Cytoplasmic dyneins are AAA (ATPase associated with diverse cellular activities) motor proteins responsible for microtubule minus-end-directed intracellular transport. Dynein's unusually large size, four distinct nucleotide-binding sites, and conformational dynamics pose challenges for the design of potent and selective chemical inhibitors. Here we use structural approaches to develop a model for the inhibition
细胞质动力蛋白是负责微管负端定向细胞内运输的 AAA(与多种细胞活动相关的
ATP 酶)运动蛋白。动力蛋白异常大的尺寸、四个不同的核苷酸结合位点和构象动力学对强效和选择性
化学抑制剂的设计提出了挑战。在这里,我们使用结构方法来开发一个模型来抑制特征良好的酿酒酵母以
吡唑并
嘧啶酮为基础的化合物构建动力蛋白。这些数据以及动力蛋白运动的功能分析和诱变研究表明,这些化合物通过与 AAA3 和 AAA4 结构域中的调节性
ATP 酶位点结合来抑制动力蛋白,而不是通过与动力蛋白在 AAA1 结构域中的主要催化位点相互作用。AAA3 和 AAA4 位点的双 Walker B 突变显着降低了酶活性,表明靶向这些调节结构域足以抑制动力蛋白。我们的研究结果揭示了如何设计
化学抑制剂来破坏动力蛋白 AAA 结构域的变构通讯。