Fmoc-β-Ala-Wang resin

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并恶嗪类
• 英文名称: Fmoc-β-Ala-Wang resin
• 英文别名: 3-[3-[[4-[(2,2-difluoro-3-oxo-4H-1,4-benzoxazin-6-yl)amino]-5-fluoropyrimidin-2-yl]amino]phenyl]-N-methylpropanamide
• 化学式: C₃₂H₂₈NO₅Pol
• 分子量: 472.4
• InChiKey: NRDXRIKQJUKTSL-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.3
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.18
• 拓扑面积：
  117
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Fmoc-β-Ala-Wang resin 、 N,N-双(3-氨丙基)甲胺 、 4-(4-((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)氨基)-1-甲基-1H-吡咯-2-甲酰胺基)-1-甲基-1H-咪唑-2-羧酸 、 FMOC-beta-丙氨酸 、 、 4-(FMOC-氨基)-1-甲基-1H-吡咯-2-羧酸 在 哌啶 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.08h， 以17%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  识别人类端粒的串联发夹吡咯-咪唑聚酰胺的结构评估

  摘要：

  含有 N-甲基吡咯 (Py) 和 N-甲基咪唑 (Im) 的聚酰胺，称为 PIPA，以高亲和力和特异性结合双螺旋 DNA 小沟中的特定核苷酸序列。基于最近关于端粒可视化的 PIPA 合成报告，本文重点研究串联发夹 PIPA 的两个 PIPA 段的连接部分（铰链区）的大小，Dab(Im-Im-Py)-Py- Py-Py-Im-[铰链]-Dab(Im-Im-Py)-Py-Py-Py-Im-βAla-NH(CH2)3N(CH3)-(CH2)3NH-[染料]。本论文还描述了通过测量热熔化温度和表面等离子体共振以及通过对人类细胞中的端粒 (TTAGGG)n 进行特异性染色来表征结合。还通过高分辨率质谱法研究了微异质性。

  DOI：

  10.1021/ja506058e

文献信息

• Structural Evaluation of Tandem Hairpin Pyrrole–Imidazole Polyamides Recognizing Human Telomeres
  作者：Akiyoshi Hirata、Kiyoshi Nokihara、Yusuke Kawamoto、Toshikazu Bando、Asuka Sasaki、Satoru Ide、Kazuhiro Maeshima、Takeshi Kasama、Hiroshi Sugiyama

  DOI：10.1021/ja506058e

  日期：2014.8.13

  A polyamide containing N-methylpyrrole (Py) and N-methylimidazole (Im), designated PIPA, binds with high affinity and specificity to specific nucleotide sequences in the minor groove of double-helical DNA. Based on a recent report of the synthesis of PIPA for telomere visualization, the present paper focused on the size of the connecting part (hinge region) of two PIPA segments of the tandem hairpin

  含有 N-甲基吡咯 (Py) 和 N-甲基咪唑 (Im) 的聚酰胺，称为 PIPA，以高亲和力和特异性结合双螺旋 DNA 小沟中的特定核苷酸序列。基于最近关于端粒可视化的 PIPA 合成报告，本文重点研究串联发夹 PIPA 的两个 PIPA 段的连接部分（铰链区）的大小，Dab(Im-Im-Py)-Py- Py-Py-Im-[铰链]-Dab(Im-Im-Py)-Py-Py-Py-Im-βAla-NH(CH2)3N(CH3)-(CH2)3NH-[染料]。本论文还描述了通过测量热熔化温度和表面等离子体共振以及通过对人类细胞中的端粒 (TTAGGG)n 进行特异性染色来表征结合。还通过高分辨率质谱法研究了微异质性。