5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)inosine | 119898-59-8

• 物质功能分类: 生物化工 - 核酸类
• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)inosine
• 英文别名: 9-[(2R,3R,4S,5R)-5-{[bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy]methyl}-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]-1,9-dihydro-6H-purin-6-one；5'-O-DMT-rI；9-[(2R,3R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]-1H-purin-6-one
• CAS: 119898-59-8
• 化学式: C₃₁H₃₀N₄O₇
• 分子量: 570.602
• InChiKey: PQXVLEMIGAJLIN-BQOYKFDPSA-N

物化性质

• 溶解度：
  DMSO：250 mg/mL（438.14 mM；需要超声）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.3
• 重原子数：
  42
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.26
• 拓扑面积：
  137
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  9

安全信息

• 储存条件：
  2-8℃

制备方法与用途

应用中的化合物5′-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)肌苷属于核苷酸系列，它作为有机合成的重要中间体，在医药领域同样扮演着关键角色。该化合物广泛应用于实验室研发过程和生物化工医药的合成过程中。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)inosine 在 1,3-二甲基-2-咪唑啉酮 、 四甲基胍 作用下， 反应 23.5h， 生成 2-trimethylsilylethyl N-[2-[2-[9-[(2R,3R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-3-hydroxyoxolan-2-yl]-6-oxopurin-1-yl]ethoxymethylamino]-2-oxoethyl]carbamate
  参考文献：
  名称：

  [EN] NOVEL METHOD FOR PRODUCING ANTIBODY-DRUG CONJUGATE HAVING ANTINEOPLASTIC EFFECT
  [FR] NOUVEAU PROCÉDÉ DE PRODUCTION D'UN CONJUGUÉ ANTICORPS-MÉDICAMENT AYANT UN EFFET ANTINÉOPLASIQUE
  [JA] 抗腫瘍効果を有する抗体薬物複合体の新規製造方法

  摘要：

  本発明の目的は、抗体－免疫賦活化剤コンジュゲートに利用可能な、環状ジヌクレオチド誘導体の高立体選択的な新規製造方法、及びその製造中間体を提供することにある。また、該製造方法を用いた、環状ジヌクレオチド－リンカー及び抗体－免疫賦活化剤コンジュゲートの製造方法を提供することにある。光学活性なホスフィチル化剤を、カップリング時と環化時に２回用いることによって、所望の立体配置を有する環状ジヌクレオチド誘導体を、より高収率で大量に製造可能な方法を提供する。

  公开号：

  WO2024024935A1
• 作为产物：
  描述：

  4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 、 肌苷 以 吡啶 为溶剂， 反应 96.0h， 以59%的产率得到5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)inosine
  参考文献：
  名称：

  2'，3'-seconucleosides III的化学。嘌呤2'，3'-核糖核苷的合成与反应

  摘要：

  用高碘酸将5'-0保护的嘌呤核糖核苷氧化，得到二醛，用硼氢化钠还原后得到5'-0-保护的嘌呤-2'，3'-核糖核苷，将其转化为2'，3'-二-0-甲磺酰基衍生物。它们被转化为2'，3'-二取代-2'，3'-二脱氧衍生物，并且由于2'-0-甲磺酰基的反应性明显低于3'-0-甲磺酰基，因此在2 '或3'-positiorts被实现。作为后一种方法的例子，描述了3'-alnino-3'-deoxy-2'，3'-secoadenosine和3'-deoxy-2'，3'-secoinosine的合成。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)89829-x

文献信息

• Synthesis of 2‘,3‘-Didehydro-2‘,3‘-dideoxynucleosides by Reaction of 5‘-Protected Nucleoside 2‘,3‘-Dimesylates with Telluride Dianion:  A General Route from <i>Cis</i> Vicinal Diols to Olefins
  作者：Derrick L. J. Clive、Philip L. Wickens、Paulo W. M. Sgarbi

  DOI：10.1021/jo9610570

  日期：1996.1.1

  treatment with telluride dianion in the form of the sodium or lithium salt. The method is well-suited to the preparation of unsaturated nucleosides that can be converted into compounds that are believed to be useful in the treatment of AIDS. The deoxygenation is general for vicinal dimesylates that have, or may adopt, a synperiplanar conformation. With straight chain compounds the reaction is stereospecific

  通过用钠或锂盐形式的碲化物二价阴离子处理，将5'-保护的核苷的2'，3'-二甲磺酸酯转化为相应的2'，3'-二氢-2'，3'-二脱氧化合物。该方法非常适合于不饱和核苷的制备，该不饱和核苷可以转化为据信可用于治疗艾滋病的化合物。脱氧通常用于具有或可以采用间平面构象的邻近二甲基酯。对于直链化合物，反应是立体特异性的。在某些情况下，可以用硒化物二价阴离子进行类似但较慢的脱氧。
• [EN] STING MODULATOR COMPOUNDS, AND METHODS OF MAKING AND USING<br/>[FR] COMPOSÉS MODULATEURS DE STING, ET PROCÉDÉS DE FABRICATION ET D'UTILISATION
  申请人：TAKEDA PHARMACEUTICALS CO

  公开号：WO2019092660A1

  公开（公告）日：2019-05-16

  The present disclosure provides STING modulators/agonists, and methods of synthesis and methods for using for the prophylaxis or treatment of cancer and other STING-related diseases. The present disclosure relates to a compound represented by the Formula (I): wherein each symbol is as defined in the description, or a pharmaceutically acceptable salt thereof.

  本公开提供STING调节剂/激动剂，以及合成方法和用于预防或治疗癌症和其他STING相关疾病的方法。本公开涉及由式(I)表示的化合物：其中每个符号如描述中定义，或其药用可接受盐。
• 1,1,1,3,3,3-Hexafluoro-2-propanol for the removal of the 4,4′-DimethoxytrityI protecting group from the 5′-hydroxyl of acid-sensitive nucleosides and nucleotides
  作者：Nelson J. Leonard、Neelima

  DOI：10.1016/0040-4039(95)01673-6

  日期：1995.10

  1,1,1,3,3,3-Hexafluoro-2-propanol is introduced as a suitable reagent and solvent for the detritylution of 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-nucleosides and -deoxynucleosides, especially those that are susceptible to N-glycosyl cleavage under more strongly acidic conditions.

  引入1,1,1,3,3,3-六氟-2-丙醇作为合适的试剂和溶剂，用于5'- O-（4,4'-二甲氧基三苯甲基）-核苷和-deoxynucleosides，特别是那些的脱三苯胺稀释在更强的酸性条件下易受N-糖基裂解的影响。
• Synthesis and biological evaluation of all possible inosine-mixed cyclic dinucleotides that activate different hSTING variants
  作者：Zhenghua Wang、Cancan Zhao、Chuanlin Wang、Hang Zhang、Dejun Ma、Qiangzhe Zhang、Xin Wen、Luyuan Li、Zhen Xi

  DOI：10.1016/j.bmc.2020.115899

  日期：2021.1

  Cyclic dinucleotides (CDNs) could activate stimulator of interferon genes (STING) protein to produce type I interferon and other pro-inflammation cytokines in mammalian cells. To explore new types of potentially efficient STING activators targeting all five major hSTING variants (WT, R232H, HAQ, AQ and R293Q), we here reported the synthesis of a total of 19 inosine-containing CDNs based on the combinations

  环二核苷酸（CDN）可以激活干扰素基因（STING）蛋白的刺激物，从而在哺乳动物细胞中产生I型干扰素和其他促炎细胞因子。为了探索针对所有五个主要hSTING变体（WT，R232H，HAQ，AQ和R293Q）的新型潜在有效STING激活剂，我们在此报告了基于次黄嘌呤与四种天然黄嘌呤的组合，总共合成了19种含肌苷的CDN。碱基（A，G，C和U）和三个磷酸二酯键主链（3'-3'，2'-3'，2'-2'）。IFN-β诱导结果表明，所有由肌苷和嘌呤核苷连接的2'-3'和2'-2'CDN均与hSTING蛋白的Y167和R238残基堆叠相互作用，并由次黄嘌呤和嘧啶构建了多个CDN。像c [I（2'，5'）U（2'，5'）]也可以激活所有五个hSTING变体。分子动力学模拟和等温滴定热（ITC）分析进一步证明了与cGAMP异构体相比，具有2'-5'磷酸的cAIMP异构体具有以熵驱动的方式与hSTING的R
• Enzymatic Preparation of 2′–5′,3′–5′-Cyclic Dinucleotides, Their Binding Properties to Stimulator of Interferon Genes Adaptor Protein, and Structure/Activity Correlations
  作者：Barbora Novotná、Lenka Vaneková、Martin Zavřel、Miloš Buděšínský、Milan Dejmek、Miroslav Smola、Ondrej Gutten、Zahra Aliakbar Tehrani、Markéta Pimková Polidarová、Andrea Brázdová、Radek Liboska、Ivan Štěpánek、Zdeněk Vavřina、Tomáš Jandušík、Radim Nencka、Lubomír Rulíšek、Evžen Bouřa、Jiří Brynda、Ondřej Páv、Gabriel Birkuš

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.9b01062

  日期：2019.12.12

  (NFκB) signaling cascades. In this work, we describe an enzymatic preparation of 2′–5′,3′–5′-cyclic dinucleotides (2′3′CDNs) with use of cyclic GMP–AMP synthases (cGAS) from human, mouse, and chicken. We profile substrate specificity of these enzymes by employing a small library of nucleotide-5′-triphosphate (NTP) analogues and use them to prepare 33 2′3′CDNs. We also determine affinity of these CDNs to

  环状二核苷酸是环状GMP-AMP合酶（cGAS）-干扰素基因刺激（STING）途径的第二信使，在识别肿瘤细胞和病毒或细菌感染中起着重要作用。它们与STING衔接蛋白结合并通过TANK结合激酶1（TBK1）/干扰素调节因子3（IRF3）和核因子-κB（IκB）激酶（IKK）/核因子-κB（NFκB）抑制剂触发细胞因子的表达信号级联。在这项工作中，我们描述了使用人，小鼠和鸡的环状GMP-AMP合成酶（cGAS）酶法制备2'-5'，3'-5'-环二核苷酸（2'3'CDNs）的方法。我们通过使用一个小的核苷酸5'-三磷酸（NTP）类似物文库来分析这些酶的底物特异性，并使用它们来制备33个2'3'CDN。我们还确定了这些CDN对基于细胞和生化分析的五种不同STING单倍型的亲和力，并描述了它们对所有STING单倍型的最佳活性所需的特性。接下来，我们研究它们对人外周血单核细胞（PBMC）诱导的细胞因子