(fluoromethylene)bisphosphonic acid | 10595-93-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 有机膦酸及其衍生物
• 英文名称: (fluoromethylene)bisphosphonic acid
• 英文别名: (monofluoromethylene)diphosphonic acid；Methanefluorodiphosphonate；[fluoro(phosphono)methyl]phosphonic acid
• CAS: 10595-93-4
• 化学式: CH₅FO₆P₂
• 分子量: 193.993
• InChiKey: ORTLAIHEWHWRPQ-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  162-163 °C
• 沸点：
  547.7±60.0 °C(Predicted)
• 密度：
  2.175±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.8
• 重原子数：
  10
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  115
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  7

安全信息

• 海关编码：
  2931900090

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  三正丁胺 、 (fluoromethylene)bisphosphonic acid 以 乙醇 、 水 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 (fluoromethylene)diphosphonic acid bis(tributylammonium) salt
  参考文献：
  名称：

  8-oxo-dGTP 及其 β,γ-CH2-、β,γ-CHF- 和 β,γ-CF2- 类似物的合成

  摘要：

  已经由8 - oxo - dGMP 2通过它的吗啉 5'-氨基磷酸酯14或优选地，它的N-甲基咪唑 5'-氨基磷酸酯15与适当的双膦酸的三正丁基铵盐11-13。后一种方法还提供了一个方便的新途径3。类似物4 – 6可能可用作3在异常DNA复制和修复中的作用的机械探针。

  DOI：

  10.1016/j.tetlet.2021.152890
• 作为产物：
  描述：

  四乙基氟代亚甲基二磷酸酯 在 三甲基溴硅烷 作用下， 反应 72.0h， 以98%的产率得到(fluoromethylene)bisphosphonic acid
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of a potent inhibitor of HIV reverse transcriptase

  摘要：

  新合成的 Pβ,-Pγ-二氟亚甲基二膦酸盐类似物 2 是一种强效的艾滋病毒逆转录酶抑制剂；与 AZTTP 和其他核苷三磷酸酯相比，它在胎儿血清中去磷酸化的稳定性也大大增强。

  DOI：

  10.1039/a801127c

文献信息

• Nucleotide mimics and their prodrugs
  申请人：——

  公开号：US20040059104A1

  公开（公告）日：2004-03-25

  The present invention relates to nucleoside diphosphate mimics and nucleoside triphosphate mimics, which contain diphosphate or triphosphate moiety mimics and optionally sugar-modifications and/or base-modifications. The nucleotide mimics of the present invention, in a form of a pharmaceutically acceptable salt, a pharmaceutically acceptable prodrug, or a pharmaceutical formulation, are useful as antiviral, antimicrobial, and anticancer agents. The present invention provides a method for the treatment of viral infections, microbial infections, and proliferative disorders. The present invention also relates to pharmaceutical compositions comprising the compounds of the present invention optionally in combination with other pharmaceutically active agents.

  本发明涉及核苷二磷酸模拟物和核苷三磷酸模拟物，其中包含二磷酸或三磷酸基团模拟物，以及可选的糖修饰和/或碱基修饰。本发明的核苷酸模拟物，以药学上可接受的盐、药学上可接受的前药或药物配方的形式，可用作抗病毒、抗微生物和抗癌剂。本发明提供了一种治疗病毒感染、微生物感染和增生性疾病的方法。本发明还涉及包含本发明化合物的药物组合物，可选地与其他药理活性剂结合。
• Completing the β,γ-CXY-dNTP Stereochemical Probe Toolkit: Synthetic Access to the dCTP Diastereomers and ³¹P and ¹⁹F NMR Correlations with Absolute Configurations
  作者：Pouya Haratipour、Corinne Minard、Maryam Nakhjiri、Amirsoheil Negahbani、Brian T. Chamberlain、Jorge Osuna、Thomas G. Upton、Michelle Zhao、Boris A. Kashemirov、Charles E. McKenna

  DOI：10.1021/acs.joc.0c01204

  日期：2020.11.20

  documented here, but the reductive deprotection step is not compatible with dCTP or the bromo substituent in β,γ-CHBr-dNTP analogues. To complete assembly of the toolkit, we describe an alternative synthetic strategy featuring ethylbenzylamine or phenylglycine-derived chiral BP synthons incorporating a photolabile protecting group. After acid-catalyzed removal of the (R)-(+)-α-ethylbenzylamine auxiliary

  β，γ-氧被一个CXY基团模拟的核苷5'-三磷酸（dNTP）类似物（β，γ-CXY-dNTPs）提供了有关DNA聚合酶催化和保真度的信息。CXY立体化学的定义对于阐明精确的结合模式非常重要。我们之前曾报道过通过P，C-二吗啉酰胺CHCl（6a，6b）和CHF（7a，7b）双膦酸酯制备的（R）-和（S）-β，γ-CHX-dGTP非对映异构体（X = F，Cl）（BPs）配备（R）-扁桃酸作为手性助剂，并使用H 2 / Pd进行最终脱保护。该方法还提供了β，γ-CHCl-dTTP（11a，11b），β，γ-CHF（12a，12b）和β，γ-CHCl（13a，13b）dATP非对映异构体，但还原脱保护步骤与dCTP或β，γ-CHBr中的溴取代基不相容-dNTP类似物。为了完成该工具包的组装，我们描述了一种替代合成策略，其特征在于乙基苄胺或苯基甘氨酸衍生的手性BP合成子并入了对光不稳定的保护基团。
• (<i>R</i>)-β,γ-Fluoromethylene-dGTP-DNA Ternary Complex with DNA Polymerase β
  作者：Charles E. McKenna、Boris A. Kashemirov、Thomas G. Upton、Vinod K. Batra、Myron F. Goodman、Lars C. Pedersen、William A. Beard、Samuel H. Wilson

  DOI：10.1021/ja072127v

  日期：2007.12.1

  oncogenesis. The conjugation of dGMP 5‘-morpholidate with a tetrabutylammonium salt of (fluoromethylene)bisphosphonic acid (6b, prepared like its difluoro analogue 7b via fluorination of tetraisopropyl methylenebisphosphonate carbanion with Selectfluor) gives a 1:1 mixture of 3 and 4 (by 19F NMR, pH 10). The β,γ-CF2 (2) and β,γ-CH2 (1) dGTP analogues were also synthesized. Crystallization from a solution

  核苷酸的 β,γ-氟亚甲基类似物通常被认为是 DNA 聚合酶天然底物的有用模拟物，但尚无定义其活性位点相互作用的直接结构证据。此外，尚未探索引入新手性中心（CHF 碳）的效果。我们在此报告了 dGTP 的非对映异构 β,γ-CHF 类似物（R，3；S，4）与 DNA pol β 活性位点相互作用的结构研究，该修复酶在碱基切除修复 (BER) 中起重要作用和肿瘤发生。dGMP 5'-吗啉酸盐与（氟亚甲基）双膦酸的四丁基铵盐（6b，通过四异丙基亚甲基双膦酸碳负离子与 Selectfluor 氟化制备，如其二氟类似物 7b 一样制备）的缀合得到 3 和 4 的 1:1 混合物（通过 19F NMR , pH 值 10)。还合成了 β,γ-CF2 (2) 和 β,γ-CH2 (1) dGTP 类似物。从含有 3 + 4 和预先形成的 DNA pol β 复合物的溶液中结晶...
• Transition State in DNA Polymerase β Catalysis: Rate-Limiting Chemistry Altered by Base-Pair Configuration
  作者：Keriann Oertell、Brian T. Chamberlain、Yue Wu、Elena Ferri、Boris A. Kashemirov、William A. Beard、Samuel H. Wilson、Charles E. McKenna、Myron F. Goodman

  DOI：10.1021/bi500101z

  日期：2014.3.25

  G•T). Brønsted plots of the catalytic rate constant (log(kpol)) versus pKa4 for the leaving group exhibit linear free energy relationships (LFERs) with negative slopes ranging from −0.6 to −2.0, consistent with chemical rate-determining transition-states in which the active-site adjusts to charge-stabilization demand during chemistry depending on base-pair configuration. The Brønsted slopes as well as

  对具有焦磷酸盐模拟 β,γ-pCXYp 离去基团和可变 X 和 Y 取代的 dNTP 类似物的动力学研究揭示了 DNA 聚合酶 β 的化学过渡态能量的显着差异，这取决于碱基配对构型的所有方面，包括传入的 dNTP 是嘌呤或嘧啶，并且碱基配对是正确的（T•A 和 G•C）还是错误的（T•G 和 G•T）。催化速率常数 (log( k pol )) 与 p K a4 的Brønsted 图离去基团表现出线性自由能关系 (LFER)，负斜率范围为 -0.6 至 -2.0，与化学速率决定过渡态一致，其中活性位点在化学过程中根据基数调整电荷稳定需求配对配置。Brønsted 斜率和截距显着不同，并提供了第一个直接证据表明酶-引物-模板复合物对 dNTP 碱基的识别触发了活性位点催化区域的构象变化，从而显着改变了决定速率的化学步骤.
• Synthesis and polymerase incorporation of β,γ-modified α-l-threofuranosyl thymine triphosphate mimics
  作者：Zhe Chen、Kirsten N. Meek、Alexandra E. Rangel、Jennifer M. Heemstra

  DOI：10.1016/j.bmcl.2016.07.008

  日期：2016.8

  Three beta,gamma-modified alpha-l-threofuranosyl nucleoside triphosphates were synthesized. The beta,gamma-modified tTTPs undergo a single incorporation event with HIV RT but undergo multiple incorporations to form full-length product with engineered thermophilic polymerases.

  合成了三种β，γ-修饰的α-1-苏呋喃糖基核苷三磷酸酯。β，γ-修饰的TT Ps与HIV RT经历了一次掺入事件，但经过多次掺入以与工程化的嗜热性聚合酶形成全长产物。