几种机械无关的酶利用其底物非反应性
磷酰基的结合能来加速催化。
磷酸二价阴离子参与过渡态形成的证据来自底物的碎片反应,其中缺少
磷酰甲基的截短底物的反应被无机
亚磷酸酯激活。直到现在仍然未知的是
磷酸二价阴离子基团如何影响反应坐标上不同点的反应能量。1-脱氧-d-
木酮糖-5-
磷酸 (DXP) 还原异构酶 (DXR) 催化 DXP 异构化为 2-C-甲基-d-赤藓糖 4-
磷酸 (MEsP) 和随后的
NADPH 依赖性还原解决这一问题的独特机会。之前,我们已经报道了共价连接的
磷酸盐对 DXP 转换能量的影响。通过使用
化学合成的 MEsP 及其
磷酸截短的类似物 2-C-甲基-d-
甘油醛,目前的研究表明截断时动态屏障稳定性损失 6.1 kcal/mol,其中 4.4 kcal/mol 重新获得在
亚磷酸酯二价阴离子的存在下。在反应的中间阶段,
亚磷酸酯的活化作用伴随着其在活性位点内相互作用的明显收紧,表明
磷酸