N-芴甲氧羰基-(1S,2S)-2-氨基环己烷羧酸 | 312965-07-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 中文名称: N-芴甲氧羰基-(1S,2S)-2-氨基环己烷羧酸
• 中文别名: FMOC-(1S,2S)-2-氨基环己烷羧酸
• 英文名称: (S,S)-trans-N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-2-aminocyclohexanecarboxylic acid
• 英文别名: Fmoc-(S,S)-trans-2-aminocyclohexanecarboxylic acid；Fmoc-(1S,2S)-2-aminocyclohexane carboxylic acid；Fmoc-(1S,2S)-2-aminocyclohexanecarboxylic acid；(1S,2S)-2-{[(9H-fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl]amino}cyclohexane-carboxylic acid；(1S,2S)-2-((((9H-Fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)cyclohexanecarboxylic acid；(1S,2S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)cyclohexane-1-carboxylic acid
• CAS: 312965-07-4
• 化学式: C₂₂H₂₃NO₄
• 分子量: 365.429
• InChiKey: NZMNDTGOODAUNI-ICSRJNTNSA-N

物化性质

• 沸点：
  596.9±39.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.29±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.6
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  75.6
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

安全信息

• 危险等级：
  IRRITANT
• 危险性防范说明：
  P280,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H317,H319
• 储存条件：
  2-8°C，干燥

SDS

MSDS英文版

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-芴甲氧羰基-(1S,2S)-2-氨基环己烷羧酸 在 sodium tetrahydroborate 、 氯甲酸异丙酯 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 、 甲苯 为溶剂， 反应 6.17h， 以78%的产率得到9H-fluoren-9-ylmethyl [(1S,2S)-2-(hydroxymethyl)cyclohexyl]carbamate
  参考文献：
  名称：

  Novel Compounds

  摘要：

  公式I的化合物，或其药用盐：其中X、R1、R2和R3如规范中定义的那样，以及包括这些化合物的盐和药物组合物已经准备好。它们在治疗中很有用，特别是在疼痛管理中。

  公开号：

  US20070259888A1
• 作为产物：
  描述：

  (1S,2S)-2-氨基甲酰基环己烷羧酸 在 sodium hydroxide 、 [双(三氟乙酰氧基)碘]苯 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 、 乙腈 为溶剂， 生成 N-芴甲氧羰基-(1S,2S)-2-氨基环己烷羧酸
  参考文献：
  名称：

  对映体纯 β-氨基酸：方便获得反式-2-氨基环己烷甲酸的两种对映体

  摘要：

  对映体纯的反式-2-氨基环己烷甲酸是螺旋β-肽的重要组成部分。我们在这里报告说，这种氨基酸可以通过简单的一锅法从反式环己烷-1,2-二羧酸以良好的收率获得，包括环化成酸酐，用氨形成酰胺，以及随后的霍夫曼型降解苯碘（III）双（三氟乙酸盐）（PIFA）作为氧化剂。通过分别用 Fmoc-OSu 和 BOC2O 处理氨基酸获得 N-Fmoc-和 N-BOC-保护的衍生物。N-BOC 衍生物可以通过直接从反式-环己烷-1,2-二羧酸到 N-BOC 保护的氨基酸的一锅法制备，以更高的总产率制备。起始反式 1 的两种对映异构体，通过使用（R）-或（S）-1-苯乙胺分离市售的外消旋反式-1,2-环己烷二甲酸，可以容易地大量获得2-环己烷二甲酸。从 (R)-1-苯乙胺获得的非对映异构纯盐的 X 射线晶体学显示，二酸组分的构型是 (1R,2R)，而不是文献中报道的 (1S,2S)。(© Wiley-VCH Verlag

  DOI：

  10.1002/1099-0690(200209)2002:17<2948::aid-ejoc2948>3.0.co;2-e

文献信息

• Unwanted hydrolysis or α/β-peptide bond formation: how long should the rate-limiting coupling step take?
  作者：Viktória Goldschmidt Gőz、Adrienn Nagy、Viktor Farkas、Ernő Keszei、András Perczel

  DOI：10.1039/c9ra06124j

  日期：——

  branched amino acids (Ile, Thr) with slowly hydrolyzing (6 < t < 24 h) propensities, and (iii) non-hydrolyzing ones, such as the hard-to-couple β-amino acids or β-sugar amino acid derivatives, stable for longer times (t > 24 h) in solution. The current insight into the kinetics of this key hydrolysis side reaction serves as a guide to optimize the coupling conditions of α- and β-amino acids, thereby

  如今，在固相肽合成 (SPPS) 中，无论是手动、自动、连续流动还是微波辅助，与各种偶联试剂的反应都是通过原位活性酯形成进行的。在本研究中，通过使用用于 α-和 β-氨基酸的常见 PyBOP/DIEA 和 HOBt/DIC 偶联试剂，使用时间分辨1 H NMR研究了这些关键活性酯的形成和稳定性。与酰胺键形成平行，研究了 α/β-活性酯的水解，这是一个相当大的功效限制因素的副反应。根据活性酯的化学性质/组成，确定了三种氨基酸类别：（i）快速水解的（t< 6 h) 具有较小 (Ala) 甚至更长的侧链 (Arg) 具有较大的保护基团；(ii) 具有缓慢水解 (6 < t < 24 h) 倾向的支链氨基酸 (Ile, Thr) ，以及 (iii) 非水解氨基酸，例如难以偶联的 β-氨基酸或 β-糖氨基酸衍生物，在溶液中稳定较长时间 ( t > 24 h)。目前对这一关键水解副反应动力学的深入了解可作为优化
• Asymmetric Synthesis of a New Helix-Forming β-Amino Acid: trans-4-Aminopiperidine-3-carboxylic Acid
  作者：Marina Schinnerl、Justin K. Murray、Joseph M. Langenhan、Samuel H. Gellman

  DOI：10.1002/ejoc.200390112

  日期：2003.2

  We report a synthesis of a protected derivative of trans-4-aminopiperidine-3-carboxylic acid (APiC). The route provides either enantiomer. All intermediates are purified by crystallization, and large-scale preparation is therefore possible. An analogous route provides either enantiomer of trans-2-aminocyclohexanecarboxylic acid (ACHC). We have previously shown that β-peptide oligomers containing ACHC

  我们报告了一种受保护的反式-4-氨基哌啶-3-羧酸 (APiC) 衍生物的合成。该路线提供任一对映异构体。所有中间体均通过结晶纯化，因此可以大规模制备。类似的路线提供了反式-2-氨基环己烷甲酸 (ACHC) 的任一对映异构体。我们之前已经表明，含有 ACHC 的 β-肽寡聚体采用由 14 元 C=O(i)...H-N(i-2) 氢键（“14-螺旋”）定义的螺旋构象。在这里，我们表明可以将 APiC 残基并入 14 螺旋中。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2003)
• Iterative Structure-Based Optimization of Short Peptides Targeting the Bacterial Sliding Clamp
  作者：Clément Monsarrat、Guillaume Compain、Christophe André、Sylvain Engilberge、Isabelle Martiel、Vincent Oliéric、Philippe Wolff、Karl Brillet、Marie Landolfo、Cyrielle Silva da Veiga、Jérôme Wagner、Gilles Guichard、Dominique Y. Burnouf

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.1c00918

  日期：2021.12.9

  The bacterial DNA sliding clamp (SC), or replication processivity factor, is a promising target for the development of novel antibiotics. We report a structure–activity relationship study of a new series of peptides interacting within the Escherichia coli SC (EcSC) binding pocket. Various modifications were explored including N-alkylation of the peptide bonds, extension of the N-terminal moiety, and

  细菌 DNA 滑动钳 (SC) 或复制持续性因子是开发新型抗生素的有希望的目标。我们报告了在大肠杆菌SC ( Ec SC) 结合口袋内相互作用的一系列新肽的结构-活性关系研究。探索了各种修饰，包括肽键的 N-烷基化、N-末端部分的延伸以及在 C-末端引入疏水性和受约束的残基。在每个类别中，鉴定出增加对Ec SC 的亲和力的单一修饰。与具有K d的亲本肽相比，这些修饰的组合在几种情况下产生了显着增加的亲和力在 30-80 nM 的范围内。11 种肽/ Ec SC 共晶体的 X 射线结构分析揭示了肽-蛋白质界面处的新相互作用（即堆叠相互作用、氢键和疏水接触），这可以解释改进的结合。还发现最好的粘合剂中的几种化合物在抑制 SC 依赖性 DNA 合成方面更有效。
• Antifungal Activity of 14-Helical β-Peptides against Planktonic Cells and Biofilms of Candida Species
  作者：Namrata Raman、Myung-Ryul Lee、David Lynn、Sean Palecek

  DOI：10.3390/ph8030483

  日期：——

  Candida albicans is the most prevalent cause of fungal infections and treatment is further complicated by the formation of drug resistant biofilms, often on the surfaces of implanted medical devices. In recent years, the incidence of fungal infections by other pathogenic Candida species such as C. glabrata, C. parapsilosis and C. tropicalis has increased. Amphiphilic, helical β-peptide structural mimetics of natural antimicrobial α-peptides have been shown to exhibit specific planktonic antifungal and anti-biofilm formation activity against C. albicans in vitro. Here, we demonstrate that β-peptides are also active against clinically isolated and drug resistant strains of C. albicans and against other opportunistic Candida spp. Different Candida species were susceptible to β-peptides to varying degrees, with C. tropicalis being the most and C. glabrata being the least susceptible. β-peptide hydrophobicity directly correlated with antifungal activity against all the Candida clinical strains and species tested. While β-peptides were largely ineffective at disrupting existing Candida biofilms, hydrophobic β-peptides were able to prevent the formation of C. albicans, C. glabrata, C. parapsilosis and C. tropicalis biofilms. The broad-spectrum antifungal activity of β-peptides against planktonic cells and in preventing biofilm formation suggests the promise of this class of molecules as therapeutics.

  白色念珠菌是真菌感染最常见的病因，耐药性生物膜的形成（通常在植入式医疗器械表面）使治疗变得更加复杂。近年来，由其他致病性念珠菌（如光滑念珠菌、副丝状念珠菌和热带念珠菌）引起的真菌感染发病率有所上升。天然抗菌剂 α 肽的两亲螺旋 β 肽结构模拟物在体外对白念珠菌表现出特异性浮游抗真菌和抗生物膜形成活性。在这里，我们证明了 β 肽对临床分离的白念珠菌耐药菌株和其他机会性念珠菌属也有活性。不同的念珠菌属对 β 肽有不同程度的易感性，其中热带念珠菌的易感性最高，格拉布氏念珠菌的易感性最低。β肽的疏水性与对所有受试念珠菌临床菌株和菌种的抗真菌活性直接相关。虽然 β 肽对破坏现有的念珠菌生物膜基本无效，但疏水性 β 肽却能阻止白念珠菌、草绿色念珠菌、副丝状念珠菌和热带念珠菌生物膜的形成。β肽对浮游细胞和防止生物膜形成的广谱抗真菌活性表明，这类分子有望成为治疗药物。
• Antifungal Activity from 14-Helical β-Peptides
  作者：Amy J. Karlsson、William C. Pomerantz、Bernard Weisblum、Samuel H. Gellman、Sean P. Palecek

  DOI：10.1021/ja064630y

  日期：2006.10.1

  We have discovered that short β-peptides (9 or 10 residues) designed to adopt globally amphiphilic helical conformations display significant antifungal activity. The most promising β-peptides cause little lysis of human red blood cells at concentrations that kill Candida albicans, a common human fungal pathogen. Since fungi are eukaryotes, discrimination between fungal and human cells is a significant

  我们发现设计为采用全局两亲螺旋构象的短 β-肽（9 或 10 个残基）显示出显着的抗真菌活性。最有希望的 β-肽在杀死白色念珠菌（一种常见的人类真菌病原体）的浓度下几乎不会引起人类红细胞的裂解。由于真菌是真核生物，因此区分真菌细胞和人类细胞是一项重大发现。我们的 β-肽在模拟生理离子强度的测定条件下具有活性；相比之下，在这些条件下，形成α-螺旋的宿主防御α-肽对白色念珠菌无活性。