5-[(p-pentylphenyl)ethynyl]-2'-deoxyuridine | 376367-59-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-[(p-pentylphenyl)ethynyl]-2'-deoxyuridine
• 英文别名: 4-pentylphenylethynyldeoxyuridine；2′-deoxy-5-(4-pentylphenyl)ethynyluridine；5-((4-pentylphenyl)ethynyl)-2'-deoxyuridine；1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-[2-(4-pentylphenyl)ethynyl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 376367-59-8
• 化学式: C₂₂H₂₆N₂O₅
• 分子量: 398.459
• InChiKey: VTTNELATBGQFQZ-XUVXKRRUSA-N

物化性质

• 密度：
  1.32±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.9
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  99.1
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-[(p-pentylphenyl)ethynyl]-2'-deoxyuridine 在 copper(l) iodide 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 CF-1743
  参考文献：
  名称：

  带有芳基侧链的双环呋喃嘧啶核苷对水痘带状疱疹病毒有高度有效和选择性的抑制作用。

  摘要：

  除了我们最近对一些带有长烷基侧链的不寻常的双环呋喃嘧啶核苷的强抗水痘带状疱疹病毒（VZV）活性的报道外，我们在本文中还报道了通过在苯甲酸酯中加入苯基来进一步显着增强抗病毒效力的方法。这些化合物的侧链。通过一系列对位取代的芳基乙炔与5-碘2'-脱氧尿苷的Pd催化偶联，制备目标结构，得到中间体5-炔基核苷，将其在Cu存在下环化，得到所需的双环系统。这些化合物对VZV表现出非凡的效能和选择性。最活跃的是 比参考化合物阿昔洛韦和钙的效力强1万倍。比我们先前报道的烷基类似物强100倍。当前的化合物几乎没有细胞毒性，导致选择性指数值> / = 1 000000。从一系列测试的DNA和RNA病毒中，只有VZV被这些化合物抑制，表明它们对这种目标病毒具有极高的选择性。分子的新颖性，再加上极高的效能和选择性，理想的理化性质以及相对易于合成，使得它们对于潜在的VZV感染药物开发具有相当大的兴趣。

  DOI：

  10.1021/jm000210m
• 作为产物：
  描述：

  碘苷 、 4-戊基苯乙炔 在 copper(l) iodide 、 四(三苯基膦)钯 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 18.0h， 生成 5-[(p-pentylphenyl)ethynyl]-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  新颖的芳基取代双环呋喃核苷作为极强潜力和选择性抗VZV剂

  摘要：

  尽管最近我们采用某些概念，即某些长链5-炔基-2'-脱氧尿苷经过明智的化学磷酸化，可能会通过“激酶旁路”（1-5）赋予它们一些有用的生物学特性，但我们首先注意到当时，合成的副产物在亲本5-炔基核苷的制备中对VZV（水痘-带状疱疹病毒）显示出显着的效力和唯一选择性（6）。这种不寻常的化合物代表了一个全新的强效抗病毒核苷家族中的第一个，该家族作为具有高固有亲脂性的新型抗病毒药物可能具有相当大的潜力，而且其固有荧光可能导致其在生物化学中的广泛应用。5-炔基-2'-脱氧尿苷的常规合成涉及末端炔与5-碘核苷（7-8）的钯催化偶联。在这种偶联反应中，通常不需要的副产物是荧光呋喃基嘧啶（1）[图2]。[1]被许多研究人员指出是TLC的一个较慢的问题（7–9）。以前，在2'-脱氧系列中唯一可以很好地表征荧光副产物的例子是母体化合物（1a）（10-12）[Fig。1]和

  DOI：

  10.1081/ncn-100002299

文献信息

• Metallo-nucleosides: synthesis and biological evaluation of hexacarbonyl dicobalt 5-alkynyl-2′-deoxyuridines
  作者：Craig D. Sergeant、Ingo Ott、Adam Sniady、Srinivasarao Meneni、Ronald Gust、Arnold L. Rheingold、Roman Dembinski

  DOI：10.1039/b713371e

  日期：——

  Reactions of 5-alkynyl-2'-deoxyuridines with dicobalt octacarbonyl Co2(CO)8 in THF at room temperature gave hexacarbonyl dicobalt nucleoside complexes (77-93%). The metallo-nucleosides were characterized, including an X-ray structure of a 1-cyclohexanol derivative. In crystalline form, the Co-Co bond is perpendicular to the plane of the uracil base, which is found in the anti position. The level of

  室温下，5-炔基-2'-脱氧尿苷与二钴二羰基八羰基Co2（CO）8在THF中的反应得到六羰基二钴核苷配合物（77-93％）。表征金属核苷，包括1-环己醇衍生物的X射线结构。呈晶体形式时，Co-Co键垂直于尿嘧啶碱基的平面，该位置位于反位。检查了MCF-7和MDA-MB-231人乳腺癌细胞系的生长抑制水平，并将其与使用炔基核苷前体获得的结果进行了比较。钴化合物显示出良好的抗增殖活性，IC50值在5-50 microM的范围内。有趣的是，二甲双羰基羰基部分与5-炔基-2'的配位 -脱氧尿苷导致炔烃的非核苷侧的烷基/芳基取代基的细胞毒性显着增加，但是在氢（末端炔基）或甲硅烷基的情况下，观察到细胞毒性作用的降低。如使用活性和低活性靶标化合物的实施例所证明的，细胞毒性受到肿瘤细胞摄取和细胞核生物分布的显着影响。
• 5-Alkynyl-2′-deoxyuridines: Chromatography-free synthesis and cytotoxicity evaluation against human breast cancer cells
  作者：Srinivasarao Meneni、Ingo Ott、Craig D. Sergeant、Adam Sniady、Ronald Gust、Roman Dembinski

  DOI：10.1016/j.bmc.2007.01.048

  日期：2007.4

  Starting with 5-iodo-2'-deoxyuridine, a series of 5-alkynyl-2'-deoxyuridines (with n-propyl, cyclopropyl, 1-hydroxycyclohexyl, p-tolyl, p-tert-butylphenyl, p-pentylphenyl, and trimethylsilyl alkyne substituents) have been synthesized via the palladium-catalyzed (Sonogashira) coupling reaction followed by a simplified isolation protocol (76-94% yield). The cytotoxic activity of modified nucleosides

  以5-碘-2'-脱氧尿苷为起始，一系列5-炔基-2'-脱氧尿苷（含正丙基、环丙基、1-羟基环己基、对甲苯基、对叔丁基苯基、对戊基苯基和三甲基甲硅烷基）炔烃取代基）通过钯催化（Sonogashira）偶联反应合成，然后采用简化的分离方案（产率 76-94%）。修饰核苷对 MCF-7 和 MDA-MB-231 人乳腺癌细胞的细胞毒活性已在体外测定。5-乙炔基-2'-脱氧尿苷是该系列中唯一含有末端乙炔的核苷，是最有效的抑制剂，MCF-7 的 IC(50) (microM) 为 0.4+/-0.3，MDA 为 4.4+/-0.4 -MB-231。
• Bicyclic anti-VZV nucleosides: thieno analogues bearing an alkylphenyl side chain have reduced antiviral activity
  作者：Annette Angell、Christopher McGuigan、Luis Garcia Sevillano、Robert Snoeck、Graciela Andrei、Erik De Clercq、Jan Balzarini

  DOI：10.1016/j.bmcl.2004.03.029

  日期：2004.5

  Thieno analogues of the potent and selective furo-pyrimidine anti-VZV nucleoside family bearing a p-alkylphenyl side chain have been synthesised and tested for their antiviral activity against Varicella-Zoster virus (VZV). While the alkyl chain analogues were shown to retain full antiviral activity against VZV, these new analogues did not when compared to their furo parent nucleosides. (C) 2004 Published by Elsevier Ltd.
• NOVEL ARYL SUBSTITUTED BICYCLIC FURO NUCLEOSIDES AS EXTREMELY POTENT AND SELECTIVE ANTI-VZV AGENTS
  作者：Christopher McGuigan、Hubert Barucki、Antonella Carangio、Sally Blewett、Sheila Srinivasan、Graciela Andrei、Robert Snoeck、Erik De Clercq、Jan Balzarini

  DOI：10.1081/ncn-100002299

  日期：2001.3.31

  for VZV (Varicella-Zoster Virus) (6). This unusual compound represented the first in an entirely new family of potent antiviral nucleosides which may have considerable potential as new antiviral drugs with high inherent lipophilicity, and moreover whose intrinsic fluorescence, may lead to their wider utility in biochemistry. The conventional synthesis of 5-alkynyl-2′-deoxyuridines involves the Pdcatalysed

  尽管最近我们采用某些概念，即某些长链5-炔基-2'-脱氧尿苷经过明智的化学磷酸化，可能会通过“激酶旁路”（1-5）赋予它们一些有用的生物学特性，但我们首先注意到当时，合成的副产物在亲本5-炔基核苷的制备中对VZV（水痘-带状疱疹病毒）显示出显着的效力和唯一选择性（6）。这种不寻常的化合物代表了一个全新的强效抗病毒核苷家族中的第一个，该家族作为具有高固有亲脂性的新型抗病毒药物可能具有相当大的潜力，而且其固有荧光可能导致其在生物化学中的广泛应用。5-炔基-2'-脱氧尿苷的常规合成涉及末端炔与5-碘核苷（7-8）的钯催化偶联。在这种偶联反应中，通常不需要的副产物是荧光呋喃基嘧啶（1）[图2]。[1]被许多研究人员指出是TLC的一个较慢的问题（7–9）。以前，在2'-脱氧系列中唯一可以很好地表征荧光副产物的例子是母体化合物（1a）（10-12）[Fig。1]和
• Highly Potent and Selective Inhibition of Varicella-Zoster Virus by Bicyclic Furopyrimidine Nucleosides Bearing an Aryl Side Chain
  作者：Christopher McGuigan、Hubert Barucki、Sally Blewett、Antonella Carangio、Jonathan T. Erichsen、Graciela Andrei、Robert Snoeck、Erik De Clercq、Jan Balzarini

  DOI：10.1021/jm000210m

  日期：2000.12.1

  In addition to our recent report on the potent anti-varicella-zoster virus (VZV) activity of some unusual bicyclic furopyrimidine nucleosides bearing long alkyl side chains, we herein report the further significant enhancement of the antiviral potency by inclusion of a phenyl group in the side chain of these compounds. The target structures were prepared by the Pd-catalyzed coupling of a series of

  除了我们最近对一些带有长烷基侧链的不寻常的双环呋喃嘧啶核苷的强抗水痘带状疱疹病毒（VZV）活性的报道外，我们在本文中还报道了通过在苯甲酸酯中加入苯基来进一步显着增强抗病毒效力的方法。这些化合物的侧链。通过一系列对位取代的芳基乙炔与5-碘2'-脱氧尿苷的Pd催化偶联，制备目标结构，得到中间体5-炔基核苷，将其在Cu存在下环化，得到所需的双环系统。这些化合物对VZV表现出非凡的效能和选择性。最活跃的是 比参考化合物阿昔洛韦和钙的效力强1万倍。比我们先前报道的烷基类似物强100倍。当前的化合物几乎没有细胞毒性，导致选择性指数值> / = 1 000000。从一系列测试的DNA和RNA病毒中，只有VZV被这些化合物抑制，表明它们对这种目标病毒具有极高的选择性。分子的新颖性，再加上极高的效能和选择性，理想的理化性质以及相对易于合成，使得它们对于潜在的VZV感染药物开发具有相当大的兴趣。