methyl (1S,3S)-1-(4-bromophenyl)-2-(2-chloroacetyl)-1,3,4,9-tetrahydropyrido[3,4-b]indole-3-carboxylate | 1415726-36-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 生物碱及其衍生物 - 哈马拉生物碱
• 英文名称: methyl (1S,3S)-1-(4-bromophenyl)-2-(2-chloroacetyl)-1,3,4,9-tetrahydropyrido[3,4-b]indole-3-carboxylate
• CAS: 1415726-36-1
• 化学式: C₂₁H₁₈BrClN₂O₃
• 分子量: 461.743
• InChiKey: XBQXEZCLJLKIDH-PXNSSMCTSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.18
• 重原子数：
  28.0
• 可旋转键数：
  3.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  62.4
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  3.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl (1S,3S)-1-(4-bromophenyl)-2-(2-chloroacetyl)-1,3,4,9-tetrahydropyrido[3,4-b]indole-3-carboxylate 在 N-甲基吗啉 、 氯甲酸乙酯 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 25.0h， 生成 (6S,12aS)-4-[6-(4-bromophenyl)-1,4-dioxo-3,4,6,7,12,12ahexahydro-1H-pyrazino[1′,2′:1,6]pyrido[3,4-b]indol-2-yl]-N-hydroxybutyramide
  参考文献：
  名称：

  扩展他达拉非支架的用途：开发新型选择性磷酸二酯酶 5 抑制剂和组蛋白脱乙酰酶抑制剂。

  摘要：

  在此，我们介绍了他达拉非类似物的新型化学系列的合成和表征，这些化学系列显示出不同的药理学特征。具有 6R、12aR 构型和由哌嗪二酮氮产生的侧链末端羧酸基团的化合物是有效的 PDE5 抑制剂，其中化合物 11 具有与他达拉非几乎相同的效力，并且比 PDE11（他达拉非最常见的脱靶）具有更高的选择性。将立体化学修饰为 6S、12aS 构型并采用异羟肟酸部分作为末端基团产生仅抑制 HDAC 的化合物。使用具有 6R、12aR 构型和异羟肟酸部分作为末端基团的化合物可以实现 PDE5/HDAC 双重抑制。针对不同来源的多种细胞系评估了合成化合物的抗癌活性。这些化合物对属于淋巴增殖性癌症以及实体瘤的细胞系具有抗癌活性。尽管之前的报道表明 PDE5 抑制剂具有抗癌活性，但这些化合物的生长抑制活性似乎仅依赖于 HDAC 抑制。化合物 26（泛 HDAC IC50 = 14 nM，PDE5 IC50 =

  DOI：

  10.1016/j.bioorg.2020.103742
• 作为产物：
  描述：

  D-色氨酸 在 碳酸氢钠 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 102.08h， 生成 methyl (1S,3S)-1-(4-bromophenyl)-2-(2-chloroacetyl)-1,3,4,9-tetrahydropyrido[3,4-b]indole-3-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  扩展他达拉非支架的用途：开发新型选择性磷酸二酯酶 5 抑制剂和组蛋白脱乙酰酶抑制剂。

  摘要：

  在此，我们介绍了他达拉非类似物的新型化学系列的合成和表征，这些化学系列显示出不同的药理学特征。具有 6R、12aR 构型和由哌嗪二酮氮产生的侧链末端羧酸基团的化合物是有效的 PDE5 抑制剂，其中化合物 11 具有与他达拉非几乎相同的效力，并且比 PDE11（他达拉非最常见的脱靶）具有更高的选择性。将立体化学修饰为 6S、12aS 构型并采用异羟肟酸部分作为末端基团产生仅抑制 HDAC 的化合物。使用具有 6R、12aR 构型和异羟肟酸部分作为末端基团的化合物可以实现 PDE5/HDAC 双重抑制。针对不同来源的多种细胞系评估了合成化合物的抗癌活性。这些化合物对属于淋巴增殖性癌症以及实体瘤的细胞系具有抗癌活性。尽管之前的报道表明 PDE5 抑制剂具有抗癌活性，但这些化合物的生长抑制活性似乎仅依赖于 HDAC 抑制。化合物 26（泛 HDAC IC50 = 14 nM，PDE5 IC50 =

  DOI：

  10.1016/j.bioorg.2020.103742

文献信息

• Exploring the PDE5 H-pocket by ensemble docking and structure-based design and synthesis of novel β-carboline derivatives
  作者：Nermin S. Ahmed、Amal H. Ali、Shreen M. El-Nashar、Bernard D. Gary、Alexandra M. Fajardo、Heather N. Tinsley、Gary A. Piazza、Matthias Negri、Ashraf H. Abadi

  DOI：10.1016/j.ejmech.2012.09.029

  日期：2012.11

  By studying the co-crystal information of interactions between PDE5 and its inhibitors, forty new tetrahydro-beta-carbolines based-analogues were synthesized, and tested for their PDE5 inhibition. Some compounds were as active as tadalafil in inhibiting PDE5 and of better selectivity profile particularly versus PDE11A, the nature of the terminal ring and its nitrogen substituent are the main determinants of selectivity. Ensemble docking confirmed the role of H-loop closed conformer in activity versus its occluded and open forms. Conformational studies showed the effect of bulkiness of the terminal ring N-alkyl substituent on the formation of stable enzyme ligands conformers. The difference in potencies of hydantoin and piperazinedione analogues, together with the necessity of C-5/C-6 R-absolute configuration has been revealed through molecular docking. (C) 2012 Elsevier Masson SAS. All rights reserved.