5-hydroxycytidine | 39638-73-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-hydroxycytidine
• 英文别名: 5-hydoxycytidine；4-amino-1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-hydroxypyrimidin-2-one
• CAS: 39638-73-8
• 化学式: C₉H₁₃N₃O₆
• 分子量: 259.219
• InChiKey: MPPUDRFYDKDPBN-UAKXSSHOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.5
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  149
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-hydroxycytidine 在 potassium carbonate 、 silver nitrate 、 sodium iodide 作用下， 以 吡啶 、 丙酮 为溶剂， 反应 6.5h， 生成 4-amino-1-((2R,3R,4S,5R)-5-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl)-5-((2-nitrobenzyl)oxy)pyrimidin-2(1H)-one
  参考文献：
  名称：

  Synthesis, base pairing properties and trans-lesion synthesis by reverse transcriptases of oligoribonucleotides containing the oxidatively damaged base 5-hydroxycytidine

  摘要：

  成功合成了一种含有氧化性损伤碱基5-羟基胞嘧啶（5-HOrC）的笼型RNA亚磷酰胺构建单元。为了确定这种高度诱变性损伤对互补碱基识别和编码特性的影响，将该构建单元掺入12聚体核糖核酸寡核苷酸中进行Tm和CD测量，以及掺入31聚体模板链进行HIV-、AMV-和MMLV-逆转录酶（RT）的引物延伸实验。在紫外熔融实验中，我们发现在5-HOrC与相对位置为鸟嘌呤的DNA或RNA互补配对时，呈现出一种不寻常的双相转变，具有两个清晰的Tm值。较高的Tm值与C-G碱基对非常接近，而较低的Tm值接近于C-A错配。在单碱基延伸反应中，我们发现大量错误掺入dAMP，并且在较小程度上掺入dTMP，在HIV-RT情况下，dAMP几乎与母体dGMP相等。对于双相熔融转变的工作假设并不涉及5-HOrC的互变异构变化，而是在低温下由5-HO基团与磷酸骨架相互作用引起的局部结构扰动。该RNA损伤的性质在其假定的生物学功能背景下进行了讨论。

  DOI：

  10.1093/nar/gkr673
• 作为产物：
  描述：

  胞苷 在 水 、 溴 、 2,4,6-三甲基吡啶 作用下， 反应 2.0h， 以64%的产率得到5-hydroxycytidine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis, base pairing properties and trans-lesion synthesis by reverse transcriptases of oligoribonucleotides containing the oxidatively damaged base 5-hydroxycytidine

  摘要：

  成功合成了一种含有氧化性损伤碱基5-羟基胞嘧啶（5-HOrC）的笼型RNA亚磷酰胺构建单元。为了确定这种高度诱变性损伤对互补碱基识别和编码特性的影响，将该构建单元掺入12聚体核糖核酸寡核苷酸中进行Tm和CD测量，以及掺入31聚体模板链进行HIV-、AMV-和MMLV-逆转录酶（RT）的引物延伸实验。在紫外熔融实验中，我们发现在5-HOrC与相对位置为鸟嘌呤的DNA或RNA互补配对时，呈现出一种不寻常的双相转变，具有两个清晰的Tm值。较高的Tm值与C-G碱基对非常接近，而较低的Tm值接近于C-A错配。在单碱基延伸反应中，我们发现大量错误掺入dAMP，并且在较小程度上掺入dTMP，在HIV-RT情况下，dAMP几乎与母体dGMP相等。对于双相熔融转变的工作假设并不涉及5-HOrC的互变异构变化，而是在低温下由5-HO基团与磷酸骨架相互作用引起的局部结构扰动。该RNA损伤的性质在其假定的生物学功能背景下进行了讨论。

  DOI：

  10.1093/nar/gkr673

文献信息

• SYNTHESIS AND STRUCTURE OF HIGH POTENCY RNA THERAPEUTICS
  申请人：Arcturus Therapeutics, Inc.

  公开号：US20190002906A1

  公开（公告）日：2019-01-03

  This invention provides expressible polynucleotides, which can express a target protein or polypeptide. Synthetic mRNA constructs for producing a protein or polypeptide can contain one or more 5′ UTRs, where a 5′ UTR may be expressed by a gene of a plant. In some embodiments, a 5′ UTR may be expressed by a gene of a member of Arabidopsis genus. The synthetic mRNA constructs can be used as pharmaceutical agents for expressing a target protein or polypeptide in vivo.

  这项发明提供了可表达的多核苷酸，可以表达目标蛋白质或多肽。用于产生蛋白质或多肽的合成mRNA构建物可以包含一个或多个5' UTR，其中5' UTR可以由植物的基因表达。在某些实施例中，5' UTR可以由拟南芥属植物的基因表达。这些合成mRNA构建物可以用作体内表达目标蛋白质或多肽的药用剂。
• [EN] COMBINATION IMMUNOREGULATION AND USES THEREOF<br/>[FR] IMMUNORÉGULATION COMBINÉE ET UTILISATIONS ASSOCIÉES
  申请人：OHIO STATE INNOVATION FOUNDATION

  公开号：WO2020198338A1

  公开（公告）日：2020-10-01

  The present disclosure relates to compositions and methods for regulating the immune system and for treating cancers and other immune disorders.

  本公开涉及调节免疫系统和治疗癌症及其他免疫性疾病的组合物和方法。
• [EN] POLYNUCLEOTIDES ENCODING LIPOPROTEIN LIPASE FOR THE TREATMENT OF HYPERLIPIDEMIA<br/>[FR] POLYNUCLÉOTIDES CODANT POUR LA LIPOPROTÉINE LIPASE DESTINÉS AU TRAITEMENT DE L'HYPERLIPIDÉMIE
  申请人：MODERNATX INC

  公开号：WO2017201333A1

  公开（公告）日：2017-11-23

  The invention relates to mRNA therapy for the treatment of hyperlipidemia. mRNAs for use in the invention, when administered in vivo, encode human lipoprotein lipase (LPL), isoforms thereof, functional fragments thereof, and fusion proteins comprising LPL. mRNAs of the invention are preferably encapsulated in lipid nanoparticles (LNPs) to effect efficient delivery to cells and/or tissues in subjects, when administered thereto, mRNA therapeaies of the invention increase and/or restore deficient levels of LPL expression and/or activity in subjects. mRNA therapies of the invention further decrease levels of triglycerides associated with deficient LPL activity in subjects.

  该发明涉及mRNA疗法用于治疗高脂血症。该发明中使用的mRNA，在体内给予时，编码人类脂蛋白脂肪酶（LPL）、其异构体、其功能性片段以及包含LPL的融合蛋白。该发明中的mRNA最好被封装在脂质纳米颗粒（LNPs）中，以实现对受试者的细胞和/或组织的高效传递，当给予治疗时，该发明中的mRNA疗法增加和/或恢复受试者中LPL表达和/或活性的不足水平。该发明中的mRNA疗法进一步降低与受试者中LPL活性不足相关的甘油三酯水平。
• [EN] POLYNUCLEOTIDES ENCODING JAGGED1 FOR THE TREATMENT OF ALAGILLE SYNDROME<br/>[FR] POLYNUCLÉOTIDES CODANT POUR JAGGED1 POUR LE TRAITEMENT DU SYNDROME D'ALAGILLE
  申请人：MODERNATX INC

  公开号：WO2017201342A1

  公开（公告）日：2017-11-23

  The invention relates to mRNA therapy for the treatment of Alagille syndrome (ALGS), mRNAs for use in the invention, when administered in vivo, encode JAGGED 1 (JAG1), isoforms thereof, functional fragments thereof, and fusion proteins comprising JAG1, mRNAs of the invention are preferably encapsulated in lipid nanoparticles (LNPs) to effect efficient delivery to cells and/or tissues in subjects, when administered thereto. mRNA therapies of the invention increase and/or restore deficient levels of JAG1 expression and/or activity in subjects. mRNA therapies of the invention further decrease levels of toxic metabolites associated with deficient JAG1 activity in subjects.

  该发明涉及用于治疗艾拉吉尔综合征（ALGS）的mRNA疗法，该发明中使用的mRNA，在体内给予时，编码JAGGED 1（JAG1）、其同工异构体、其功能性片段以及包含JAG1的融合蛋白，该发明的mRNA最好被封装在脂质纳米颗粒（LNPs）中，以实现对受试者的细胞和/或组织的有效传递，当向受试者施用时。该发明的mRNA疗法增加和/或恢复受试者中JAG1表达和/或活性的不足水平。该发明的mRNA疗法进一步降低与受试者中JAG1活性不足相关的有毒代谢物水平。
• [EN] POLYNUCLEOTIDES ENCODING CYSTIC FIBROSIS TRANSMEMBRANE CONDUCTANCE REGULATOR FOR THE TREATMENT OF CYSTIC FIBROSIS<br/>[FR] POLYNUCLÉOTIDES CODANT POUR UN RÉGULATEUR DE CONDUCTANCE TRANSMEMBRANAIRE DE FIBROSE KYSTIQUE POUR LE TRAITEMENT DE LA FIBROSE KYSTIQUE
  申请人：MODERNATX INC

  公开号：WO2017201347A1

  公开（公告）日：2017-11-23

  The invention relates to mRNA therapy for the treatment of cystic fibrosis. mRNAs for use in the invention, when administered in vivo, encode cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR), isoforms thereof, functional fragments thereof, and fusion proteins comprising CFTR. mRNAs of the invention are preferably encapsulated in lipid nanoparticles (LNPs) to effect efficient delivery to cells and/or tissues in subjects, when administered thereto. mRNA therapies of the invention increase and/or restore deficient levels of CFTR expression and/or activity in subjects. mRNA therapies of the invention further decrease levels of toxic metabolites associated with deficient CFTR activity in subjects.

  该发明涉及mRNA治疗囊性纤维化的方法。该发明中使用的mRNAs在体内施用时，编码囊性纤维化跨膜传导调节蛋白（CFTR）、其同工型、功能性片段以及包含CFTR的融合蛋白。该发明中的mRNAs最好被封装在脂质纳米粒子（LNPs）中，以实现有效地传递到受试者的细胞和/或组织，当施用给受试者时。该发明的mRNA治疗方法增加和/或恢复受试者中CFTR表达和/或活性的不足水平。该发明的mRNA治疗方法进一步降低与受试者中CFTR活性不足相关的有毒代谢物的水平。