(2R,3R,4S,5S)-2-(6-amino-2-ethynyl-9H-purin-9-yl)-5-(chloromethyl)tetrahydrofuran-3,4-diol

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 5'-脱氧核糖核苷
• 英文名称: (2R,3R,4S,5S)-2-(6-amino-2-ethynyl-9H-purin-9-yl)-5-(chloromethyl)tetrahydrofuran-3,4-diol
• 英文别名: 2-Ethynyl-5'-chloro-5'-deoxyadenosine；(2R,3R,4S,5S)-2-(6-amino-2-ethynylpurin-9-yl)-5-(chloromethyl)oxolane-3,4-diol
• 化学式: C₁₂H₁₂ClN₅O₃
• 分子量: 309.712
• InChiKey: HIZMKKNCGPHHFG-JJNLEZRASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  119
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R,3R,4S,5S)-2-(6-amino-2-ethynyl-9H-purin-9-yl)-5-(chloromethyl)tetrahydrofuran-3,4-diol 在 potassium fluoride 、 fluorinase 、 L-硒代蛋氨酸 作用下， 以 aq. phosphate buffer 、 水 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 5'-fluoro-5'-deoxy-2-ethynyladenosine
  参考文献：
  名称：

  A two-step fluorinase enzyme mediated ¹⁸F labelling of an RGD peptide for positron emission tomography

  摘要：

  使用氟酰化酶和“点击”反应，在水中（pH 7.8和37°C）对肽进行氟-18标记。

  DOI：

  10.1039/c5cc05013h
• 作为产物：
  描述：

  2',3',5'-三乙酰鸟苷 在 吡啶 、 bis-triphenylphosphine-palladium(II) chloride 、 copper(l) iodide 、 氯化亚砜 、 二碘甲烷 、 四乙基氯化铵 、 氨 、 碘 、 N,N-二甲基苯胺 、 三乙胺 、 三氯氧磷 、 亚硝酸异戊酯 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 44.92h， 生成 (2R,3R,4S,5S)-2-(6-amino-2-ethynyl-9H-purin-9-yl)-5-(chloromethyl)tetrahydrofuran-3,4-diol
  参考文献：
  名称：

  氟化酶底物特异性的局部耐受性使 RGD 肽在环境水条件下的“最后一步”18F 氟化成为可能

  摘要：

  据报道，一种生物共轭肽最后一步18 F 氟化的策略利用了氟化酶底物特异性的“致命弱点”。腺苷底物 C-2 位的乙炔官能团从活性位点投射到溶剂中。氟化酶催化 5'-氯脱氧-2-乙炔基腺苷 (ClDEA) 转卤化为 5'-氟脱氧-2-乙炔基腺苷 (FDEA)。从乙炔的末端延伸聚乙二醇接头允许将生物共轭货物呈现给酶以进行18 F 标记。该方法使用[ 18 ]的水溶液(H 2 18 O)F] 氟化物由回旋加速器产生，具有同位素标记正电子发射断层扫描 (PET) 选择的肽的能力。

  DOI：

  10.1002/anie.201403345

文献信息

• <i>S</i> ‐Adenosyl Methionine Cofactor Modifications Enhance the Biocatalytic Repertoire of Small Molecule <i>C</i> ‐Alkylation
  作者：Iain J. W. McKean、Joanna C. Sadler、Anibal Cuetos、Amina Frese、Luke D. Humphreys、Gideon Grogan、Paul A. Hoskisson、Glenn A. Burley

  DOI：10.1002/anie.201908681

  日期：2019.12.2

  A tandem enzymatic strategy to enhance the scope of C-alkylation of small molecules via the in situ formation of S-adenosyl methionine (SAM) cofactor analogues is described. A solvent-exposed channel present in the SAM-forming enzyme SalL tolerates 5'-chloro-5'-deoxyadenosine (ClDA) analogues modified at the 2-position of the adenine nucleobase. Coupling SalL-catalyzed cofactor production with C-(m)ethyl

  描述了通过原位形成S-腺苷甲硫氨酸（SAM）辅助因子类似物来增强小分子C-烷基化范围的串联酶促策略。SAM形成酶SalL中存在的溶剂暴露通道可耐受在腺嘌呤核苷碱基2位修饰的5'-氯-5'-脱氧腺苷（ClDA）类似物。SalL催化的辅因子生产与甲基转移酶（MTase）催化的C-（间）乙基转移至香豆素底物相结合，相对于使用缺乏核碱基修饰的辅因子获得的C-（间）乙基香豆素具有更高的收率和更大的底物范围。建立影响C-烷基化的分子决定簇为开发用于制备高价值小分子的后期酶促平台提供了基础。
• Probing the molecular determinants of fluorinase specificity
  作者：W. L. Yeo、X. Chew、D. J. Smith、K. P. Chan、H. Sun、H. Zhao、Y. H. Lim、E. L. Ang

  DOI：10.1039/c6cc09213f

  日期：——

  Probing the structural determinants of fluorinase enzyme specificity with 5′-chloro-5′-deoxyadenosine (5′-ClDA) analog substrates generated fluorinases with improved and novel activity.

  用5'-氯-5'-脱氧腺苷（5'-ClDA）类似底物探究氟化酶酶特异性的结构决定因素，产生了具有改进和新活性的氟化酶。
• A two-step fluorinase enzyme mediated ¹⁸F labelling of an RGD peptide for positron emission tomography
  作者：S. Thompson、M. Onega、S. Ashworth、I. N. Fleming、J. Passchier、D. O'Hagan

  DOI：10.1039/c5cc05013h

  日期：——

  Fluorine-18 radiolabelling of a peptide is conducted in water (pH 7.8 and 37 °C) using the fluorinase enzyme and a ‘click’ reaction.

  使用氟酰化酶和“点击”反应，在水中（pH 7.8和37°C）对肽进行氟-18标记。
• A Localized Tolerance in the Substrate Specificity of the Fluorinase Enzyme enables “Last-Step”¹⁸F Fluorination of a RGD Peptide under Ambient Aqueous Conditions
  作者：Stephen Thompson、Qingzhi Zhang、Mayca Onega、Stephen McMahon、Ian Fleming、Sharon Ashworth、James H. Naismith、Jan Passchier、David O'Hagan

  DOI：10.1002/anie.201403345

  日期：2014.8.18

  A strategy for last‐step 18F fluorination of bioconjugated peptides is reported that exploits an “Achilles heel” in the substrate specificity of the fluorinase enzyme. An acetylene functionality at the C‐2 position of the adenosine substrate projects from the active site into the solvent. The fluorinase catalyzes a transhalogenation of 5′‐chlorodeoxy‐2‐ethynyladenosine (ClDEA) to 5′‐fluorodeoxy‐2‐ethynyladenosine

  据报道，一种生物共轭肽最后一步18 F 氟化的策略利用了氟化酶底物特异性的“致命弱点”。腺苷底物 C-2 位的乙炔官能团从活性位点投射到溶剂中。氟化酶催化 5'-氯脱氧-2-乙炔基腺苷 (ClDEA) 转卤化为 5'-氟脱氧-2-乙炔基腺苷 (FDEA)。从乙炔的末端延伸聚乙二醇接头允许将生物共轭货物呈现给酶以进行18 F 标记。该方法使用[ 18 ]的水溶液(H 2 18 O)F] 氟化物由回旋加速器产生，具有同位素标记正电子发射断层扫描 (PET) 选择的肽的能力。
• A coupled chlorinase–fluorinase system with a high efficiency of<i>trans</i>-halogenation and a shared substrate tolerance
  作者：H. Sun、H. Zhao、E. L. Ang

  DOI：10.1039/c8cc04436h

  日期：——

  SAM-dependent chlorinases exhibited tolerance to the modification at the C-2 position of the adenosine substrate and acted cooperatively with fluorinase for rapidtrans-halogenation.

  SAM依赖的叶绿素酶对腺苷底物C-2位置的修饰表现出耐受性，并与氟酶协同作用，实现快速的反向卤代作用。