(2E)-3-[2-tert-butyl-1-(cyclopropylmethyl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-imidazo[4,5-c]pyridin-5-yl]-1-(2-hydroxyphenyl)prop-2-en-1-one

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并吡啶类
• 英文名称: (2E)-3-[2-tert-butyl-1-(cyclopropylmethyl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-imidazo[4,5-c]pyridin-5-yl]-1-(2-hydroxyphenyl)prop-2-en-1-one
• 英文别名: (E)-3-[2-tert-butyl-1-(cyclopropylmethyl)-6,7-dihydro-4H-imidazo[4,5-c]pyridin-5-yl]-1-(2-hydroxyphenyl)prop-2-en-1-one
• 化学式: C₂₃H₂₉N₃O₂
• 分子量: 379.502
• InChiKey: BBJYPSGAHQUZGW-ACCUITESSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.2
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.48
• 拓扑面积：
  58.4
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  色酮-3-甲酸 、 2-Tert-butyl-1-(cyclopropylmethyl)-4,5,6,7-tetrahydroimidazo[4,5-c]pyridine 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 乙醇 、 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 16.0h， 以6.7 mg的产率得到(2E)-3-[2-tert-butyl-1-(cyclopropylmethyl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-imidazo[4,5-c]pyridin-5-yl]-1-(2-hydroxyphenyl)prop-2-en-1-one
  参考文献：
  名称：

  通过优化片段命中鉴定VIII族溴结构域的化学探针。

  摘要：

  在选定的组蛋白赖氨酸残基上的染色质的乙酰基翻译后修饰是通过与溴结构域阅读器模块的乙酰基赖氨酸特异性相互作用来解释的。在这里，我们报告发现一种有效的，与乙酰赖氨酸竞争的，具有细胞活性的抑制剂PFI-3，该抑制剂与某些VIII族溴结构域结合，同时显示出显着的，更广泛的溴结构域家族选择性。PFI-3对VIII族的高特异性是通过酚类头基的新型溴结构域结合模式实现的，该模式导致水分子异常移位，而水分子通常被迄今报道的大多数其他溴结构域抑制剂保留。详细描述了从最初的片段筛选击中导致PFI-3的药物化学程序，还报道了具有不同的VIII族溴结构域选择性分布的其他类似物。我们还描述了作为化学探针的PFI-3的完整药理特性，以及脂肪细胞和成肌细胞分化试验的表型数据。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.6b00012

文献信息

• Identification of a Chemical Probe for Family VIII Bromodomains through Optimization of a Fragment Hit
  作者：Brian S. Gerstenberger、John D. Trzupek、Cynthia Tallant、Oleg Fedorov、Panagis Filippakopoulos、Paul E. Brennan、Vita Fedele、Sarah Martin、Sarah Picaud、Catherine Rogers、Mihir Parikh、Alexandria Taylor、Brian Samas、Alison O’Mahony、Ellen Berg、Gabriel Pallares、Adam D. Torrey、Daniel K. Treiber、Ivan J. Samardjiev、Brian T. Nasipak、Teresita Padilla-Benavides、Qiong Wu、Anthony N. Imbalzano、Jeffrey A. Nickerson、Mark E. Bunnage、Susanne Müller、Stefan Knapp、Dafydd R. Owen

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.6b00012

  日期：2016.5.26

  modules. Here we report the discovery of the potent, acetyl-lysine-competitive, and cell active inhibitor PFI-3 that binds to certain family VIII bromodomains while displaying significant, broader bromodomain family selectivity. The high specificity of PFI-3 for family VIII was achieved through a novel bromodomain binding mode of a phenolic headgroup that led to the unusual displacement of water molecules

  在选定的组蛋白赖氨酸残基上的染色质的乙酰基翻译后修饰是通过与溴结构域阅读器模块的乙酰基赖氨酸特异性相互作用来解释的。在这里，我们报告发现一种有效的，与乙酰赖氨酸竞争的，具有细胞活性的抑制剂PFI-3，该抑制剂与某些VIII族溴结构域结合，同时显示出显着的，更广泛的溴结构域家族选择性。PFI-3对VIII族的高特异性是通过酚类头基的新型溴结构域结合模式实现的，该模式导致水分子异常移位，而水分子通常被迄今报道的大多数其他溴结构域抑制剂保留。详细描述了从最初的片段筛选击中导致PFI-3的药物化学程序，还报道了具有不同的VIII族溴结构域选择性分布的其他类似物。我们还描述了作为化学探针的PFI-3的完整药理特性，以及脂肪细胞和成肌细胞分化试验的表型数据。