2-Cyclopentylsulfanyl-6-(1-naphthalen-1-yl-ethyl)-3H-pyrimidin-4-one

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 萘
• 英文名称: 2-Cyclopentylsulfanyl-6-(1-naphthalen-1-yl-ethyl)-3H-pyrimidin-4-one
• 英文别名: 2-cyclopentylsulfanyl-4-[1-(1-naphthyl)ethyl]-1H-pyrimidin-6-one；2-cyclopentylsulfanyl-4-(1-naphthalen-1-ylethyl)-1H-pyrimidin-6-one
• 化学式: C₂₁H₂₂N₂OS
• 分子量: 350.484
• InChiKey: CEMLODIQTPVPCA-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  66.8
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  1-萘乙酸 在 六甲基磷酰三胺 、 sodium ethanolate 、 potassium carbonate 、 三乙胺 、 magnesium chloride 、 lithium diisopropyl amide 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 正庚烷 、 乙基苯 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 33.83h， 生成 2-Cyclopentylsulfanyl-6-(1-naphthalen-1-yl-ethyl)-3H-pyrimidin-4-one
  参考文献：
  名称：

  构象受限的新型2-烷硫基-6- [1-（2,6-二氟苯基）烷基] -3,4-二氢-5-烷基嘧啶-4（3H）-的结构设计，合成和生物学评估HIV-1逆转录酶的非核苷抑制剂。

  摘要：

  最近已将5-烷基-2-（烷硫基）-6-（2,6-二氟苄基）-3,4-二氢嘧啶-4（3H）-ones（S-DABOs，2）描述为一类新的人类免疫缺陷在纳摩尔浓度下具有活性的病毒1型（HIV-1）非核苷逆转录酶（RT）抑制剂（Mai，A. et al.J.Med.Chem.1999，42，619-627）。为了进行领先的优化工作，我们设计了新颖的构象受限的S-DABO，3，其苄基碳原子（Y = Me）和嘧啶5位（R = Me）具有甲基。构象分析和对接模拟表明，两种甲基的存在将显着降低构象柔性，而不会损害R对映异构体适合RT非核苷结合口袋的能力。要发展结构与活动的关系，我们准备了几种3型同源物，它们属于胸腺嘧啶（R = Me）和尿嘧啶（R = H）系列，具有各种2-烷硫基侧链（X = Me，i-Pr，n-Bu，i-Bu，s -Bu，c-戊基和c-己基）和不同于2,6-二氟苯基（Ar =苯基，2,

  DOI：

  10.1021/jm010853h

文献信息

• Structure-Based Design, Synthesis, and Biological Evaluation of Conformationally Restricted Novel 2-Alkylthio-6-[1-(2,6-difluorophenyl)alkyl]- 3,4-dihydro-5-alkylpyrimidin-4(3<i>H</i>)-ones as Non-nucleoside Inhibitors of HIV-1 Reverse Transcriptase
  作者：Antonello Mai、Gianluca Sbardella、Marino Artico、Rino Ragno、Silvio Massa、Ettore Novellino、Giovanni Greco、Antonio Lavecchia、Chiara Musiu、Massimiliano La Colla、Chiara Murgioni、Paolo La Colla、Roberta Loddo

  DOI：10.1021/jm010853h

  日期：2001.8.1

  5-Alkyl-2-(alkylthio)-6-(2,6-difluorobenzyl)-3,4-dihydropyrimidin-4(3H)-ones (S-DABOs, 2) have been recently described as a new class of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) non-nucleoside reverse transcriptase (RT) inhibitors (NNRTIs) active at nanomolar concentrations (Mai, A. et al. J. Med. Chem. 1999, 42, 619-627). In pursuing our lead optimization efforts, we designed novel conformationally

  最近已将5-烷基-2-（烷硫基）-6-（2,6-二氟苄基）-3,4-二氢嘧啶-4（3H）-ones（S-DABOs，2）描述为一类新的人类免疫缺陷在纳摩尔浓度下具有活性的病毒1型（HIV-1）非核苷逆转录酶（RT）抑制剂（Mai，A. et al.J.Med.Chem.1999，42，619-627）。为了进行领先的优化工作，我们设计了新颖的构象受限的S-DABO，3，其苄基碳原子（Y = Me）和嘧啶5位（R = Me）具有甲基。构象分析和对接模拟表明，两种甲基的存在将显着降低构象柔性，而不会损害R对映异构体适合RT非核苷结合口袋的能力。要发展结构与活动的关系，我们准备了几种3型同源物，它们属于胸腺嘧啶（R = Me）和尿嘧啶（R = H）系列，具有各种2-烷硫基侧链（X = Me，i-Pr，n-Bu，i-Bu，s -Bu，c-戊基和c-己基）和不同于2,6-二氟苯基（Ar =苯基，2,