5-((3aR,6S,6aS)-2-Oxo-hexahydro-thieno[3,4-d]imidazol-6-yl)-pentanoic acid (4-[1,3]dioxolan-2-yl-3-nitro-phenyl)-amide | 475114-62-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 生物素及其衍生物
• 英文名称: 5-((3aR,6S,6aS)-2-Oxo-hexahydro-thieno[3,4-d]imidazol-6-yl)-pentanoic acid (4-[1,3]dioxolan-2-yl-3-nitro-phenyl)-amide
• 英文别名: 5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-N-[4-(1,3-dioxolan-2-yl)-3-nitrophenyl]pentanamide
• CAS: 475114-62-6
• 化学式: C₁₉H₂₄N₄O₆S
• 分子量: 436.489
• InChiKey: GPXZEUCVEOXXNB-QRTARXTBSA-N

物化性质

• 沸点：
  748.0±60.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.379±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.9
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  160
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-((3aR,6S,6aS)-2-Oxo-hexahydro-thieno[3,4-d]imidazol-6-yl)-pentanoic acid (4-[1,3]dioxolan-2-yl-3-nitro-phenyl)-amide 在 硫酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 反应 4.0h， 以76%的产率得到5-((3aR,6S,6aS)-2-Oxo-hexahydro-thieno[3,4-d]imidazol-6-yl)-pentanoic acid (4-formyl-3-nitro-phenyl)-amide
  参考文献：
  名称：

  生物素-苯基重氮甲烷共轭物作为单和多核苷酸中磷酸盐的标记试剂。

  摘要：

  制备在其结构中包括生物素部分作为可检测单元并且不同取代的苯基重氮官能团作为反应性基团的分子2-5，作为标记单和多核苷酸中磷酸基团的试剂。这些分子显示出与模型核苷酸3'-UMP选择性和定量反应。它们已使用高密度DNA芯片（或微阵列）技术成功用于DNA和RNA分析的标记步骤。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2004.12.046
• 作为产物：
  描述：

  2,4-二硝基苯甲醛 在 N-甲基吗啉 、 sodium sulfide 、 对甲苯磺酸 、 氯甲酸异丁酯 作用下， 以 乙醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 11.0h， 生成 5-((3aR,6S,6aS)-2-Oxo-hexahydro-thieno[3,4-d]imidazol-6-yl)-pentanoic acid (4-[1,3]dioxolan-2-yl-3-nitro-phenyl)-amide
  参考文献：
  名称：

  生物素-苯基重氮甲烷共轭物作为单和多核苷酸中磷酸盐的标记试剂。

  摘要：

  制备在其结构中包括生物素部分作为可检测单元并且不同取代的苯基重氮官能团作为反应性基团的分子2-5，作为标记单和多核苷酸中磷酸基团的试剂。这些分子显示出与模型核苷酸3'-UMP选择性和定量反应。它们已使用高密度DNA芯片（或微阵列）技术成功用于DNA和RNA分析的标记步骤。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2004.12.046

文献信息

• US7338805B2
  申请人：——

  公开号：US7338805B2

  公开（公告）日：2008-03-04
• Biotin-phenyldiazomethane conjugates as labeling reagents at phosphate in mono and polynucleotides
  作者：Cécile Bourget、Emmanuelle Trévisiol、Isabelle Bridon、Mitsuharu Kotera、Jean Lhomme、Ali Laayoun

  DOI：10.1016/j.bmc.2004.12.046

  日期：2005.3.1

  Molecules 2-5 that include in their structure a biotin moiety as detectable unit and differently substituted phenyl diazo functions as reactive group were prepared as reagents for labeling the phosphate group in mono and polynucleotides. These molecules were shown to react selectively and quantitatively with the model nucleotide 3'-UMP. They were used successfully in the labeling step of DNA and RNA

  制备在其结构中包括生物素部分作为可检测单元并且不同取代的苯基重氮官能团作为反应性基团的分子2-5，作为标记单和多核苷酸中磷酸基团的试剂。这些分子显示出与模型核苷酸3'-UMP选择性和定量反应。它们已使用高密度DNA芯片（或微阵列）技术成功用于DNA和RNA分析的标记步骤。