3',5'-O-di(triethylsilyl)-5,6-dihydrothymidine | 878142-93-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 哌啶类
• 英文名称: 3',5'-O-di(triethylsilyl)-5,6-dihydrothymidine
• 英文别名: 3',5'-O-di-triethylsilyl-5,6-dihydrothymidine；5-methyl-1-[(2R,4S,5R)-4-triethylsilyloxy-5-(triethylsilyloxymethyl)oxolan-2-yl]-1,3-diazinane-2,4-dione
• CAS: 878142-93-9
• 化学式: C₂₂H₄₄N₂O₅Si₂
• 分子量: 472.773
• InChiKey: OHZIWMJLFKQDLM-CBHJWYHGSA-N

物化性质

• 密度：
  1.04±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.7
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.91
• 拓扑面积：
  77.1
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3',5'-O-di(triethylsilyl)-5,6-dihydrothymidine 在 咪唑 、 氟化氢吡啶 、 N,N-二异丙基乙胺 、 lithium diisopropyl amide 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 79.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  含有甲缩醛接头的二核苷酸孢子光产物类似物的化学合成、晶体结构和酶促评价

  摘要：

  孢子光产物 (SP) 是在细菌内生孢子中发现的唯一 DNA 光损伤产物。它通过金属酶孢子光产物裂解酶 (SPL) 进行光形成和修复，构成了独特的 SP 生物化学。尽管SP已在近50年前被发现，但其晶体结构仍然未知，结构信息的缺乏极大地阻碍了SP生物化学的研究。使用甲缩醛连接剂和有机合成，我们成功地制备了二核苷酸 SP 等排体 5 R -CH 2 SP，其中包含一个中性 CH 2两个胸腺嘧啶残基之间的部分而不是磷酸盐。中性连接子极大地促进了结晶过程，使我们能够在发现半个世纪后获得这种有趣的胸腺嘧啶二聚体的晶体结构。对该 5 R -CH 2 SP 化合物的进一步 ROESY 光谱、DFT 计算和酶促研究证明它具有与 5 R -SP 物种相似的特性，表明所揭示的结构真正反映了自然界中产生的 SP 的结构。

  DOI：

  10.1002/chem.201101821
• 作为产物：
  描述：

  α-bromo-3′,5′-O-bis(tert-butyldimethylsilyl)-3-[(trimethylsilylethoxy)methyl]thymidine 在 Rh/Al₂O₃ 、 (S)-adenosylmethionine 咪唑 、 DL-dithiothreitol 、 potassium chloride 、 四丁基氟化铵 、 氢气 、 四氯化锡 、 lithium diisopropyl amide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 正己烷 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 91.5h， 生成 3',5'-O-di(triethylsilyl)-5,6-dihydrothymidine
  参考文献：
  名称：

  DNA孢子光产物类似物的合成和立体化学分配。

  摘要：

  缺乏详细酶学研究所需的确定底物，严重阻碍了由孢子光产物（SP）裂解酶修复酶进行的DNA修复过程的研究。该问题特别严重，因为修复酶属于强氧敏感性自由基（S）-腺苷甲硫氨酸（SAM）酶，众所周知，这种酶很难处理。我们报告了孢子光产物类似物1 a和1 b的合成，它们具有开放的骨架和非对映异构体。为了解决立体化学分配的问题，制备了另外两个具有封闭主链的衍生物2a和2b。合成2 a / b的关键步骤是基于易位的大环化，可大大提高合成孢子光产物衍生物的构象刚度。环状异构体的NOESY实验提供了清晰的峰间模式，可以明确地分配立体化学。将结果转移到异构体1a和1b的数据中，随后将其用于酶修复研究。这些研究是用来自嗜热脂肪地芽孢杆菌的新型孢子光产物裂解酶修复酶进行的。研究表明，根据我们最近对枯草芽孢杆菌的孢子光产物裂解酶进行的研究，发现只有S异构体1a被识别和修复。现在，制备确定的功能性底物的能力为SP裂解

  DOI：

  10.1002/chem.200600169

文献信息

• The spore photoproduct lyase repairs the 5S- and not the 5R-configured spore photoproduct DNA lesion
  作者：Marcus G. Friedel、Olivier Berteau、J. Carsten Pieck、Mohamed Atta、Sandrine Ollagnier-de-Choudens、Marc Fontecave、Thomas Carell

  DOI：10.1039/b514103f

  日期：——

  The spore photoproduct lyase is a Fe-S/AdoMet DNA repair enzyme, which directly repairs spore lesions, induced by UV irradiation of spores, using an unknown radical mechanism. The air sensitive radical SAM enzyme was for the first time challenged with synthetically pure substrates. It was found that the enzyme recognizes a synthetic 5S-configured spore lesion without the central phosphodiester bond

  孢子光产物裂解酶是一种Fe-S / AdoMet DNA修复酶，它利用未知的自由基机理直接修复由孢子的紫外线照射诱导的孢子损伤。空气敏感性自由基SAM酶首次受到合成纯底物的挑战。发现该酶识别没有中央磷酸二酯键的合成的5S-构型的孢子损伤。与5R构型的病变相反，目前的看法不是底物。
• Synthesis of the Dinucleotide Spore Photoproduct
  作者：Seong Jin Kim、Cathy Lester、Tadhg P. Begley

  DOI：10.1021/jo00125a006

  日期：1995.10
• Chemoselective Deprotection of Triethylsilyl Ethers
  作者：Tilak Chandra、William E. Broderick、Joan B. Broderick

  DOI：10.1080/15257770903362172

  日期：2009.12.7

  An efficient and selective method was developed for the deprotection of triethylsilyl (TES) ethers using formic acid in methanol (5-10%) or in methylene chloride 2-5%) with excellent yields. TES ethers are selectively deprotected to the corresponding alcohols in high yields using formic acid in methanol under mild reaction conditions. Other hydroxyl protecting groups like t-butyldimethylsilyl (TBDMS) remain unaffected.