1-(3-bromo-2,3-dideoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)thymine | 99785-51-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-(3-bromo-2,3-dideoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)thymine
• 英文别名: 3'-bromo-3-deoxythymidine；3'-bromo-3'-deoxy-thymidine；3'-Brom-3'-deoxy-thymidin；Thymidine, 3'-bromo-3'-deoxy-；1-[(2R,4S,5R)-4-bromo-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 99785-51-0
• 化学式: C₁₀H₁₃BrN₂O₄
• 分子量: 305.128
• InChiKey: VSYTWOCFTNWUQF-XLPZGREQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.1
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  78.9
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

制备方法与用途

3'-溴-3'-脱氧胸苷是一种嘌呤核苷类似物，具有广泛的抗肿瘤活性，尤其针对惰性淋巴系统恶性肿瘤。其抗癌机制主要通过抑制DNA合成和诱导细胞凋亡来实现。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(3-bromo-2,3-dideoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)thymine 在 sodium azide 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 齐多夫定
  参考文献：
  名称：

  抗疟药萘醌类。通过点击化学、体外活性、对接 PfDHODH 和 SAR 合成基于lapachol的化合物

  摘要：

  Lapachol 是一种丰富的异戊二烯基萘醌，存在于巴西紫葳科植物中，尽管效果适中，但在过去临床上被用作抗疟药。为了寻找可能更好的抗疟药，通过对 lapacol 进行化学改性合成了一系列 1,2,3-三唑衍生物。羟基的烷基化得到其炔丙基醚，通过铜催化的环加成 （CuAAC） 点击化学与不同的有机叠氮化物，得到 17 种萘喹啉酰三唑衍生物。评价 所有合成化合物对耐氯喹恶性疟原虫 （W2） 的体外活性和对 HepG2 细胞的细胞毒性。含有萘喹酰三唑部分的化合物显示出比 lapachol 更高的抗疟活性 （IC50 123.5 μM），选择性指数 （SI） 值在 4.5-197.7 范围内。对 lapachol、atovaquone 和所有新合成的化合物进行分子对接模拟，以与 PfDHODH 相互作用，PfDHODH 是寄生虫呼吸链的线粒体酶，对从头嘧啶生物合成至关重要。萘喹啉基三唑衍生物与 PfDHODH

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2017.12.051
• 作为产物：
  描述：

  1-(3-bromo-2,3-dideoxy-5-O-trityl-β-D-erythro-pentofuranosyl)thymine 在 水 、 溶剂黄146 作用下， 反应 0.5h， 以36%的产率得到1-(3-bromo-2,3-dideoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)thymine
  参考文献：
  名称：

  3′-Bromo Analogues of Pyrimidine Nucleosides as a New Class of Potent Inhibitors ofMycobacterium tuberculosis

  摘要：

  Tuberculosis (TB) is a major health problem worldwide. We herein report a new class of pyrimidine nucleosides as potent inhibitors of Mycobacterium tuberculosis (M. tuberculosis). Various 2'- or 3'-halogeno derivatives of pyrimidine nucleosides containing uracil, 5-fluorouracil, and thymine bases were synthesized and evaluated for antimycobacterial activities. Among the compounds tested, 3'-bromo-3'-deoxy-arabinofuranosylthymine (3') was the most effective antituberculosis agent in the in vitro assays against wild-type M. tuberculosis strain (H37Ra) (MIC50 = 1 mu g/mL) as well as drug-resistant (H37Rv) (rifampicin-resistant and isoniazid-resistant) strains of M. tuberculosis (MIC50 = 1-2 mu g/mL). Compound 3' also inhibited intracellular M. tuberculosis in a human monocytic cell line infected with H37Ra, demonstrating higher activity against intramacrophagic mycobacteria (80% reduction at 10 mu g/mL concentration) than extracellular mycobacteria (75% reduction at 10 mu g/mL concentration). In contrast, pyrimidine nucleosides possessing 5-fluorouracil base were weak inhibitors of M. tuberculosis. No cytotoxicity was found up to the highest concentration of compounds tested (CC50 > 100-200 mu g/mL) against a human cell line. Overall, these encouraging results substantiate the potential of this new class of compounds as promising antituberculosis agents.

  DOI：

  10.1021/jm100165w