严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (
SARS-CoV-2) 主要
蛋白酶 (M pro ) 已成为开发针对 COVID-19 感染的抗
SARS-CoV-2 药物的目标,因为 M pro处理必需的病毒多蛋白并发挥关键作用在
SARS-CoV-2 复制中的作用。在这项研究中,我们报告了源自
卡莫氟的新型
SARS-CoV-2 M pro
抑制剂的开发,
卡莫氟是一种先前鉴定的化合物,作为
SARS-CoV-2 M pro的共价
抑制剂显示出中等效力。为了采用结构引导的药物设计策略,首先通过对接模拟预测了
卡莫氟在 M pro催化活性位点上的假定完整结合模式。基于预测的结合模式,对一系列旨在占据M pro底物结合区域的
卡莫氟衍
生物进行了构效关系分析。结果, 发现了一种基于
吲哚的衍
生物,推测与 S4 结合袋相互作用, 21b (IC 50 = 1.5 ± 0.1 μM)。通过结合对接模拟、自由能扰动计算和子口