[(2R,3S,5R)-5-(2-氨基-6,8-二氧代-3,7-二氢嘌呤-9-基)-3-羟基四氢呋喃-2-基]甲基(羟基-膦酰氧基磷酰)磷酸氢酯 | 139307-94-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷酸
• 中文名称: [(2R,3S,5R)-5-(2-氨基-6,8-二氧代-3,7-二氢嘌呤-9-基)-3-羟基四氢呋喃-2-基]甲基(羟基-膦酰氧基磷酰)磷酸氢酯
• 中文别名: 2,2'-联吡啶-α,α'-二氨基肥酸铂(II)
• 英文名称: 8-oxo-dGTP
• 英文别名: 8-oxo-2'-deoxyguanosine-5'-triphosphate；[[(2R,3S,5R)-5-(2-amino-6,8-dioxo-1,7-dihydropurin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] phosphono hydrogen phosphate
• CAS: 139307-94-1
• 化学式: C₁₀H₁₆N₅O₁₄P₃
• 分子量: 523.183
• InChiKey: BUZOGVVQWCXXDP-VPENINKCSA-N

物化性质

• 密度：
  2.75±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -6.4
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  289
• 氢给体数：
  8
• 氢受体数：
  15

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [(2R,3S,5R)-5-(2-氨基-6,8-二氧代-3,7-二氢嘌呤-9-基)-3-羟基四氢呋喃-2-基]甲基(羟基-膦酰氧基磷酰)磷酸氢酯 在 magnesium chloride MutT pyrophosphohydrolase 作用下， 以 various solvent(s) 为溶剂， 生成 8-oxo-2'-deoxyguanosine-5'-monophosphate
  参考文献：
  名称：

  MutT 酶-Mg2+-8-oxo-dGMP 复合物的溶液结构、诱变和 NH 交换研究

  摘要：

  摘要 来自大肠杆菌的 MutT 焦磷酸水解酶（129 个残基）催化三磷酸核苷 (NTP) 的水解，包括 8-oxo-dGTP，通过在 Pβ 上的取代，产生 NMP 和焦磷酸。产物 8-oxo-dGMP 是一种异常紧密结合的缓慢交换抑制剂，KD=52 nM，（ΔG°=−9.8 kcal/mol），比 dGMP 的结合（ΔG°= −3.7 kcal/mol)。尽管不利的 -TΔS°结合（+22 kcal/mol），但对 8-oxo-dGMP 的更高亲和力源于更有利的 ΔH 结合（-32 kcal/mol）。MutT-Mg2+-8-oxo-dGMP 复合物的溶液结构显示出狭窄的疏水性核苷酸结合裂缝，在少数极性残基中具有 Asn-119 和 Arg-78。N119A、N119D、R78K 和 R78A 单突变，以及 R78K+N119A 双突变都显示出基本完整的活性位点，基于 dGTP 水解动力学参数和

  DOI：

  10.1016/j.molstruc.2003.12.060
• 作为产物：
  描述：

  2'-脱氧-8-(苯基甲氧基)-鸟苷 在 三丁基焦磷酸铵 、 亚磷酸三乙酯 、 三氯氧磷 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以45%的产率得到[(2R,3S,5R)-5-(2-氨基-6,8-二氧代-3,7-二氢嘌呤-9-基)-3-羟基四氢呋喃-2-基]甲基(羟基-膦酰氧基磷酰)磷酸氢酯
  参考文献：
  名称：

  A Serendipitous Synthesis of 8-Dimsyl-2′-deoxyguanosine

  摘要：

  A serendipitous synthesis of 8-dimsyl-dG (2) has been achieved along with the known 8-benzyloxy-dG (3) in a nucleophilic substitution reaction of 8-bromo-dG (1) with in situ generated dimsyl and benzyloxy sodium. Compound 3 was directly converted into the mutagenic oxidative DNA damage product, 8-oxo-dGTP (4).

  DOI：

  10.1080/15257779908041545

文献信息

• [EN] PYRIMIDINE DERIVATIVES FOR USE IN THE TREATMENT OF CANCER<br/>[FR] DÉRIVÉS DE PYRIMIDINE UTILISÉS DANS LE TRAITEMENT DU CANCER
  申请人：MERCK PATENT GMBH

  公开号：WO2016128140A1

  公开（公告）日：2016-08-18

  Compounds of Formula I or II in which R1, X1 and X2 have the meanings indicated in claim 1, are MTH1 inhibitors and can be employed, inter alia, in the treatment of cancer.

  具有公式I或II的化合物，其中R1、X1和X2具有权利要求1中所示的含义，是MTH1抑制剂，可以用于治疗癌症。
• Synthesis of γ-<i>N</i>-modified 8-oxo-2’-deoxyguanosine triphosphate and its characterization
  作者：Ninticha Thavoncharoensub、Kento Maruyama、Choon Han Heh、Kok Hoong Leong、Hui Shi、Yoshiharu Shigematsu、Shigeki Sasaki、Yosuke Taniguchi

  DOI：10.1080/15257770.2019.1586919

  日期：2019.8.3

  incorporated into the duplex DNA during replication processes by the DNA polymerase, and thus the repair enzyme removes oxodGTP from the nucleotide pools in living cells. On the other hand, the γ-modified triphosphates show interesting properties for use as biological tools. Therefore, the γ-N-pyrenylalkyl-oxodGTP derivatives were synthesized and their effect on the enzymatic reactions were evaluated. The γ-N

  8-OxodGTP是由dGTP和活性氧与被认为是诱变核苷酸之间的反应产生的。它可以在复制过程中通过DNA聚合酶掺入双链体DNA中，因此修复酶从活细胞中的核苷酸库中去除了oxodGTP。另一方面，γ-修饰的三磷酸酯显示出用作生物学工具的有趣性质。因此，合成了γ- N-苯甲基烷基-oxodGTP衍生物，并评价了它们对酶促反应的影响。发现γ- N-苯甲基甲基-oxodGTP与oxodGTP一样被DNA聚合酶所接受，但是显示出对人oxodGTPase的竞争性抑制特性。
• Oxidation of 5′-dGMP, 5′-dGDP, and 5′-dGTP by a platinum(IV) complex
  作者：Ioannis Kipouros、Sebastian Matias Fica-Contreras、Gregory Joon Kee Bowe、Sunhee Choi

  DOI：10.1007/s00775-015-1312-0

  日期：2015.12

  that a Pt(IV) complex, [Pt(IV)(dach)Cl4] [trans-d,l-1,2-diaminocyclohexanetetrachloroplatinum(IV)] binds to the N7 of 5'-dGMP (deoxyguanosine-5'-monophosphate) at a relatively fast rate and oxidizes it to 8-oxo-5'-dGMP. Here, we further studied the kinetics of the oxidation of 5'-dGMP by the Pt(IV) complex. The electron transfer rate constants between 5'-dGMP and Pt(IV) in [H8-5'-dGMP-Pt(IV)] and [D8-5'-dGMP-Pt(IV)]

  我们之前曾报道过，Pt（IV）复合物[Pt（IV）（dach）Cl4] [反式-d，1-1,2-二氨基环己烷四氯铂（IV）]与5'-dGMP的N7（脱氧鸟苷-5 '-单磷酸酯）以相对较快的速度氧化为8-oxo-5'-dGMP。在这里，我们进一步研究了Pt（IV）配合物氧化5'-dGMP的动力学。[H8-5'-dGMP-Pt（IV）]和[D8-5'-dGMP-Pt（IV）]中5'-dGMP和Pt（IV）之间的电子传输速率常数相似，给出的值很小动力学同位素效应（KIE：1.2±0.2）。这个小的KIE表示[H8-5'-dGMP-Pt（IV）]中H8的去质子化不参与鸟嘌呤（G）和Pt（IV）之间电子转移的速率确定步骤。我们还研究了5'-dGDP（脱氧鸟苷-5'-二磷酸）和5'-dGTP（脱氧鸟苷-5'）的反应 （三磷酸）与Pt（IV）配合物。我们的结果表明，[Pt（IV）（dach）Cl4]通过
• NOVEL ANTIBODY CONJUGATES AND USES THEREOF
  申请人：STEMCENTRX, INC.

  公开号：US20160015828A1

  公开（公告）日：2016-01-21

  Provided are novel antibody drug conjugates (ADCs), and methods of using such ADCs to treat proliferative disorders.

  提供了新型抗体药物联合物（ADCs），以及使用这种ADCs治疗增殖性疾病的方法。
• Methods for determining a risk to develop cancer
  申请人：YEDA RESEARCH AND DEVELOPMENT CO., LTD.

  公开号：EP2308994A1

  公开（公告）日：2011-04-13

  The present invention concerns a method of determining a risk of a subject to develop cancer, the method comprising determining a level of catalytic activity of a DNA repair enzyme in a biological sample of the subject, wherein said DNA repair enzyme is selected from the group consisting of 8-oxoguanine DNA glycosylase (OGG1), AP endonuclease1 (APE1), methylpurine DNA glycosylase (MFG), uracil DNA glycosylase1 (UNG1), uracil DNA glycosylase2 (UNG2), SMUG1, MBD4, mismatch-specific thymine/uracil glycosylase (TDG), enodonuclease III (NTH1), adenine-specific mismatch DNA glycosylase (MYH), 8-oxo-GTPase/8-oxodGTPase (MTH1), dUTPase (DUT), AP endonuclease2 (APE2), deoxyribose phosphate lyase (POLB) and wherein a level of said activity below a predetermined value is indicative of an increased risk of the subject to develop said cancer.

  本发明涉及一种确定受试者罹患癌症风险的方法，该方法包括确定受试者生物样本中DNA修复酶的催化活性水平，其中所述DNA修复酶选自由8-氧鸟嘌呤DNA糖基化酶(OGG1)、AP内切酶1(APE1)、甲基嘌呤DNA糖基化酶(MFG)、尿嘧啶DNA糖基化酶1(UNG1)、尿嘧啶DNA糖基化酶2(UNG2)、SMUG1、MBD4、错配特异性胸腺嘧啶/尿嘧啶糖基化酶(TDG)、烯核酸内切酶III(NDG)组成的组、尿嘧啶 DNA 糖基化酶 2 (UNG2)、SMUG1、MBD4、错配特异性胸腺嘧啶/尿嘧啶糖基化酶 (TDG)、烯核诱导酶 III (NTH1)、腺嘌呤特异性错配 DNA 糖基化酶 (MYH)、8-氧代-GTP 酶/8-氧代-GTP 酶 (MTH1)、dUTPase (DUT)、AP 内切酶 2 (APE2)、脱氧核糖磷酸裂解酶 (POLB)，其中所述活性水平低于预定值表明受试者罹患所述癌症的风险增加。