N⁴-benzoyl-3'-O-levulinyl-2'-O-(2-methoxyethyl)-5-methylcytidine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: N⁴-benzoyl-3'-O-levulinyl-2'-O-(2-methoxyethyl)-5-methylcytidine
• 英文别名: 3'-O-levulinyl-2'-O-(2-methoxyethyl)-N⁴-benzoyl-5-methylcytidine；[(2R,3R,4R,5R)-5-(4-benzamido-5-methyl-2-oxopyrimidin-1-yl)-2-(hydroxymethyl)-4-(2-methoxyethoxy)oxolan-3-yl] 4-oxopentanoate
• 化学式: C₂₅H₃₁N₃O₉
• 分子量: 517.536
• InChiKey: XPTVBPKMGPDJLA-UMCMBGNQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.4
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.48
• 拓扑面积：
  153
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-甲基-DMT-2'-甲氧基尿苷 、 N⁴-benzoyl-3'-O-levulinyl-2'-O-(2-methoxyethyl)-5-methylcytidine 在 四氮唑 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  甲氧乙基核苷二聚亚磷酰胺的合成

  摘要：

  合成了四种类型的甲氧基乙基（MOE）核苷亚磷酰胺，它们被归类为反义寡核苷酸药物的第二代构件。此外，合成了三种类型的MOE核苷二聚体亚磷酰胺，以提高固相合成的效率和低聚物纯度。块状二聚亚磷酰胺可以防止或减少（N-1）mer杂质的形成，从而通过进行2 + 2 + 2的偶联反应提供纯的寡核苷酸的生产并减少合成时间。

  DOI：

  10.1002/bkcs.10749
• 作为产物：
  描述：

  2'-O-(2-methoxyethyl)-N⁴-benzoyl-5-methylcytidine 在 4-二甲氨基吡啶 、 Candida antarctica lipase B 、 phosphate buffer 、 三乙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 26.0h， 生成 N⁴-benzoyl-3'-O-levulinyl-2'-O-(2-methoxyethyl)-5-methylcytidine
  参考文献：
  名称：

  寡核苷酸溶液相合成的基本组成部分：使用酶促方法对3'，5'-Di-O-乙酰丙氨酰核苷进行区域选择性水解。

  摘要：

  通过区域选择性酶水解反应，由相应的3'，5'-二-O-乙酰丙酰衍生物开发了一种简便的3'-和5'-O-乙酰丙酰-2'-脱氧核苷合成方法，避免了一些繁琐的化学保护/脱保护步骤。因此，发现南极假丝酵母脂肪酶B（CAL-B）选择性地水解5'-乙酰丙酸酯，以> 80％的分离产率提供3'-O-乙酰丙酰-2'-脱氧核苷3。另一方面，固定化的假单胞菌洋葱脂肪酶（PSL-C）和南极假丝酵母脂肪酶A（CAL-A）在3'-位置对水解表现出相反的选择性，从而在> 70的情况下提供5'-O-乙酰丙酰衍生物4 ％产率。相似的水解过程已成功扩展到3'-和5'-O-乙酰丙氨酰保护的2'的合成 -O-烷基核糖核苷7和8。这项工作首次证明了商业CAL-B和PSL-C在乙酰丙酸酯的区域选择性水解方面具有优异的选择性和产率。值得注意的是，受保护的胞苷和腺苷碱衍生物不足以用作用CAL-B进行酶促水解的底物，而PSL-C能够在选择

  DOI：

  10.1021/jo020080k

文献信息

• Direct Regioselective Enzymatic Acylation of Nucleosides: Building-Blocks for the Solution Phase Synthesis of Oligonucleotides
  作者：Javier García、Susana Fernández、Miguel Ferrero、Yogesh S. Sanghvi、Vicente Gotor

  DOI：10.1081/ncn-120023009

  日期：2003.10

  The synthesis of 3'- and 5'-O-levulinyl nucleosidic monomers through enzymatic acylation with acetonoxime levulinate is demonstrated. The acylation process takes place in one-step and use of expensive reagents, such as DMTrCl is avoided. The regioselectivity of the procedure makes it very convenient for acylated monomers required for solution phase synthesis of oligonucleotides.
• Novel enzymatic synthesis of levulinyl protected nucleosides useful for solution phase synthesis of oligonucleotides
  作者：Javier Garcı́a、Susana Fernández、Miguel Ferrero、Yogesh S. Sanghvi、Vicente Gotor

  DOI：10.1016/j.tetasy.2003.07.009

  日期：2003.11

  An efficient synthesis of 3' and 5'-O-levulinyl-2'-deoxy- and 2'-O-alkylribonucleosides has been developed front appropriate nucleosides by enzyme-catalyzed regioselective acylation in organic solvents. Several lipases were screened in combination with acetonoxime levulinate as an acylating agent. Immobilized Pseudomonas cepacia lipase (PSL-C) was selected for acylation of the 3'-hydroxyl group in nucleosides, furnishing 3'-O-levulinylated products 1 and 3 in excellent yields. Similarly, Candida antarctica lipase B (CAL-B) provided 5'-O-levulinyl nucleosides 2 and 4 in high yields. Base-protected cytidine and adenosine analogs were found to be good substrates for lipase-mediated acylations. To demonstrate the industrial utility of this method, 3'-O-levulinyl thymidine and N-2-Ibu-5'-O-levulinyl-2'deoxygunaosine were synthesized on a 25 g scale. Additionally, PSL-C was reused to make the processes further economical. (C) 2003 Elsevier Ltd. All rights reserved.