4-amino-7-(β-D-ribofuranosyl)-5-[(trimethylsilyl)ethynyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine | 1252858-27-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 吡咯并嘧啶核苷和核苷酸
• 英文名称: 4-amino-7-(β-D-ribofuranosyl)-5-[(trimethylsilyl)ethynyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine
• 英文别名: 4-amino-7-(β-ribofuranosyl)-5-[(trimethylsilyl)ethynyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine；4-Amino-7-(beta-D-ribofuranosyl)-5-[(trimethylsilyl)ethynyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine；(2R,3R,4S,5R)-2-[4-amino-5-(2-trimethylsilylethynyl)pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl]-5-(hydroxymethyl)oxolane-3,4-diol
• CAS: 1252858-27-7
• 化学式: C₁₆H₂₂N₄O₄Si
• 分子量: 362.461
• InChiKey: GOLYHIJCYFGVNO-XNIJJKJLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.15
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  127
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-amino-7-(β-D-ribofuranosyl)-5-[(trimethylsilyl)ethynyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine 在 甲醇 、 potassium carbonate 作用下， 反应 4.0h， 生成 4-amino-5-ethynyl-7-(β-D-ribofuranosyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine
  参考文献：
  名称：

  新型的组蛋白甲基转移酶DOT1L的小分子抑制剂，具有腈作为重卤素原子的非传统替代物。

  摘要：

  公开了许多新的核苷衍生物作为DOT1L活性的抑制剂。SARs证实，可以通过在5位（5、6、12）掺入极性基团和小的杂环或通过使用其他含氮碱基（18）来实现DOT1L抑制。根据这些结果，CN-SAH（19）被确定为DOT1L活性的有效和选择性抑制剂，其中结晶晶体显示极性5腈基结合在DOT1L的疏水口袋中。此外，我们表明极性腈基可以用作重卤素原子的非传统替代物。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2016.07.041
• 作为产物：
  描述：

  5-碘代杀结核菌素 、 三甲基乙炔基硅 在 bis-triphenylphosphine-palladium(II) chloride 、 copper(l) iodide 、 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 14.0h， 生成 4-amino-7-(β-D-ribofuranosyl)-5-[(trimethylsilyl)ethynyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine
  参考文献：
  名称：

  新型的组蛋白甲基转移酶DOT1L的小分子抑制剂，具有腈作为重卤素原子的非传统替代物。

  摘要：

  公开了许多新的核苷衍生物作为DOT1L活性的抑制剂。SARs证实，可以通过在5位（5、6、12）掺入极性基团和小的杂环或通过使用其他含氮碱基（18）来实现DOT1L抑制。根据这些结果，CN-SAH（19）被确定为DOT1L活性的有效和选择性抑制剂，其中结晶晶体显示极性5腈基结合在DOT1L的疏水口袋中。此外，我们表明极性腈基可以用作重卤素原子的非传统替代物。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2016.07.041

文献信息

• Enzymatic synthesis of base-modified RNA by T7 RNA polymerase. A systematic study and comparison of 5-substituted pyrimidine and 7-substituted 7-deazapurine nucleoside triphosphates as substrates
  作者：Nemanja Milisavljevič、Pavla Perlíková、Radek Pohl、Michal Hocek

  DOI：10.1039/c8ob01498a

  日期：——

  initiator needed to be used to obtain efficient RNA synthesis. The T7 RNA polymerase synthesis of modified RNA can be very efficiently used for synthesis of modified RNA but the method has constraints in the sequence of the first three nucleotides of the transcript, which must contain a non-modified G in the +1 position.

  我们通过核苷的交叉偶联反应，随后的三磷酸化反应或通过卤化的直接交叉偶联反应，合成了一个小库，该库包含十八个带有甲基，乙炔基，苯基，苯并呋喃基或二苯并呋喃基的5-取代的嘧啶或7-取代的7-脱氮嘌呤核苷三磷酸核苷三磷酸。我们系统地研究了修饰对T7 RNA聚合酶催化的修饰RNA合成效率的影响，发现修饰较小的修饰ATP，UTP和CTP类似物是RNA合成的良好底物和基石，即使在困难的序列中掺入了多个修饰的核苷酸。ATP和GTP的大体积二苯并呋喃基衍生物不是RNA聚合酶的底物。对于修饰的GTP类似物，需要使用特殊的启动子和GMP作为引发剂的改良程序，才能获得有效的RNA合成。修饰的RNA的T7 RNA聚合酶合成可以非常有效地用于修饰的RNA的合成，但是该方法在转录本的前三个核苷酸的序列中有限制，该转录本的前三个核苷酸必须在+1位包含一个未修饰的G。
• 7-deazapurine nucleosides for therapeutic uses
  申请人：Bourderioux Aurelie

  公开号：US09321800B2

  公开（公告）日：2016-04-26

  The invention provides compounds of formula I, wherein R1, R2 and R3 have values defined in the specification and a pharmaceutically acceptable salt thereof; or an optical isomer thereof; or a mixture of optical isomers, as well as compositions comprising such compounds and therapeutic methods that utilize such compounds and/or compositions.

  本发明提供了公式I的化合物，其中R1，R2和R3的值在规范中定义，并且其药学上可接受的盐；或其光学异构体；或光学异构体的混合物，以及包括这些化合物的组合物和利用这些化合物和/或组合物的治疗方法。
• [EN] NOVEL 7-DEAZAPURINE NUCLEOSIDES FOR THERAPEUTIC USES<br/>[FR] NOUVEAUX NUCLÉOSIDES 7-DÉAZAPURINE À DES FINS THÉRAPEUTIQUES
  申请人：ACAD OF SCIENCE CZECH REPUBLIC

  公开号：WO2010121576A3

  公开（公告）日：2011-06-16
• Synthesis and Significant Cytostatic Activity of 7-Hetaryl-7-deazaadenosines
  作者：Aurelie Bourderioux、Petr Nauš、Pavla Perlíková、Radek Pohl、Iva Pichová、Ivan Votruba、Petr Džubák、Petr Konečný、Marián Hajdúch、Kirsten M. Stray、Ting Wang、Adrian S. Ray、Joy Y. Feng、Gabriel Birkus、Tomas Cihlar、Michal Hocek

  DOI：10.1021/jm2005173

  日期：2011.8.11

  A series of 7-aryl- and 7-hetaryl-7-deazaadenosines were prepared by the cross-coupling reactions of unprotected or protected 7-iodo-7-deazaadenosines with (het)arylboronic acids, stannanes, or zinc halides. Nucleosides bearing 5-membered heterocycles at the position 7 exerted potent in vitro antiproliferative effects against a broad panel of hematological and solid tumor cell lines. Cell cycle analysis indicated profound inhibition of RNA synthesis and induction of apoptosis in treated cells. Intracellular conversion to triphosphates has been detected with active compounds. The triphosphate metabolites showed only a weak inhibitory effect on human RNA polymerase II, suggesting potentially other mechanisms for the inhibition of RNA synthesis and quick onset of apoptosis. Initial in vivo evaluation demonstrated an effect of 7-(2-thienyl)-7-deazaadenine ribonucleoside on the survival rate in syngeneic P388D1 mouse leukemia model.
• New small molecule inhibitors of histone methyl transferase DOT1L with a nitrile as a non-traditional replacement for heavy halogen atoms
  作者：Sophie S. Spurr、Elliott D. Bayle、Wenyu Yu、Fengling Li、Wolfram Tempel、Masoud Vedadi、Matthieu Schapira、Paul V. Fish

  DOI：10.1016/j.bmcl.2016.07.041

  日期：2016.9

  where the polar 5-nitrile group was shown by crystallography to bind in the hydrophobic pocket of DOT1L. In addition, we show that a polar nitrile group can be used as a non-traditional replacement for heavy halogen atoms.

  公开了许多新的核苷衍生物作为DOT1L活性的抑制剂。SARs证实，可以通过在5位（5、6、12）掺入极性基团和小的杂环或通过使用其他含氮碱基（18）来实现DOT1L抑制。根据这些结果，CN-SAH（19）被确定为DOT1L活性的有效和选择性抑制剂，其中结晶晶体显示极性5腈基结合在DOT1L的疏水口袋中。此外，我们表明极性腈基可以用作重卤素原子的非传统替代物。