2018.4.3

  ABSTRACT Regioselective protection of primary hydroxyl group in nucleoside and carbohydrate analogs was accomplished using dimethoxytrityl alcohol (DMTr-OH) or dimethylpixyl alcohol (DMPx-OH) in presence of copper(II)nitrate as a Lewis acid catalyst. Excellent selectivity was observed for the protection of primary hydroxyl group over secondary while glycosidic bond remain unaffected. Utility of this

  摘要 在作为路易斯酸催化剂的硝酸铜 (II) 存在下，使用二甲氧基三苯甲醇 (DMTr-OH) 或二甲基苯甲醇 (DMPx-OH) 实现了核苷和碳水化合物类似物中伯羟基的区域选择性保护。观察到优异的选择性保护伯羟基而不是仲羟基，而糖苷键不受影响。通过脂肪族无环和环状二醇的 DMTr 和 DMPx 保护进一步举例说明了该方法的实用性。
• Scalable synthesis of substituted 2,7-dimethyl-9-phenylxanthen-9-ol (DMPx-OH): useful for the preparation of crystalline 5′-O-DMPx-protected nucleosides
  作者：Shyamapada Banerjee、P. Srishylam、S. Rajendra Prasad、Michael T. Migawa、Eric E. Swayze、Yogesh S. Sanghvi

  DOI：10.1016/j.tetlet.2012.06.081

  日期：2012.8

  A convenient single-step synthesis of several 2,7-dimethyl-9-phenylxanthen-9-ol (DMPx-OH) analogs has been accomplished using a Friedel–Crafts reaction. Treatment of various DMPx-OH with unprotected 2′-O-methoxyethyl-ribonucleosides (MOE) in the presence of B(C6F5)3, as a Lewis Acid catalyst, furnished 5′-O-protected derivatives of 2′-MOE-ribonucleosides in good yields. The deprotection of the DMPx

  使用Friedel-Crafts反应已经完成了几种2,7-二甲基-9-苯基黄嘌呤9-醇（DMPx-OH）类似物的便捷一步合成。在路易斯酸催化剂的B（C 6 F 5）3存在下，用未保护的2' - O-甲氧基乙基-核糖核苷（MOE）处理各种DMPx-OH ，得到5'- O-保护的2'-衍生物MOE-核糖核苷产率高。DMPx基团的脱保护是通过在非常温和的条件下进行酸水解来实现的。在合成的五个DMPx类似物中，2,7-二甲基-9-（4-硝基苯基）氧杂蒽-9-基团提供了结晶产物，使得能够进行非色谱分离5'- O - Protetcated核苷。
• Synthesis of Methoxyethyl Nucleoside Dimer Phosphoramidites
  作者：Gi Weon Yu、Yong Han Kang

  DOI：10.1002/bkcs.10749

  日期：2016.5

  Four types of methoxyethyl (MOE) nucleoside phosphoramidites, which are categorized as second‐generation building blocks of antisense oligonucleotide drugs, were synthesized. Also, three types of MOE nucleoside dimer phosphoramidites were synthesized to increase the efficiency and oligomer purity in solid phase synthesis. The block‐like dimer phosphoramidites can prevent or minimize the formation of the

  合成了四种类型的甲氧基乙基（MOE）核苷亚磷酰胺，它们被归类为反义寡核苷酸药物的第二代构件。此外，合成了三种类型的MOE核苷二聚体亚磷酰胺，以提高固相合成的效率和低聚物纯度。块状二聚亚磷酰胺可以防止或减少（N-1）mer杂质的形成，从而通过进行2 + 2 + 2的偶联反应提供纯的寡核苷酸的生产并减少合成时间。